DNA序列中基于后缀树的重复体识别算法
摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
目录 | 第5-7页 |
第一章 绪论 | 第7-13页 |
·引言 | 第7-9页 |
·重复序列识别算法研究现状 | 第9-11页 |
·本文所做的工作 | 第11页 |
·本文章节安排 | 第11-13页 |
第二章 后缀树 | 第13-31页 |
·相关定义 | 第13页 |
·后缀树 | 第13-15页 |
·后缀树构造算法 | 第15-28页 |
·Ukkonen后缀树构造 | 第15-20页 |
·Ukkonen后缀树构造算法实现 | 第20-22页 |
·一个构造后缀树的实例 | 第22-28页 |
·基于后缀树的查询算法 | 第28页 |
·后缀树适应性改进 | 第28-30页 |
·基于改进后缀树的查询算法 | 第30页 |
·本章小结 | 第30-31页 |
第三章 REPSEEKER重复体识别算法 | 第31-41页 |
·引入初级重复体 | 第31-32页 |
·初级重复体的定义及推论 | 第32页 |
·REPSEEKER初级重复体识别算法 | 第32-35页 |
·REPSEEKER算法实现 | 第35-36页 |
·后缀树在REPSEEKER算法中所起的作用 | 第36-38页 |
·求子串在输入序列中的发生频率 | 第36-38页 |
·求子串在输入序列中的出现位置 | 第38页 |
·后缀树的改进对REPSEEKER算法的影响 | 第38-39页 |
·时间和空间复杂度分析 | 第39页 |
·实验 | 第39-40页 |
·实验参数设置 | 第39页 |
·实验结果 | 第39-40页 |
·结果分析 | 第40页 |
·本章小结 | 第40-41页 |
第四章 结束语 | 第41-43页 |
致谢 | 第43-45页 |
参考文献 | 第45-49页 |
研究成果 | 第49页 |