| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-14页 |
| 第一章 氧化应激及相关蛋白研究背景 | 第14-29页 |
| ·氧化应激 | 第14-15页 |
| ·与氧化应激相关的疾病 | 第15-18页 |
| ·氧化应激与动脉粥样硬化 | 第15-16页 |
| ·氧化应激与阿尔茨海默症 | 第16-17页 |
| ·氧化应激与高血压 | 第17-18页 |
| ·氧化应激相关蛋白 | 第18-21页 |
| ·蛋白质二硫键异构酶(PDI) | 第18-19页 |
| ·内质网氧化还原酶1(Erol) | 第19页 |
| ·静息巯基氧化酶(QSOX) | 第19-20页 |
| ·转录抑制因子Rex | 第20-21页 |
| ·计算机辅助药物设计方法简介 | 第21-27页 |
| ·同源模建(Homology Modeling) | 第21-23页 |
| ·分子对接(Molecular Docking) | 第23页 |
| ·虚拟筛选(Virtual Screening) | 第23-24页 |
| ·分子动力学(Molecular Dynamics) | 第24-27页 |
| ·本论文研究目标与总体安排 | 第27-29页 |
| 第二章 Ero1的结构与功能关系及抑制剂发现研究 | 第29-50页 |
| ·引言 | 第29-32页 |
| ·Ero1的结构 | 第29-31页 |
| ·二硫键传递机理 | 第31-32页 |
| ·Ero1α的结构与功能关系研究 | 第32-42页 |
| ·Ero1α的同源模建和生物活性测定 | 第32-34页 |
| ·结果分析与讨论 | 第34-42页 |
| ·基于对接的虚拟筛选寻找小分子抑制剂 | 第42-48页 |
| ·Ero1p的虚拟筛选及生物测试 | 第42-43页 |
| ·虚拟筛选结果及构效关系分析 | 第43-48页 |
| ·本章小结 | 第48-50页 |
| 第三章 QSOX中CXXC基序对底物巯基氧化的重要性研究 | 第50-63页 |
| ·背景介绍 | 第50页 |
| ·实验方法 | 第50-53页 |
| ·实验材料 | 第50-51页 |
| ·HsQSOX1b及其突变体的克隆 | 第51页 |
| ·QSOX及其突变体的表达和纯化 | 第51-52页 |
| ·QSOX活性测定以及与其它巯基氧化酶的活性比较 | 第52页 |
| ·QSOX的同源模建 | 第52-53页 |
| ·结果与讨论 | 第53-61页 |
| ·各巯基氧化酶的活性比较 | 第53-56页 |
| ·QSOX突变体的活性 | 第56-57页 |
| ·QSOX模型的构建及优化 | 第57-58页 |
| ·QSOX的结构特征 | 第58-60页 |
| ·QSOX的不同电子传递通路 | 第60-61页 |
| ·本章小结 | 第61-63页 |
| 第四章 Sr-Rex的同源模建和分子动力学模拟研究 | 第63-85页 |
| ·背景介绍 | 第63-66页 |
| ·Rex的结构 | 第63-65页 |
| ·Rex的研究意义和设计思路 | 第65-66页 |
| ·研究方法 | 第66-69页 |
| ·Sr-Rex的同源模建 | 第66页 |
| ·模型的准备 | 第66-67页 |
| ·分子动力学模拟 | 第67-68页 |
| ·结合自由能计算 | 第68-69页 |
| ·结果与讨论 | 第69-84页 |
| ·Sr-Rex的同源模建 | 第69-71页 |
| ·Sr-Rex的三维结构模型 | 第71-73页 |
| ·分子动力学模拟中Sr-Rex结构变化 | 第73-75页 |
| ·结合自由能计算 | 第75-79页 |
| ·结合自由能分解 | 第79页 |
| ·Sr-Rex构象的变化 | 第79-82页 |
| ·Sr-Rex与NADH/NAD+的相互作用 | 第82-84页 |
| ·本章小结 | 第84-85页 |
| 第五章 新型环氧水解酶催化缩水甘油醚的对映选择性研究 | 第85-97页 |
| ·背景介绍 | 第85-89页 |
| ·环氧水解酶的生物学功能和分类 | 第85-86页 |
| ·环氧水解酶的结构 | 第86-88页 |
| ·环氧水解酶的催化机理 | 第88-89页 |
| ·实验方法 | 第89-90页 |
| ·BMEH的同源模建及结构优化 | 第89-90页 |
| ·分子对接 | 第90页 |
| ·结果与讨论 | 第90-96页 |
| ·同源模建 | 第90-92页 |
| ·BMEH的结构 | 第92页 |
| ·结合模式 | 第92-96页 |
| ·本章小结 | 第96-97页 |
| 第六章 全文总结 | 第97-99页 |
| 参考文献 | 第99-118页 |
| 附录A NADH的结构、原子名、对应的原子类型和电荷 | 第118-120页 |
| 附录B NADH的参数文件 | 第120-123页 |
| 附录C NAD+的结构、原子名、对应的原子类型和电荷 | 第123-125页 |
| 附录D NAD+的参数文件 | 第125-128页 |
| 攻读博士期间发表的论文 | 第128-129页 |
| 致谢 | 第129页 |
