| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 缩略符号对照表 | 第9-14页 |
| 第一章 文献综述及研究目的与意义 | 第14-22页 |
| 1 文献综述 | 第14-20页 |
| 1.1 疥螨的生物学特征及防治研究概况 | 第14-15页 |
| 1.1.1 疥螨的生物学特性 | 第14-15页 |
| 1.1.2 疥螨病的诊断与防治 | 第15页 |
| 1.2 抗疥螨药物开发与靶向药物 | 第15-16页 |
| 1.3 印楝和十八碳酸-3,4-四氢呋喃二酯相关研究概述 | 第16-18页 |
| 1.3.1 植物来源和研究 | 第16-17页 |
| 1.3.2 十八碳酸-3,4-四氢呋喃二酯的活性研究 | 第17-18页 |
| 1.4 转录组学 | 第18-19页 |
| 1.5 蛋白质组学 | 第19-20页 |
| 2 研究目的及意义 | 第20-22页 |
| 第二章 十八碳酸-3,4-四氢呋喃二酯作用疥螨虫体转录组研究 | 第22-44页 |
| 1 材料与方法 | 第22-27页 |
| 1.1 兔疥螨虫体的获取 | 第22页 |
| 1.2 RNA的提取 | 第22-23页 |
| 1.3 cDNA文库构建及Illumina测序流程 | 第23页 |
| 1.4 数据处理与评估 | 第23-24页 |
| 1.4.1 产量统计 | 第23页 |
| 1.4.2 组装的Contigs和Unigenes长度分布统计 | 第23-24页 |
| 1.4.3 功能注释及分类 | 第24页 |
| 1.4.4 样品测序质量评估 | 第24页 |
| 1.5 基因表达注释 | 第24页 |
| 1.6 差异基因的分析 | 第24-26页 |
| 1.6.1 差异表达基因的筛选 | 第24页 |
| 1.6.2 基因表达模式聚类分析 | 第24-25页 |
| 1.6.3 Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第25页 |
| 1.6.4 Gene Ontology功能分类 | 第25页 |
| 1.6.5 Pathway显著性富集分析 | 第25-26页 |
| 1.7 荧光定量PCR验证 | 第26-27页 |
| 2 结果与分析 | 第27-40页 |
| 2.1 RNA提取及质检分析 | 第27-28页 |
| 2.2 测序产量统计 | 第28页 |
| 2.3 测序饱和度分析 | 第28页 |
| 2.4 测序随机性分析 | 第28-29页 |
| 2.5 组装的Contigs和Unigenes长度分布统计 | 第29-31页 |
| 2.5.1 疥螨虫体转录组的Contigs长度分布及质量统计 | 第30页 |
| 2.5.2 疥螨虫体转录组可靠Contigs长度分布及质量统计 | 第30-31页 |
| 2.6 疥螨虫体转录组注释 | 第31-35页 |
| 2.6.1 疥螨虫体转录组的Unigens在NR数据库中的注释分类结果 | 第31-32页 |
| 2.6.2 疥螨虫体转录组的Unigenes EggNOG功能分类 | 第32-34页 |
| 2.6.3 GO功能注释 | 第34-35页 |
| 2.7 差异表达基因的分析 | 第35-40页 |
| 2.7.1 差异表达基因的数量分析 | 第35-36页 |
| 2.7.2 差异表达基因GO功能注释 | 第36-37页 |
| 2.7.3 差异表达基因GO功能网络拓扑 | 第37-38页 |
| 2.7.4 差异表达的基因KEGG通路注释 | 第38-39页 |
| 2.7.5 差异表达的基因KEGG通路网络拓扑 | 第39-40页 |
| 2.8 差异表达基因荧光定量PCR验证结果 | 第40页 |
| 3 讨论 | 第40-43页 |
| 3.1 RNA-seq测序在转录组中的应用 | 第40-41页 |
| 3.2 能量代谢途径及相关基因 | 第41-43页 |
| 3.2.1 三羧酸循环代谢途径及相关基因 | 第41页 |
| 3.2.2 氧化磷酸化代谢途径及相关基因 | 第41-43页 |
| 4 小结 | 第43-44页 |
| 第三章 十八碳酸-3,4-四氢呋喃二酯作用疥螨虫体蛋白质组研究 | 第44-62页 |
| 1 材料与方法 | 第44-47页 |
| 1.1 材料 | 第44页 |
| 1.2 实验仪器和试剂 | 第44页 |
| 1.3 实验方法及步骤 | 第44-47页 |
| 1.3.1 蛋白质的提取 | 第44-45页 |
| 1.3.2 定量蛋白质组学的流程 | 第45-46页 |
| 1.3.3 蛋白质组学生物信息学分析 | 第46-47页 |
| 1.3.3.1 数据库的选择与搜索 | 第46-47页 |
| 1.3.3.2 蛋白质鉴定信息统计 | 第47页 |
| 1.3.3.3 差异蛋白质GO及KEGG通路富集分析 | 第47页 |
| 1.3.3.4 差异表达蛋白InterProScan功能注释 | 第47页 |
| 2 结果与分析 | 第47-57页 |
| 2.1 蛋白质检测 | 第47-48页 |
| 2.2 蛋白质样本质谱鉴定 | 第48-52页 |
| 2.2.1 肽段质量评估 | 第48-49页 |
| 2.2.2 基本信息鉴定 | 第49页 |
| 2.2.3 蛋白质相对分子质量分布 | 第49-50页 |
| 2.2.4 肽段序列长度分布分析 | 第50页 |
| 2.2.5 肽段序列覆盖度分析 | 第50-51页 |
| 2.2.6 Unique肽段数量分布 | 第51-52页 |
| 2.2.7 蛋白质等电点分布图 | 第52页 |
| 2.3 差异表达蛋白分析 | 第52-56页 |
| 2.3.1 蛋白质丰度比分布图 | 第52-53页 |
| 2.3.2 差异蛋白统计分布 | 第53页 |
| 2.3.3 差异蛋白的GO富集分析 | 第53-55页 |
| 2.3.4 差异蛋白的Pathway富集分析 | 第55页 |
| 2.3.5 差异表达蛋白InterProScan功能注释 | 第55-56页 |
| 2.4 差异蛋白和差异基因的关联分析 | 第56-57页 |
| 2.4.1 蛋白质组与转录组关联分析 | 第56-57页 |
| 2.4.2 差异蛋白及其对应基因的关联分析 | 第57页 |
| 3 讨论 | 第57-61页 |
| 3.1 杀虫机制及耐药性方面相关研究 | 第57-58页 |
| 3.2 十八碳酸-3,4-四氢呋喃二酯对疥螨蛋白质的影响 | 第58-61页 |
| 3.2.1 能量代谢酶 | 第58-59页 |
| 3.2.2 机体保护酶 | 第59页 |
| 3.2.3 组织蛋白酶 | 第59-60页 |
| 3.2.4 烯醇化酶 | 第60页 |
| 3.2.5 细胞骨架 | 第60页 |
| 3.2.6 其它 | 第60-61页 |
| 3.3 联合分析相关研究 | 第61页 |
| 4 小结 | 第61-62页 |
| 第四章 结论与创新性 | 第62-63页 |
| 1 结论 | 第62页 |
| 2 主要创新点 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-75页 |
| 研究生期间参与论文发表情况 | 第75-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
