纳帕海湿地浮游病毒遗传多样性研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-24页 |
| ·浮游病毒的类群与数量 | 第14页 |
| ·浮游病毒在生态系统中的作用 | 第14-15页 |
| ·浮游病毒的研究方法 | 第15-18页 |
| ·浮游病毒丰度的测定方法 | 第15-16页 |
| ·间接计数法 | 第15页 |
| ·透射电镜计数(TEM) | 第15-16页 |
| ·荧光显微镜技术(EFM) | 第16页 |
| ·流式细胞仪(FCM) | 第16页 |
| ·病毒生产力的研究方法 | 第16-17页 |
| ·放射性标记计数 | 第16-17页 |
| ·荧光标记病毒技术 | 第17页 |
| ·噬菌体与宿主间的关系 | 第17-18页 |
| ·浮游病毒的遗传多样性研究 | 第18-22页 |
| ·藻病毒 | 第18页 |
| ·噬菌体 | 第18-22页 |
| ·噬菌体的分类 | 第18页 |
| ·噬菌体的遗传多样性 | 第18-19页 |
| ·自然环境中T4型噬菌体g23基因多样性研究进展 | 第19页 |
| ·蓝藻噬菌体psbA和psbD基因 | 第19-20页 |
| ·T7型噬菌体pol基因 | 第20-21页 |
| ·蓝藻噬菌体g20基因 | 第21-22页 |
| ·本研究的技术路线 | 第22-23页 |
| ·本研究的内容及意义 | 第23-24页 |
| 第二章 纳帕海湿地T4型噬菌体遗传多样性研究 | 第24-75页 |
| ·实验材料与方法 | 第24-36页 |
| ·材料与试剂 | 第24-25页 |
| ·样品的采集与处理 | 第25-27页 |
| ·样品的采集 | 第25-26页 |
| ·不同样品的元素含量的测定 | 第26页 |
| ·叶绿素a含量的测定 | 第26页 |
| ·样品处理 | 第26-27页 |
| ·土样病毒基因组的提取 | 第27页 |
| ·水样病毒基因组的提取 | 第27-28页 |
| ·T4型噬菌体g23基因片段的扩增 | 第28页 |
| ·CaCl_2法制备感受态细胞DH5α | 第28-29页 |
| ·连接与转化 | 第29页 |
| ·核苷酸序列处理 | 第29-30页 |
| ·核苷酸翻译成氨基酸 | 第30页 |
| ·g23基因系统发育分析 | 第30-32页 |
| ·g23基因核苷酸序列PCoA分析 | 第32-35页 |
| ·T4型噬菌体g23基因核苷酸序列遗传多样性指数 | 第35页 |
| ·相关性分析 | 第35-36页 |
| ·实验结果与分析 | 第36-72页 |
| ·PCR扩增结果 | 第36页 |
| ·纳帕海g23基因序列 | 第36-37页 |
| ·序列Blast比对 | 第37-49页 |
| ·g23基因系统发育分析 | 第49-65页 |
| ·g23基因PCoA分析 | 第65页 |
| ·T4型噬菌体g23基因序列遗传多样性指数 | 第65-68页 |
| ·g23基因遗传多样性与理化性质的相关性 | 第68-72页 |
| ·讨论 | 第72-75页 |
| 第三章 纳帕海湿地噬藻体psbA遗传多样性的研究 | 第75-90页 |
| ·实验材料 | 第75-76页 |
| ·实验材料与试剂 | 第75页 |
| ·样品的采集与处理 | 第75-76页 |
| ·土壤病毒基因组的提取 | 第76页 |
| ·实验方法与过程 | 第76-80页 |
| ·psbA基因片段的扩增 | 第76-77页 |
| ·连接与转化 | 第77页 |
| ·核苷酸序列去重 | 第77-78页 |
| ·翻译成氨基酸 | 第78页 |
| ·构建psbA系统进化树 | 第78页 |
| ·psbA基因PCoA分析 | 第78-79页 |
| ·psbA基因序列的遗传多样性指数分析 | 第79-80页 |
| ·结果与分析 | 第80-88页 |
| ·PCR扩增结果 | 第80页 |
| ·psbA测序结果 | 第80-81页 |
| ·序列BLAST比对 | 第81页 |
| ·构建系统进化树 | 第81-86页 |
| ·psbA基因PCoA分析 | 第86-87页 |
| ·psbA基因序列遗传多样性指数分析 | 第87-88页 |
| ·讨论 | 第88-90页 |
| 第四章 总结与展望 | 第90-93页 |
| 致谢 | 第93-94页 |
| 参考文献 | 第94-102页 |
| 附录A 攻读硕士期间发表论文目录 | 第102-103页 |
| 附录B 实验常用试剂及仪器 | 第103-105页 |
