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组蛋白去乙酰化酶及其结合蛋白调控开花时间的机制研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略词表第10-12页
第一章 文献综述第12-35页
    1.1 植物开花调控途径的研究第12-22页
        1.1.1 光周期途径第13-17页
        1.1.2 春化途径第17-19页
        1.1.3 自主途径第19-20页
        1.1.4 赤霉素途径第20-22页
        1.1.5 其他途径第22页
    1.2 组蛋白修饰在开花调控中的作用第22-26页
        1.2.1 组蛋白修饰与转录第22-24页
        1.2.2 组蛋白修饰对FLC的调控第24-26页
        1.2.3 组蛋白修饰对FT的调控第26页
    1.3 组蛋白去乙酰化酶的相关研究第26-33页
        1.3.1 组蛋白去乙酰化酶的分类第27-28页
        1.3.2 HD2相关蛋白家族的功能研究第28-29页
        1.3.3 SIR2家族的功能研究第29-30页
        1.3.4 RPD3家族的功能研究第30-33页
    1.4 本研究拟解决的问题和意义第33-35页
第二章 实验材料与方法第35-52页
    2.1 实验材料第35-36页
        2.1.1 植物材料第35页
        2.1.2 实验菌株和载体第35-36页
    2.2 实验试剂第36页
        2.2.1 本研究中所涉及的主要关键试剂第36页
        2.2.2 本研究所用到的主要试剂盒第36页
    2.3 相关培养基和试剂的配置第36-40页
        2.3.1 植物MS固体培养基第36-37页
        2.3.2 农杆菌培养基YEB第37页
        2.3.3 种子灭菌次氯酸钠溶液第37页
        2.3.4 转基因浸染液第37页
        2.3.5 DNA提取CTAB溶液第37-38页
        2.3.6 亲和纯化,蛋白质免疫印迹,凝胶过滤用植物蛋白裂解液第38页
        2.3.7 Southern印迹杂交用各种试剂第38页
        2.3.8 染色质免疫共沉淀用各种试剂第38-40页
    2.4 本研究所用到的主要仪器第40-41页
    2.5 实验方法第41-52页
        2.5.1 拟南芥的培养第41页
        2.5.2 植物表达载体的构建与转基因植株的获得第41-42页
        2.5.3 农杆菌感受态的制作和质粒转化第42页
        2.5.4 农杆菌花序浸染法转基因第42-43页
        2.5.5 拟南芥基因组DNA的提取第43-44页
        2.5.7 酶切RCR第44页
        2.5.8 Southern印迹杂交第44-45页
        2.5.9 亲和纯化第45-46页
        2.5.10 RNA的提取与RT-PCR第46-47页
        2.5.11 凝胶过滤实验第47-49页
        2.5.12 染色质免疫共沉淀第49-51页
        2.5.13 RNA-seq和ChIP-seq数据处理与展示第51-52页
第三章 结果与分析第52-79页
    3.1 HDC1和SNLs可与HDA6或HDA19相互作用形成多亚基复合体第52-56页
    3.2 HDC1不参与HDA6介导DNA甲基化和转录沉默第56-57页
    3.3 长日照条件下HDC1促进开花的机制与HDA6不同第57-60页
    3.4 HDC1调控开花时间依赖于光周期第60-63页
    3.5 组蛋白去乙酰化酶复合体组分HDC1、HDA19和SNLs都以光周期依赖的方式调控开花第63-68页
    3.6 长日照下突变体hdc1、hda19和hda6的转录组分析第68-69页
    3.7 长日照下HDC1和HDA19参与了开花抑制基因GASA5和GA2OX6的组蛋白去乙酰化和转录抑制第69-72页
    3.8 短日照下突变体hdc1、hda19和hda6的转录组分析第72-74页
    3.9 长短日照下突变体hdc1、hda19和hda6的转录组比较分析第74页
    3.10 全基因组水平上突变体hdc1、hda19和hda6对转录和组蛋白乙酰化的影响第74-77页
    3.11 短日照下HDC1和HAD19的调控靶点检测第77-79页
第四章 讨论与分析第79-84页
    4.1 HDA6和HDA19除了以复合体形式发挥作用外也可以单独起作用第79页
    4.2 长日照下HDC1调控开花的作用机制与HDA6不同第79-80页
    4.3 长日照下HDC1调控开花的可能作用机制第80页
    4.4 MSI1依赖光周期的开花调控功能部分来自HDA19组蛋白去乙酰化酶复合体第80-81页
    4.5 SIN3类似蛋白调控开花时间的作用机制第81-82页
    4.6 短日照下HDA19复合体的作用机制第82页
    4.7 HDA19复合体以依赖光周期的方式调控开花时间第82-84页
第五章 结论与展望第84-86页
参考文献第86-101页
附录第101-104页
致谢第104-105页
作者简历第105页

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