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秸秆还田土壤中与纤维素降解相关的微生物的分子生态学研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-14页
第一章 文献综述第14-27页
   ·秸秆综合利用现状第14-15页
     ·直接用于还田第14页
     ·生产有机肥料间接还田第14-15页
     ·生产饲料第15页
     ·用作生物能源第15页
     ·在其他工业中的应用第15页
   ·秸秆还田效应的研究进展第15-19页
     ·秸秆还田对土壤理化性状的影响第15-17页
     ·秸秆还田的生物效应第17-18页
     ·秸秆还田的负效应第18-19页
   ·纤维素微生物降解过程的研究第19-21页
     ·纤维素的结构和性质第19页
     ·纤维素酶的组成及作用机制第19-20页
     ·纤维素分解菌第20-21页
   ·土壤微生态研究方法进展第21-25页
     ·传统培养分离方法第21页
     ·通过分析细胞组成物或代谢物的多样性来研究微生物组成的多样性的方法第21-22页
     ·克隆文库分析法第22-23页
     ·分子杂交法第23页
     ·DNA 指纹图谱分析方法第23-25页
   ·本研究的主要工作背景和研究方法第25-27页
第二章 秸秆还田土壤中微生物在不同纤维素富集条件下的多样性第27-35页
   ·引言第27页
   ·材料与方法第27-30页
     ·土壤样品的采集第27-28页
     ·培养基第28页
     ·土壤悬液的制备和富集培养第28页
     ·DNA 的提取第28-29页
     ·PCR 扩增第29-30页
     ·DGGE 分析第30页
     ·数据分析第30页
   ·结果与分析第30-32页
     ·不同富集培养条件下样品的1651DNA V3 区DGGE 分析第30-31页
     ·DGGE 图谱的聚类和PCA 分析第31-32页
   ·讨论第32-34页
   ·小结第34-35页
第三章 秸秆还田模拟体系中土壤微生物多样性的分子生态学研究第35-48页
   ·引言第35-36页
   ·材料与方法第36-39页
     ·土壤样品的采集第36页
     ·秸秆还田模拟体系的建立第36页
     ·CMC 酶活性的测定第36-37页
     ·土壤样品 DNA 的提取第37页
     ·PCR 扩增第37-38页
     ·DGGE 分析第38页
     ·DGGE 图谱的数据分析第38页
     ·DGGE 条带割胶回收测序第38-39页
   ·结果与分析第39-45页
     ·硝酸盐(无机氮)的加入对土壤样品 CMC 酶活性及其微生物种类和结构的影响(选取7 天时的样品进行分析)第39-40页
     ·秸秆还田模拟体系中随着时间点的推移土壤样品 CMC 酶活性及其微生物结构和组成的变化情况第40-45页
   ·讨论第45-47页
   ·小结第47-48页
第四章 秸秆还田土壤中的微生物在50℃高温下降解秸秆规律的研究第48-57页
   ·引言第48页
   ·材料与方法第48-50页
     ·土壤样品的采集第48-49页
     ·建立50℃秸秆还田土壤微生物秸秆降解体系第49页
     ·CMC 酶活性的测定第49页
     ·土壤样品DNA 的提取第49页
     ·PCR 扩增第49页
     ·DGGE 分析第49页
     ·DGGE 图谱的数据分析第49页
     ·DGGE 条带割胶回收测序第49-50页
   ·结果与分析第50-54页
     ·50℃秸秆还田土壤微生物秸秆降解体系中6 个时间点土壤样品的CMC 酶活测定结果第50-51页
     ·50℃秸秆还田土壤微生物秸秆降解体系中6 个时间点土壤样品的16Sr1DNAV3-DGGE 分析第51-52页
     ·16SrDNAV3-DGGE 图谱的聚类分析和 PCA 分析第52页
     ·16SrDNAV3-DGGE 图谱 PLS-DA 分析第52-54页
   ·讨论第54-55页
   ·小结第55-57页
参考文献第57-66页
附录1: 溶液试剂的配制第66-70页
附录2: 本论文中所用到的 DGGE 指纹图谱分析软件的使用第70-73页
附录3: 实验中所用的仪器设备第73-74页
致 谢第74-75页
研究生阶段发表的论文第75页

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