| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 符号及缩略词对照表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-17页 |
| 1 昆虫病原线虫的研究及运用现状 | 第11-13页 |
| 2 线虫繁殖有关通路的研究 | 第13页 |
| 3 高通量测序技术及其在寄生线虫类动物研究中的应用 | 第13-15页 |
| 4 研究的目的和意义 | 第15-17页 |
| 第二章 正文 | 第17-43页 |
| 1 实验材料和方法 | 第17-24页 |
| 1.1 实验材料 | 第17-18页 |
| 1.1.1 实验样品 | 第17页 |
| 1.1.2 实验试剂 | 第17-18页 |
| 1.1.3 实验仪器 | 第18页 |
| 1.2 实验方法 | 第18-24页 |
| 1.2.1 培养基和溶液的配制 | 第18-19页 |
| 1.2.2 单菌线虫组合DZ/S1、DZ/186的制备 | 第19页 |
| 1.2.3 单菌线虫的收集和培养 | 第19-20页 |
| 1.2.4 单菌线虫的验证 | 第20页 |
| 1.2.5 单菌线虫总RNA的提取 | 第20-22页 |
| 1.2.6 DGE测序文库的构建及测序 | 第22页 |
| 1.2.7 DGE测序结果及与参考转录组序列的比对 | 第22-23页 |
| 1.2.8 差异表达基因的筛选和功能注释 | 第23-24页 |
| 1.2.9 定量PCR验证 | 第24页 |
| 2 结果与分析 | 第24-40页 |
| 2.1 单菌线虫的验证 | 第24-26页 |
| 2.2 单菌线虫总RNA的提取和质量检测 | 第26-27页 |
| 2.3 DGE测序数据的评估 | 第27-30页 |
| 2.3.1 DGE测序质量评估 | 第27-28页 |
| 2.3.2 DGE测序饱和度分析 | 第28页 |
| 2.3.3 DGE测序随机性分析 | 第28-29页 |
| 2.3.4 DGE测序产量和数据比对统计 | 第29-30页 |
| 2.4 差异表达基因的筛选 | 第30-32页 |
| 2.4.1 基因覆盖度统计 | 第30页 |
| 2.4.2 基因表达丰度统计 | 第30-31页 |
| 2.4.3 差异表达基因的筛选 | 第31-32页 |
| 2.5 差异表达基因的功能注释 | 第32-35页 |
| 2.5.1 差异表达基因的GO功能注释 | 第32-34页 |
| 2.5.2 差异表达基因的pathway功能注释 | 第34-35页 |
| 2.6 定量PCR验证 | 第35-38页 |
| 2.7 共生相关基因富集通路的研究 | 第38-40页 |
| 3 讨论 | 第40-43页 |
| 参考文献 | 第43-51页 |
| 全文总结 | 第51-53页 |
| 本文创新之处 | 第53-55页 |
| 附录Ⅰ | 第55-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
