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马铃薯晚疫病水平抗性相关基因诱导表达谱及水平抗性机制初探

目录第1-9页
缩略词表第9-10页
摘要第10-13页
Abstract第13-16页
第一章 文献综述第16-48页
   ·马铃薯晚疫病菌概述第17-18页
     ·病原菌基本特征特性第17页
     ·生理小种变异第17-18页
       ·垂直抗性品种的推广第17-18页
       ·A2交配型的出现与有性生殖第18页
       ·抗药性小种的产生第18页
       ·晚疫病菌大迁移第18页
   ·马铃薯晚疫病抗性分子遗传学研究第18-22页
     ·垂直抗性第19-20页
       ·R基因的染色体定位第19页
       ·R基因克隆第19-20页
     ·水平抗性第20-22页
       ·QTL定位第20-21页
       ·差异表达基因分离第21-22页
     ·垂直抗性与水平抗性的再认识第22页
   ·马铃薯晚疫病抗性基因工程研究第22-24页
     ·抗病基因遗传转化第22-23页
     ·防卫基因遗传转化第23-24页
     ·利用基因工程培育植物抗病品种的发展策略第24页
   ·植物—病原互作中寄主次级代谢变化及调节第24-29页
     ·苯丙烷类代谢第25-26页
     ·类异戊二烯代谢第26-27页
     ·氧合脂类代谢第27-28页
     ·生物碱合成第28-29页
   ·植物—病原互作中的信号识别与传导第29-43页
     ·信号识别第29页
     ·信号传导第29-43页
       ·SA介导的信号传导第30-31页
       ·JA介导的信号传导第31-33页
       ·ET介导的信号传导第33-35页
       ·一氧化氮、活性氧和脱落酸介导的信号传导第35-38页
         ·NO介导的信号传导第35-36页
         ·ROS介导的信号传导第36-37页
         ·ABA介导的信号传导第37-38页
       ·R基因介导的信号传导第38-40页
       ·植物防御反应信号传导途径的互作第40-43页
         ·JA与ET信号传导途径的互作第41页
         ·JA与SA信号传导途径的互作第41-42页
         ·SA与ET信号传导途径的互作第42-43页
   ·基因芯片技术及其在植物研究中的应用第43-46页
     ·基因芯片技术的原理、特点及分类第43页
     ·基因芯片数据分析第43-44页
       ·数据标准化第44页
       ·标准化数据的统计学分析第44页
         ·差异表达分析第44页
         ·聚类分析第44页
     ·基因芯片技术的应用第44-46页
       ·DNA序列分析第44-45页
       ·基因表达模式研究及特异性基因鉴定第45页
       ·基因差异表达分析第45页
       ·突变体检测第45-46页
       ·转基因植株检测第46页
     ·展望第46页
   ·本研究的目的与内容第46-48页
第二章 材料与方法第48-53页
   ·植物材料第48页
   ·晚疫病菌培养与接种第48-49页
     ·晚疫病菌培养第48页
       ·培养基繁殖法第48页
       ·块茎薄片培养法第48页
     ·离体叶片接种第48-49页
   ·cDNA芯片制备第49-50页
     ·对照基因第49页
     ·EST扩增与精制第49页
     ·点样及其后处理第49-50页
   ·RNA抽提第50-51页
   ·荧光探针标记第51页
   ·芯片杂交、洗涤和扫描第51-52页
   ·数据分析第52-53页
第三章 马铃薯晚疫病水平抗性相关基因Phytophthora infestans诱导表达模式第53-73页
   ·前言第53页
   ·材料与方法第53-54页
     ·植物材料第53页
     ·晚疫病菌接种第53-54页
     ·EST测序、检索及功能分类第54页
     ·RT-PCR分析第54页
   ·结果第54-68页
     ·晚疫病菌培养与叶片接种第54-55页
     ·叶片总RNA抽提第55-56页
     ·芯片杂交结果可靠性分析第56-59页
       ·自身比较实验第56页
       ·差异分析实验第56-59页
         ·Cy3、Cy5正反向标记芯片杂交重复性比较第56页
         ·Cy3、Cy5同向标记芯片杂交重复性比较第56-58页
         ·芯片杂交片内重复性比较第58-59页
     ·晚疫病菌诱导ESTs的芯片杂交鉴定第59页
     ·晚疫病菌诱导ESTs的功能分类第59-60页
     ·晚疫病抗性相关基因病原诱导表达总模式第60-66页
     ·晚疫病抗性相关基因表达聚类分析第66-67页
     ·芯片杂交结果验证第67-68页
   ·讨论第68-72页
     ·芯片数据可靠性第68页
     ·马铃薯抵御晚疫病菌侵染的阶段划分第68-69页
     ·信号传导和转录调控相关基因的诱导表达第69-70页
     ·晚疫病菌对马铃薯防卫相关基因的调控第70-71页
     ·马铃薯非小种专化抗性中HR相关基因的诱导表达第71-72页
     ·晚疫病菌对马铃薯代谢相关基因的调控第72页
   ·小结第72-73页
第四章 马铃薯晚疫病水平抗性相关代谢途径分析第73-83页
   ·前言第73页
   ·材料与方法第73页
   ·结果第73-76页
     ·晚疫病菌诱导基因表达的动力学模式第73-76页
     ·代谢相关基因的转录变化与代谢途径第76页
   ·讨论第76-81页
     ·持家代谢向防卫代谢的转变第78页
     ·连接初级代谢与次级代谢的桥梁—莽草酸途径第78-80页
     ·氧合脂类代谢途径的激发第80页
     ·多胺代谢与乙烯生物合成第80-81页
     ·能量代谢相关路径第81页
   ·小结第81-83页
第五章 水杨酸、茉莉酸甲酯和乙烯利对马铃薯晚疫病水平抗性相关基因的诱导表达分析第83-101页
   ·前言第83-84页
   ·材料与方法第84页
     ·植物材料第84页
     ·SA、MJ和ETH处理第84页
   ·结果第84-93页
     ·晚疫病抗性相关基因在SA、MJ和ETH处理下的诱导表达模式第84-90页
     ·SA、MJ与ETH诱导表达基因第90-92页
     ·晚疫病菌“特异诱导表达基因”第92-93页
   ·讨论第93-100页
     ·SA、JA和ET信号途径在马铃薯晚疫病水平抗性中的协同作用第93-95页
     ·马铃薯防御晚疫病菌侵染过程中SA、JA和ET信号途径的形成与整合第95-98页
     ·马铃薯晚疫病抗性反应可能涉及的信号传导组分第98-99页
     ·马铃薯防御晚疫病菌侵染的其它信号途径?第99-100页
   ·小结第100-101页
第六章 马铃薯晚疫病水平抗性相关基因对机械伤害及ABA处理的应答分析第101-117页
   ·前言第101-102页
   ·材料与方法第102页
     ·植物材料第102页
     ·ABA、机械伤害处理第102页
   ·结果第102-113页
     ·晚疫病抗性相关基因对ABA、机械伤害的应答表达谱第102-108页
     ·ABA、机械伤害诱导表达基因第108-111页
     ·ABA抑制表达基因第111-112页
     ·晚疫病菌“特异诱导表达基因”第112-113页
   ·讨论第113-116页
     ·马铃薯对机械伤害及晚疫病菌应答反应的一致性第113-114页
     ·ABA在马铃薯防卫反应中的调节作用第114-115页
     ·植物防卫反应与胁迫反应之间的交互作用第115-116页
   ·小结第116-117页
第七章 马铃薯晚疫病水平抗性相关基因在不同抗性品种(系)中的差异表达分析第117-131页
   ·前言第117页
   ·材料与方法第117-118页
     ·植物材料第117-118页
     ·晚疫病菌接种第118页
   ·结果第118-127页
     ·不同抗性马铃薯叶片晚疫病菌侵染症状第118页
     ·晚疫病水平抗性相关基因在不同马铃薯品种(系)中的P.infestans诱导表达谱第118-124页
     ·不同马铃薯品种(系)中被晚疫病菌诱导表达基因第124-127页
   ·讨论第127-130页
     ·晚疫病抗性相关基因在不同马铃薯品种(系)中的差异表达第127-129页
       ·调节基因的差异表达第127-128页
       ·功能蛋白基因的差异表达第128-129页
     ·仅在水平抗性马铃薯品系中被晚疫病菌显著诱导表达的基因第129-130页
   ·小结第130-131页
第八章 总结与讨论第131-145页
   ·马铃薯晚疫病水平抗性相关基因在不同处理和不同品种(系)中的诱导表达比较第131-136页
   ·马铃薯晚疫病水平抗性机制第136-140页
   ·马铃薯晚疫病水平抗性与垂直抗性机制比较第140-143页
   ·研究展望第143-145页
参考文献第145-167页
附录1 通过cDNA微阵列杂交鉴定的马铃薯晚疫病菌应答ESTs和晚疫病菌ESTs列表第167-185页
附录2 被晚疫病菌调控的马铃薯初级、次级与能量代谢相关基因汇总表第185-189页
附录3 348个马铃薯晚疫病水平抗性相关基因在不同处理和不同品种(系)中的诱导表达比较第189-196页
附录4 348个马铃薯晚疫病水平抗性相关ESTs编号与其GenBank登录号对照表第196-198页
附录5 博士在读期间已发表和正在整理的文章第198-199页
致谢第199页

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