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食管癌中SOX17基因的表观遗传学调控的研究

中文摘要第1-7页
Abstract第7-10页
目录第10-14页
缩略词表第14-16页
第一章 引言第16-22页
第二章 食管癌细胞系 SOX17 基因的甲基化调控研究第22-50页
 第一节 前言第22-23页
 第二节 材料和方法第23-37页
     ·主要试剂及耗材第23-24页
     ·主要仪器及设备第24-25页
     ·缓冲液的制备第25页
     ·细胞培养及总 RNA 提取第25-26页
     ·SOX17 基因的表达检测第26-28页
     ·食管癌细胞系 5-aza-dc 处理第28页
     ·5-aza-dc 处理后细胞 RNA 提取及 SOX17 基因的表达检测第28-29页
     ·细胞培养及基因组 DNA 提取第29-30页
     ·甲基化特异性 PCR 的对照组的建立第30-31页
     ·食管癌细胞系 DNA 的亚硫酸氢钠处理第31-32页
     ·食管癌细胞系 SOX17 基因启动子区甲基化的检测第32-33页
     ·食管癌细胞系 SOX17 基因的硫化测序分析第33-37页
 第三节 结果第37-46页
     ·食管癌细胞系 SOX17 基因的表达检测第37页
     ·食管癌细胞系 SOX17 基因启动子区甲基化检测第37-44页
     ·食管癌细胞系 5-aza-dc 处理后 SOX17 基因的半定量 RT-PCR 检测第44-46页
 第四节 讨论第46-49页
 第五节 小结第49-50页
第三章 正常食管粘膜、食管不典型增生及原发性食管癌 SOX17 基因启动子区甲基化检测第50-68页
 第一节 前言第50-51页
 第二节 材料和方法第51-59页
     ·主要试剂及耗材第51页
     ·主要仪器及设备第51-52页
     ·缓冲液的制备第52页
     ·组织中基因组 DNA 的提取第52-54页
     ·组织 DNA 的亚硫酸氢钠处理第54-55页
     ·人正常食管粘膜、食管不典型增生和原发性食管癌组织中 SOX17 基因甲基化状态的检测第55-58页
     ·数值计算及统计学分析第58-59页
 第三节 结果第59-65页
 第四节 讨论第65-67页
 第五节 小结第67-68页
第四章 人原发性食管癌及癌旁食管组织 SOX17 基因和β-catenin 基因的表达研究第68-78页
 第一节 前言第68-70页
 第二节 材料和方法第70-73页
     ·主要试剂及耗材第70页
     ·主要仪器及设备第70页
     ·溶液的配制第70-71页
     ·IHC 检测人原发性食管癌及癌旁食管组织 SOX17 基因和β-catenin 基因的表达第71-73页
 第三节 结果第73-76页
 第四节 讨论第76-77页
 第五节 小结第77-78页
第五章 SOX17 基因在食管癌中的功能研究及对 WNT/β-catenin 信号通路的影响第78-106页
 第一节 前言第78-80页
 第二节 材料和方法第80-96页
     ·主要试剂及耗材第80-81页
     ·主要仪器及设备第81页
     ·试剂的配制第81-82页
     ·SOX17 基因真核表达的构建第82-87页
     ·瞬时转染及克隆形成实验第87-89页
     ·双荧光素酶报告检测系统分析 SOX17 基因对经典 WNT/β-catenin 信号通路的影响第89-91页
     ·Western Blot 方法分析 SOX17 基因对经典 WNT/β-catenin 信号通路的影响第91-96页
 第三节 结果第96-102页
     ·SOX17 基因对食管癌 KYSE140 细胞的克隆形成能力的影响第96-97页
     ·SOX17 基因对经典 WNT/β-catenin 信号通路的影响第97-102页
 第四节 讨论第102-105页
 第五节 小结第105-106页
第六章 miRNAs 对 SOX17 基因表达的调控作用第106-129页
 第一节 前言第106-107页
 第二节 材料和方法第107-122页
     ·主要试剂及耗材第107-108页
     ·主要仪器及设备第108页
     ·试剂的配制第108-109页
     ·SOX17 基因的 3’非翻译区的野生型和突变型表达载体的构建第109-113页
     ·细胞培养、瞬时转染和双荧光素酶报告基因检测第113-114页
     ·Western Blot 方法检测调控 SOX17 基因表达的 miRNA第114-118页
     ·Real-time PCR 检测 miRNAs 的表达第118-122页
 第三节 结果第122-126页
 第四节 讨论第126-128页
 第五节 小结第128-129页
第七章 结论第129-130页
参考文献第130-139页
致谢第139-141页
个人简历,在学期间发表的学术论文与研究成果第141-143页
附录 A第143-153页
附录 B第153-178页
附录 C第178-200页

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