| 缩写表(中英文对照表) | 第1-6页 |
| 中文摘要 | 第6-8页 |
| 英文摘要 | 第8-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-25页 |
| 1．1 生物信息学简介 | 第11-12页 |
| 1．2 常用的蛋白质数据库和分析软件 | 第12-16页 |
| 1．3 几种预测未知蛋白质功能的方法 | 第16-18页 |
| 1．4 现有的蛋白质相互作用预测方法 | 第18-21页 |
| 1．5 生物代谢途径重构的研究现状 | 第21-25页 |
| 第二章 生物信息学平台的建立 | 第25-35页 |
| 2．1 实验室服务器配置 | 第25-27页 |
| 2．2 数据库平台的建立 | 第27-29页 |
| 2．3 自主开发的综合分析体系 | 第29-34页 |
| 2．4 自主开发的相关算法 | 第34-35页 |
| 第三章 对蛋白质相互作用预测的系统发生谱方法的改进 | 第35-49页 |
| 3．1 材料和方法 | 第35-38页 |
| 3．2 结果 | 第38-47页 |
| 3．3 讨论 | 第47-49页 |
| 第四章 蛋白质相互作用网络中代谢途径的挖掘 | 第49-67页 |
| 4．1 材料和方法 | 第49-55页 |
| 4．2 结果 | 第55-64页 |
| 4．3 讨论 | 第64-67页 |
| 第五章 进一步研究的设想 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-80页 |
| 附录 | 第80-89页 |
| 致谢 | 第89-90页 |
| 原创性声明 | 第90页 |