| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第9-23页 |
| 1.1 酶抑制药物研究概论 | 第9-11页 |
| 1.1.1 制药过程研究概况 | 第9页 |
| 1.1.2 酶抑制药物研发方法 | 第9-11页 |
| 1.2 药物设计研究方法 | 第11-17页 |
| 1.2.1 分子力场 | 第11-12页 |
| 1.2.2 分子对接 | 第12-13页 |
| 1.2.3 虚拟筛选 | 第13页 |
| 1.2.4 分子动力学模拟 | 第13-15页 |
| 1.2.5 结合自由能计算 | 第15-17页 |
| 1.3 PTP1B抑制剂的研究进展 | 第17-20页 |
| 1.3.1 概述 | 第17页 |
| 1.3.2 PTP1B的结构特征 | 第17-19页 |
| 1.3.3 PTP1B抑制剂的研究进展 | 第19-20页 |
| 1.4 选题意义及研究内容 | 第20-23页 |
| 1.4.1 选题意义 | 第20-21页 |
| 1.4.2 论文研究内容 | 第21-23页 |
| 2 Trivaric Acid及Nordivaricatic Acid与PTP1B结合模式的研究 | 第23-35页 |
| 2.1 引言 | 第23-24页 |
| 2.2 计算方法 | 第24-26页 |
| 2.2.1 蛋白质结构准备及分子对接 | 第24页 |
| 2.2.2 分子动力学模拟 | 第24-25页 |
| 2.2.3 MM/GBSA结合自由能计算与能量分解 | 第25-26页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第26-34页 |
| 2.3.1 MD模型稳定性分析 | 第26-28页 |
| 2.3.2 结合自由能分析 | 第28-30页 |
| 2.3.3 结合自由能残基分解 | 第30-32页 |
| 2.3.4 结合位点相互作用分析 | 第32-34页 |
| 2.4 本章小结 | 第34-35页 |
| 3 相似性搜索以及相似小分子与PTP1B结合模式的研究 | 第35-51页 |
| 3.1 引言 | 第35-36页 |
| 3.2 计算方法 | 第36-38页 |
| 3.2.1 计算分子结构准备及分子对接 | 第36页 |
| 3.2.2 分子动力学模拟 | 第36-37页 |
| 3.2.3 MM/PBSA结合自由能计算 | 第37-38页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第38-50页 |
| 3.3.1 相似性搜索结果 | 第38-40页 |
| 3.3.2 MD模型稳定性及氢键作用分析 | 第40-45页 |
| 3.3.3 基于相似分子的结构-亲和力关系分析 | 第45-50页 |
| 3.4 本章小结 | 第50-51页 |
| 4 靶向PTP1B抑制剂虚拟筛选的理论研究 | 第51-61页 |
| 4.1 引言 | 第51-52页 |
| 4.2 计算方法 | 第52-54页 |
| 4.2.1 计算分子结构准备及分子对接 | 第52页 |
| 4.2.2 虚拟筛选 | 第52-54页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第54-60页 |
| 4.3.1 初步筛选结果比较分析 | 第54-55页 |
| 4.3.2 聚类筛选结果比较分析 | 第55-60页 |
| 4.4 本章小结 | 第60-61页 |
| 结论 | 第61-62页 |
| 展望 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-68页 |
| 附录A 聚类筛选41种化合物分子结构 | 第68-73页 |
| 附录B 聚类筛选41种化合物相互作用 | 第73-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
