| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-12页 |
| 第一章 前言与文献综述 | 第12-30页 |
| ·笛鲷属鱼类研究现状 | 第12-17页 |
| ·笛鲷属鱼类分类现状 | 第12-14页 |
| ·笛鲷属鱼类的生存现状 | 第14-15页 |
| ·笛鲷属鱼类种质资源研究情况 | 第15-17页 |
| ·鱼类线粒体DNA研究进展 | 第17-23页 |
| ·鱼类mtDNA组成与特征 | 第17-20页 |
| ·鱼类cyt b与CO Ⅱ基因研究进展 | 第20-21页 |
| ·鱼类mtDNA在分子系统学中的研究进展 | 第21-23页 |
| ·鱼类微卫星DNA研究进展 | 第23-28页 |
| ·微卫星DNA特征与介绍 | 第23-25页 |
| ·微卫星DNA的分析方法 | 第25-28页 |
| ·微卫星多态性与应用进展 | 第28页 |
| ·本研究的目的和内容 | 第28-30页 |
| 第二章 勒氏笛鲷线粒体全序列分析 | 第30-64页 |
| ·材料与方法 | 第30-34页 |
| ·实验材料 | 第30页 |
| ·总DNA的提取 | 第30-31页 |
| ·模板引物设计与Long-PCR | 第31-32页 |
| ·引物设计与PCR扩增 | 第32页 |
| ·线粒体DNA各片段的序列测定 | 第32-33页 |
| ·全序列的拼接与分析方法 | 第33-34页 |
| ·结果与分析 | 第34-48页 |
| ·PCR扩增结果 | 第34页 |
| ·勒氏笛鲷线粒体DNA全序列测定 | 第34-35页 |
| ·勒氏笛鲷线粒体DNA限制性酶切分析 | 第35-39页 |
| ·勒氏笛鲷线粒体DNA的BLAST分析 | 第39页 |
| ·勒氏笛鲷线粒体DNA基因组结构分析 | 第39-48页 |
| ·讨论 | 第48-51页 |
| 附录2 勒氏笛鲷线粒体DNA基因组全序列 | 第51-64页 |
| 第三章 笛鲷属常见种系统发生关系 | 第64-86页 |
| ·材料与方法 | 第64-67页 |
| ·实验样本的采集 | 第64-65页 |
| ·总DNA的提取 | 第65页 |
| ·COⅡ和cytb基因全序列的PCR扩增 | 第65-66页 |
| ·COⅡ和cytb基因全序列的克隆与序列测定 | 第66页 |
| ·COⅡ和cytb基因全序列的拼接和组成分析 | 第66页 |
| ·分子系统树的构建方法 | 第66-67页 |
| ·结果 | 第67-76页 |
| ·序列扩增结果 | 第67页 |
| ·序列组成分析结果 | 第67-70页 |
| ·系统发育关系分析的结果 | 第70-76页 |
| ·讨论 | 第76-82页 |
| 附录3 笛鲷样本照片 | 第82-86页 |
| 第四章 勒氏笛鲷DNA文库构建与SSR位点筛选 | 第86-100页 |
| ·材料与方法 | 第86-91页 |
| ·实验材料 | 第86页 |
| ·总DNA的提取 | 第86页 |
| ·DNA文库构建 | 第86-89页 |
| ·PCR筛选含有微卫星序列的阳性克隆 | 第89-90页 |
| ·测定阳性克隆序列与引物设计 | 第90页 |
| ·引物适用性分析 | 第90-91页 |
| ·结果与分析 | 第91-97页 |
| ·文库构建 | 第91-92页 |
| ·微卫星位点的筛选 | 第92-95页 |
| ·引物的设计与适用性分析 | 第95-97页 |
| ·讨论 | 第97-99页 |
| ·勒氏笛鲷微卫星序列特征 | 第97页 |
| ·PCR法筛选的利弊 | 第97-98页 |
| ·引物对近缘种的应用前景 | 第98-99页 |
| 附录4 微卫星位点名与对应的克隆号 | 第99-100页 |
| 第五章 勒氏笛鲷遗传多样性分析 | 第100-112页 |
| ·材料与方法 | 第100-101页 |
| ·实验材料 | 第100页 |
| ·总 DNA的提取 | 第100页 |
| ·PCR反应 | 第100页 |
| ·PCR扩增产物的分离与检测 | 第100页 |
| ·数据统计方法 | 第100-101页 |
| ·结果与分析 | 第101-103页 |
| ·电泳图谱分析 | 第101-103页 |
| ·等位基因频率 | 第103页 |
| ·遗传多样性分析 | 第103页 |
| ·讨论 | 第103-107页 |
| ·H-W平衡分析 | 第103-105页 |
| ·杂合度分析 | 第105页 |
| ·多态信息含量分析 | 第105-107页 |
| 附录5 勒氏笛鲷 微卫星位点的等位基因频率 | 第107-112页 |
| 第六章 9种常见笛鲷微卫星位点筛选与与遗传多样性分析 | 第112-150页 |
| ·材料与方法 | 第112-113页 |
| ·实验材料 | 第112页 |
| ·总 DNA的提取 | 第112页 |
| ·PCR反应 | 第112页 |
| ·PCR扩增产物的分离与检测 | 第112页 |
| ·数据统计方法 | 第112-113页 |
| ·结果与分析 | 第113-125页 |
| ·微卫星引物适用性分析 | 第113-116页 |
| ·等位基因频率 | 第116页 |
| ·遗传多样性分析 | 第116-124页 |
| ·系统发生关系 | 第124-125页 |
| ·讨论 | 第125-129页 |
| ·种间微卫星引物适用性分析 | 第125-126页 |
| ·笛鲷属鱼类杂合子缺失现象的原因分析 | 第126-127页 |
| ·笛鲷属鱼类种质资源情况 | 第127页 |
| ·笛鲷属鱼类系统发生关系 | 第127-129页 |
| 附录6 九种笛鲷微卫星位点等位基因频率分布 | 第129-150页 |
| 第七章 总结 | 第150-152页 |
| 参考文献 | 第152-160页 |
| 实验主要试剂与配制方法 | 第160-162页 |
| 攻读博士学位期间发表的与学位论文相关的学术论文 | 第162-163页 |
| 致谢 | 第163-164页 |