| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-19页 |
| 1.1 引言 | 第9页 |
| 1.2 limk1及其抑制剂 | 第9-12页 |
| 1.2.1 limk1的研究现状 | 第9-11页 |
| 1.2.2 limk1抑制剂 | 第11-12页 |
| 1.3 计算机辅助药物设计方法 | 第12-16页 |
| 1.3.1 计算机辅助药物设计方法概述 | 第12-13页 |
| 1.3.2 定量构效关系简介 | 第13页 |
| 1.3.3 三维定量构效关系简介 | 第13-14页 |
| 1.3.4 分子对接 | 第14页 |
| 1.3.5 分子动力学模拟 | 第14-15页 |
| 1.3.6 结合自由能预测 | 第15-16页 |
| 1.4 SYBYL软件简介 | 第16-17页 |
| 1.5 研究内容和意义 | 第17-19页 |
| 第2章 尿素为骨架的高活性和选择性limk1抑制剂设计 | 第19-39页 |
| 2.1 数据来源及准备 | 第19-22页 |
| 2.2 方法步骤及材料 | 第22-25页 |
| 2.2.1 构象优化及分子叠合 | 第22-23页 |
| 2.2.2 CoMFA和CoMSIA模型 | 第23页 |
| 2.2.3 分子对接 | 第23页 |
| 2.2.4 分子动力学模拟 | 第23-24页 |
| 2.2.5 合成 | 第24页 |
| 2.2.6 生物测试 | 第24-25页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第25-38页 |
| 2.3.1 CoMFA和CoMSIA模型分析 | 第25-29页 |
| 2.3.2 3D-QSAR/3D-QSSR模型的等势图 | 第29-33页 |
| 2.3.3 对接结果分析 | 第33-35页 |
| 2.3.4 动力学模拟结果分析 | 第35-36页 |
| 2.3.5 基于尿素骨架的limk1抑制剂设计 | 第36-38页 |
| 2.4 本章小结 | 第38-39页 |
| 第3章 氟原子引入对limk1抑制剂活性的影响研究 | 第39-47页 |
| 3.1 数据来源 | 第40-41页 |
| 3.2 实验方法 | 第41-42页 |
| 3.2.1 分子对接 | 第41页 |
| 3.2.2 分子动力学模拟 | 第41-42页 |
| 3.2.3 结合自由能计算 | 第42页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第42-46页 |
| 3.3.1 分子对接结果分析 | 第42-44页 |
| 3.3.2 分子动力学模拟结果分析 | 第44-46页 |
| 3.3.3 MM/GBSA结合自由能计算 | 第46页 |
| 3.4 本章小结 | 第46-47页 |
| 第4章 全文总结 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 攻读学位期间所发表的学术论文 | 第57页 |
