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苹果HMGR基因家族生物信息学分析及HMGR1L基因功能分析

符号说明第4-8页
中文摘要第8-10页
Abstract第10-11页
1 前言第12-21页
    1.1 植物体中的萜类化合物第12-16页
        1.1.1 萜类物质简介第12-13页
        1.1.2 萜类物质的生物学功能第13页
        1.1.3 萜类物质的生物合成途径第13-15页
        1.1.4 影响萜类物质合成的因素第15-16页
    1.2 HMGR的研究进展第16-19页
        1.2.1 HMGR简介第16页
        1.2.2 HMGR的蛋白结构及定位第16-17页
        1.2.3 HMGR的调控因素第17页
        1.2.4 不同物种中HMGR的研究进展第17-18页
        1.2.5 HMGR的生物学功能第18-19页
    1.3 基因组学与生物信息学第19-20页
        1.3.1 基因组学第19页
        1.3.2 生物信息学第19-20页
    1.4 研究内容及意义第20-21页
2 材料与方法第21-34页
    2.1 实验材料第21-23页
        2.1.1 植物材料第21页
        2.1.2 材料培养及处理第21页
        2.1.3 菌株及质粒第21页
        2.1.4 酶及生化试剂第21页
        2.1.5 引物第21-22页
        2.1.6 数据库及软件资源第22-23页
    2.2 实验方法第23-34页
        2.2.1 HMGR基因的鉴定第23页
        2.2.2 HMGR蛋白性质及结构分析第23页
        2.2.3 苹果HMGR基因进化树构建第23页
        2.2.4 苹果HMGR基因结构及蛋白保守结构域分析第23-24页
        2.2.5 苹果HMGR基因的染色体定位及基因复制分析第24页
        2.2.6 苹果HMGR基因启动子顺式作用元件分析第24页
        2.2.7 总RNA的提取第24-25页
        2.2.8 RNA的反转录第25页
        2.2.9 实时荧光定量PCR第25-26页
        2.2.10 真核表达载体的构建第26-28页
            2.2.10.1 pBI121+Ht表达载体的构建第26-27页
            2.2.10.2 pBI121+Ht+HMGR1L表达载体的构建第27-28页
        2.2.11 转化农杆菌第28-29页
            2.2.11.1 LBA4404根癌农杆菌感受态细胞的制备第28页
            2.2.11.2 冻融法转化农杆菌第28-29页
        2.2.12 本生烟的遗传转化第29页
            2.2.12.1 农杆菌菌液的培养第29页
            2.2.12.2 烟草的转化及培养第29页
        2.2.13 基因组水平筛选转基因本生烟第29-30页
            2.2.13.1 CTAB法提取基因组DNA第29-30页
            2.2.13.2 PCR鉴定第30页
        2.2.14 转录水平筛选转基因本生烟第30-31页
        2.2.15 烟草挥发物的测定第31页
        2.2.16 ELISA法测定激素含量第31页
        2.2.17 本生烟色素含量测定第31-32页
        2.2.18 胁迫相关生理指标的测定第32-34页
            2.2.18.1 光合参数的测定第32页
            2.2.18.2 丙二醛含量的测定第32页
            2.2.18.3 超氧阴离子自由基测定第32页
            2.2.18.4 可溶性蛋白含量测定第32页
            2.2.18.5 抗氧化酶活性测定第32-34页
3 结果与分析第34-55页
    3.1 苹果HMGR基因家族生物信息学分析第34-42页
        3.1.1 苹果HMGR基因家族的鉴定第34页
        3.1.2 苹果HMGR基因的染色体定位第34-35页
        3.1.3 苹果HMGR蛋白特性分析第35-36页
        3.1.4 苹果HMGR蛋白二级结构分析及三级结构预测第36-37页
        3.1.5 苹果HMGR氨基酸的多序列比对和进化树构建第37-39页
        3.1.6 苹果HMGR基因结构分析第39-40页
        3.1.7 苹果HMGR蛋白的保守结构域分析第40-41页
        3.1.8 苹果HMGR基因的复制现象分析第41-42页
    3.2 苹果HMGR基因家族表达模式分析第42-47页
        3.2.1 HMGR基因家族的组织表达模式第42-43页
        3.2.2 苹果HMGR基因对不同逆境胁迫处理的响应第43-47页
            3.2.2.1 HMGR基因启动子逆境响应元件分析第44-45页
            3.2.2.2 HMGR基因逆境响应模式分析第45-47页
    3.3 苹果HMGR1L基因的异源表达第47-55页
        3.3.1 Ht::HMGR1L表达载体的构建第47页
        3.3.2 Ht::HMGR1L转基因本生烟的筛选第47-48页
        3.3.3 转基因本生烟中HMGR1L基因表达的空间特异性第48-49页
        3.3.4 Ht::HMGR1L过表达植株表型分析第49-50页
        3.3.5 HMGR1L在烟草中过表达对萜类代谢产物的影响第50-52页
            3.3.5.1 HMGR1L在烟草中过表达对烟草色素含量的影响第50页
            3.3.5.2 HMGR1L在烟草中过表达对相关激素含量的影响第50-51页
            3.3.5.3 HMGR1L在烟草中过表达对挥发物的影响第51-52页
        3.3.6 转基因本生烟抗低温能力检测第52-55页
            3.3.6.1 HMGR1L基因在低温下的表达分析第52-53页
            3.3.6.2 HMGR1L基因过表达提高了烟草的抗低温能力第53-55页
4 讨论第55-59页
5 结论第59-60页
参考文献第60-69页
致谢第69页

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