蛋白质远距同源检测中核方法的研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·概述 | 第7-8页 |
| ·远距同源检测的生物背景及研究现状 | 第8-11页 |
| ·远距同源检测的生物背景 | 第8-9页 |
| ·蛋白质同源检测的研究现状 | 第9-11页 |
| ·本文主要工作及安排 | 第11-13页 |
| 第二章 蛋白质远距同源检测方法 | 第13-29页 |
| ·远距同源检测的基本问题 | 第13-18页 |
| ·序列比对中的基本概念 | 第13-14页 |
| ·替换矩阵与空位罚分 | 第14-17页 |
| ·序列比对算法 | 第17-18页 |
| ·远距同源检测方法及其发展现状 | 第18-28页 |
| ·动态规划算法 | 第18-22页 |
| ·隐马尔科夫模型方法 | 第22-24页 |
| ·基于支持向量机的核方法 | 第24-28页 |
| ·本章小结 | 第28-29页 |
| 第三章 基于片段对的局部比对核 | 第29-37页 |
| ·局部比对核的基本原理 | 第29-31页 |
| ·局部比对核 | 第29-30页 |
| ·局部比对核的计算 | 第30-31页 |
| ·基于片段对的局部比对核 | 第31-32页 |
| ·DLA算法的实现 | 第32-33页 |
| ·算法分析 | 第33页 |
| ·实验结果分析 | 第33-35页 |
| ·本章小结 | 第35-37页 |
| 第四章 基于k-mer划分的核方法 | 第37-49页 |
| ·算法的基本原理 | 第37-38页 |
| ·SVM-SW方法 | 第38-45页 |
| ·基本概念 | 第38-39页 |
| ·使用k-mer划分序列 | 第39-44页 |
| ·Smith-Waterman算法 | 第44-45页 |
| ·算法的执行 | 第45页 |
| ·实验结果分析 | 第45-47页 |
| ·实验结果 | 第45-46页 |
| ·结果分析 | 第46-47页 |
| ·本章小结 | 第47-49页 |
| 第五章 结束语 | 第49-51页 |
| 致谢 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 在校期间科研成果 | 第57页 |
