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DNA序列中基于后缀树的重复体识别算法

摘要第1-4页
Abstract第4-5页
目录第5-7页
第一章 绪论第7-13页
   ·引言第7-9页
   ·重复序列识别算法研究现状第9-11页
   ·本文所做的工作第11页
   ·本文章节安排第11-13页
第二章 后缀树第13-31页
   ·相关定义第13页
   ·后缀树第13-15页
   ·后缀树构造算法第15-28页
     ·Ukkonen后缀树构造第15-20页
     ·Ukkonen后缀树构造算法实现第20-22页
     ·一个构造后缀树的实例第22-28页
   ·基于后缀树的查询算法第28页
   ·后缀树适应性改进第28-30页
   ·基于改进后缀树的查询算法第30页
   ·本章小结第30-31页
第三章 REPSEEKER重复体识别算法第31-41页
   ·引入初级重复体第31-32页
   ·初级重复体的定义及推论第32页
   ·REPSEEKER初级重复体识别算法第32-35页
   ·REPSEEKER算法实现第35-36页
   ·后缀树在REPSEEKER算法中所起的作用第36-38页
     ·求子串在输入序列中的发生频率第36-38页
     ·求子串在输入序列中的出现位置第38页
   ·后缀树的改进对REPSEEKER算法的影响第38-39页
   ·时间和空间复杂度分析第39页
   ·实验第39-40页
     ·实验参数设置第39页
     ·实验结果第39-40页
     ·结果分析第40页
   ·本章小结第40-41页
第四章 结束语第41-43页
致谢第43-45页
参考文献第45-49页
研究成果第49页

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