| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 第一章 前言 | 第12-49页 |
| 1.1 蛋白激酶及其抑制剂 | 第12-18页 |
| 1.1.1 蛋白激酶概述 | 第12-14页 |
| 1.1.2 蛋白激酶抑制剂 | 第14-18页 |
| 1.2 细胞周期蛋白依赖性激酶9(CDK9)及其抑制剂 | 第18-33页 |
| 1.2.1 细胞周期蛋白依赖性激酶(CDKs) | 第18-19页 |
| 1.2.2 CDK9的生理功能 | 第19-21页 |
| 1.2.3 CDK9抑制剂的研究进展 | 第21-33页 |
| 1.3 基于分子模拟的小分子激酶抑制剂的设计 | 第33-47页 |
| 1.3.1 计算机辅助药物设计方法 | 第34-41页 |
| 1.3.2 分子模拟在激酶抑制剂研究中的应用 | 第41-47页 |
| 1.4 立题依据 | 第47-49页 |
| 第二章 CDK9抑制剂的虚拟筛选与活性评价 | 第49-63页 |
| 2.1 前言 | 第49页 |
| 2.2 材料与方法 | 第49-52页 |
| 2.2.1 数据集及处理 | 第49-50页 |
| 2.2.2 贝叶斯分类模型 | 第50-51页 |
| 2.2.3 基于受体-配体相互作用的药效团 | 第51页 |
| 2.2.4 分子对接 | 第51页 |
| 2.2.5 生物活性评价方法 | 第51-52页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第52-62页 |
| 2.3.1 贝叶斯分类模型的建立及验证 | 第52-54页 |
| 2.3.2 基于受体-配体相互作用的药效团的建立及验证 | 第54-56页 |
| 2.3.3 分子对接及打分函数的选择 | 第56-57页 |
| 2.3.4 虚拟筛选流程及结果 | 第57-62页 |
| 2.4 小结 | 第62-63页 |
| 第三章 选择性CDK9抑制剂的分子模拟研究 | 第63-95页 |
| 3.1 CDK9抑制剂的QSSR研究 | 第63-79页 |
| 3.1.1 前言 | 第63页 |
| 3.1.2 材料与方法 | 第63-66页 |
| 3.1.3 结果与讨论 | 第66-78页 |
| 3.1.4 小结 | 第78-79页 |
| 3.2 基于蛋白-蛋白相互作用的选择性抑制剂 | 第79-87页 |
| 3.2.1 前言 | 第79-80页 |
| 3.2.2 材料与方法 | 第80-81页 |
| 3.2.3 结果与讨论 | 第81-87页 |
| 3.2.4 小结 | 第87页 |
| 3.3 基于CDK9变构抑制剂位点的探索研究 | 第87-95页 |
| 3.3.1 概述 | 第87-88页 |
| 3.3.2 DFG-out构象的建模 | 第88-92页 |
| 3.3.3 作用模式分析及选择性讨论 | 第92-94页 |
| 3.3.4 小结 | 第94-95页 |
| 第四章 吲哚酮类化合物的作用机制研究 | 第95-101页 |
| 4.1 概述 | 第95页 |
| 4.2 作用机制研究 | 第95-100页 |
| 4.3 小结 | 第100-101页 |
| 第五章 总结 | 第101-102页 |
| 参考文献 | 第102-120页 |
| 硕士期间已发表论文 | 第120-121页 |
| 致谢 | 第121-123页 |