| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-24页 |
| ·前言 | 第13页 |
| ·RsmA 蛋白的序列特征及空间结构 | 第13-14页 |
| ·RsmA 的识别位点 | 第14-15页 |
| ·RsmA 参与基因表达调控的分子机制 | 第15-16页 |
| ·RsmA 参与调控的生理途径及功能 | 第16-19页 |
| ·RsmA 参与调控细菌的基础碳代谢 | 第16页 |
| ·RsmA 参与调控细菌的群体行为 | 第16-17页 |
| ·RsmA 参与调控菌体的致病性 | 第17-18页 |
| ·RsmA 自身表达的调节 | 第18-19页 |
| ·RsmA 在根际促生细菌中的研究进展 | 第19-22页 |
| ·荧光假单胞菌中 RsmA 参与抗真菌次级代谢物的合成 | 第19-20页 |
| ·枯草芽孢杆菌中 RsmA 参与鞭毛合成及形态发育 | 第20-21页 |
| ·棕色固氮菌中 RsmA 参与海藻酸盐及聚羟基丁酸酯的合成 | 第21页 |
| ·固氮施氏假单胞菌 A1501 中的 RsmA | 第21-22页 |
| ·立题依据 | 第22-23页 |
| ·技术路线 | 第23-24页 |
| 第二章 固氮施氏假单胞菌中 RsmA 的进化分析及表达特性 | 第24-36页 |
| ·材料 | 第25页 |
| ·菌株、培养条件 | 第25页 |
| ·主要试剂 | 第25页 |
| ·方法 | 第25-28页 |
| ·DNA 操作、总 RNA 提取、cDNA 的制备 | 第25-26页 |
| ·Real-time PCR | 第26-27页 |
| ·Northern blot | 第27页 |
| ·固氮条件下菌体收集 | 第27页 |
| ·5’Race 实验 | 第27-28页 |
| ·结果与分析 | 第28-34页 |
| ·RsmA 和非编码 RNA RsmX1、RsmX2、RsmY 及 RsmZ 的生物信息学分析 | 第28-30页 |
| ·RsmZ 的 northern blot 验证与 5’Race 分析 | 第30-31页 |
| ·不同生长时期 rsmA 和 rsmZ 的表达特征 | 第31-32页 |
| ·碳源、氮源及铁元素对 rsmA 及 rsmZ 表达的影响 | 第32-33页 |
| ·rpoN、rpoS 和 gacA 基因的缺失对 rsmA 和 rsmZ 表达的影响 | 第33-34页 |
| ·讨论 | 第34-36页 |
| 第三章 固氮施氏假单胞菌中 RsmA 的功能鉴定 | 第36-60页 |
| ·材料 | 第36-38页 |
| ·菌株与质粒 | 第36-37页 |
| ·培养基 | 第37-38页 |
| ·细菌培养条件 | 第38页 |
| ·方法 | 第38-44页 |
| ·碱裂解法提取大肠杆菌质粒 | 第38页 |
| ·细菌基因组 DNA 的提取 | 第38-39页 |
| ·基因的 PCR 扩增 | 第39页 |
| ·引物设计 | 第39-40页 |
| ·生长曲线测定 | 第40页 |
| ·Swimming 实验 | 第40页 |
| ·液体表面菌膜(pellicle)的形成实验 | 第40页 |
| ·玻璃试管中生物膜的形成实验 | 第40-41页 |
| ·Swarming 实验 | 第41页 |
| ·鞭毛的电子显微镜观察 | 第41页 |
| ·固体培养菌落扫描电子显微镜观察 | 第41-42页 |
| ·菌体在水稻根部竞争性定殖实验 | 第42页 |
| ·胞外多糖的测定 | 第42-43页 |
| ·RNA 提取、cDNA 合成、荧光定量 PCR | 第43-44页 |
| ·结果分析 | 第44-58页 |
| ·RsmA 和 GacA 突变株构建 | 第44-46页 |
| ·rsmA 基因重组载体的构建 | 第46页 |
| ·RsmA 突变株生长特性 | 第46-48页 |
| ·RsmA 突变对菌体固氮酶活的影响 | 第48-49页 |
| ·RsmA 突变对 swimming 运动的影响 | 第49-50页 |
| ·Swimming 相关基因在 RsmA 突变株中的表达分析 | 第50-51页 |
| ·野生型 A1501 和 RsmA 突变株的电子显微镜观察 | 第51-52页 |
| ·RsmA 突变对 swarming 运动的影响 | 第52-53页 |
| ·RsmA 突变对菌体氧化胁迫耐受能力的影响 | 第53页 |
| ·RsmA 突变对生物膜形成的影响 | 第53-55页 |
| ·RsmA 突变对胞外多糖合成的影响 | 第55-56页 |
| ·RsmA 突变对聚-β羟基烷酸、海藻糖和细菌纤维素合成基因表达的影响 | 第56-57页 |
| ·野生型 A1501 与 RsmA 突变株在水稻根部的竞争性定殖 | 第57-58页 |
| ·讨论 | 第58-60页 |
| 第四章 全文结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 作者简介 | 第68页 |
