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副猪嗜血杆菌感染和应激相关基因的鉴定与功能研究

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
缩略语表(Abbreviation)第13-15页
第1章 文献综述第15-42页
   ·副猪嗜血杆菌病第15-26页
     ·病原学第15-17页
     ·血清与基因型第17-19页
     ·临床症状第19-20页
     ·病理变化第20-21页
     ·致病机理及毒力因子第21-24页
     ·免疫与疫苗第24-26页
   ·SCOTS技术概述第26-35页
     ·多种差异显示技术的比较第26-30页
     ·SCOTS技术原理第30-31页
     ·SCOTS技术的应用第31-34页
     ·SCOTS技术的优缺点第34-35页
   ·反向疫苗学研究第35-37页
   ·酵母双杂交技术第37-42页
     ·酵母双杂交系统的原理第37-39页
     ·酵母双杂交系统的应用第39-40页
     ·酵母双杂交系统的优缺点第40-42页
第2章 副猪嗜血杆菌感染和应激相关基因的筛选第42-85页
   ·前言第42-43页
   ·材料与方法第43-56页
     ·主要试剂和仪器第43-44页
     ·培养基,抗生素及铁离子螯合剂的配制第44页
     ·主要缓冲液第44-45页
     ·菌株、质粒及引物第45-48页
     ·缺铁、高温及正常体外培养条件第48页
     ·细菌计数第48页
     ·实验动物的分组与感染第48页
     ·菌株的分离和鉴定第48-49页
     ·rDNA基因的克隆第49-51页
     ·基因组DNA的制备第51-52页
     ·基因组DNA和rDNA基因克隆质粒的超声波处理第52页
     ·基因组DNA的光敏生物素酰化第52页
     ·RNA提取及双链cDNA的合成及扩增第52-53页
     ·cDNA的SCOTS标准化第53-54页
     ·cDNA的SCOTS富集第54页
     ·SCOTS文库的克隆第54-55页
     ·反向Southern斑点杂交技术筛选阳性克隆第55页
     ·测序检测生物信息学分析,对筛选到的基因进行功能注释第55页
     ·荧光定量RT-PCR第55-56页
   ·结果与分析第56-75页
     ·副猪嗜血杆菌rDNA重组载体的验证第56-57页
     ·副猪嗜血杆菌肺组织感染相关的基因第57-66页
   ·3 副猪嗜血杆菌铁应激相关的基因第66-71页
     ·副猪嗜血杆菌高温应激相关的基因第71-75页
   ·讨论第75-85页
     ·副猪嗜血杆菌肺组织感染相关的基因第75-78页
     ·副猪嗜血杆菌铁应激相关的基因第78-81页
     ·副猪嗜血杆菌高温应激相关的基因第81-85页
第3章 副猪嗜血杆菌感染和应激相关蛋白的免疫原性的研究第85-103页
   ·前言第85页
   ·材料和方法第85-95页
     ·主要试剂第85-86页
     ·主要缓冲液第86-87页
     ·预测候选抗原蛋白的信号肽第87页
     ·菌株和培养条件,血清,质粒和引物第87-89页
     ·实验动物第89页
     ·候选抗原基因在不同血清型的菌株中的分布第89-90页
     ·候选抗原基因的克隆表达以及纯化第90-91页
     ·SDS-PAGE电泳与Western blot第91-93页
     ·流式细胞术分析蛋白的表面分布第93页
     ·免疫保护性抗原对细胞的粘附作用第93页
     ·动物实验第93-95页
   ·结果与分析第95-101页
     ·免疫原性蛋白的基因在其它各类血清型中的分布情况检测第95页
     ·免疫原性蛋白的重组表达纯化第95-97页
     ·流式细胞术分析蛋白的表面分布第97页
     ·免疫保护性抗原对细胞的粘附作用第97-99页
     ·仔猪抗体水平评价第99页
     ·蛋白对仔猪免疫效力实验第99-101页
   ·讨论第101-103页
     ·抗原蛋白特性分析第101-102页
     ·保护性抗原的筛选鉴定第102-103页
第4章 副猪嗜血杆菌感染和应激相关蛋白与宿主蛋白质的相互作用第103-128页
   ·前言第103-104页
   ·材料第104-110页
     ·菌株,质粒,引物及文库第104-108页
     ·主要分子生物学试剂第108-110页
   ·方法第110-115页
     ·重组载体的构建第110页
     ·酵母菌的高效转化第110页
     ·检测诱饵质粒的自激活第110-111页
     ·Mating筛选阳性克隆第111页
     ·β-半乳糖苷酶检测lacZ报告基因的表达第111页
     ·阳性酵母菌落所含质粒的提取第111页
     ·Prey质粒的分离第111-112页
     ·阳性酵母菌落的回转实验验证第112页
     ·生物信息学分析方法第112页
     ·诱饵蛋白的原核表达载体的构建第112-113页
     ·候选阳性克隆的原核表达载体的构建第113页
     ·蛋白质表达纯化以及SDS-PAGE和Western blot验证第113-114页
     ·Pull-down体外验证实验第114页
     ·诱饵蛋白的真核表达载体的构建第114页
     ·质粒转染(脂质体介导转染法)第114-115页
     ·CFDA-SE细胞增殖与示踪检测试剂盒的检测第115页
   ·结果与分析第115-123页
     ·诱饵重组载体的构建和鉴定第115-116页
     ·诱饵蛋白功能域预测第116-117页
     ·诱饵质粒自激活的验证第117页
     ·测序和BLAST分析第117-118页
     ·阳性酵母菌落的回转实验验证第118页
     ·Prey蛋白功能域预测第118-119页
     ·诱饵蛋白原核重组载体的构建和鉴定第119页
     ·Prey蛋白原核重组载体的构建和鉴定第119-120页
     ·蛋白质表达纯化以及SDS-PAGE和Western blot验证第120-121页
     ·PilA,ArcB和SiaB蛋白与宿主蛋白作用方式的预测第121-122页
     ·Pull-down体外验证实验第122页
     ·诱饵蛋白真核重组载体的构建和鉴定第122-123页
     ·CFDA-SE细胞增殖与示踪检测试剂盒的检测第123页
   ·讨论第123-128页
     ·酵母双杂交技术筛选副猪嗜血杆菌与宿主发生互作的蛋白第123-124页
     ·PilA,ArcB和SiaB与致病性的关系第124-125页
     ·酵母双杂交系统的假阳性第125页
     ·Pull-down体外验证实验第125页
     ·PilA与宿主细胞增殖的关系第125-126页
     ·ArcB与副猪嗜血杆菌与宿主免疫逃避的关系第126页
     ·SiaB与副猪嗜血杆菌与宿主免疫逃避的关系第126-128页
结论与展望第128-129页
参考文献第129-150页
致谢第150-151页
附录第151页

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