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黑斑侧褶蛙Temporin抗菌肽基因内含子进化模式的研究

摘要第4-5页
Abstract第5页
1 绪论第8-19页
    1.1 两栖类概况第8-10页
        1.1.1 两栖动物种类及地理分布格局第8-10页
        1.1.2 生存环境及现状第10页
    1.2 黑斑侧褶蛙概况第10-17页
        1.2.1 分类地位与分布第10页
        1.2.2 生物学特征、生存环境与食性第10-11页
        1.2.3 黑斑侧褶蛙分子系统地理学研究现状第11-13页
        1.2.4 黑斑侧褶蛙免疫系统第13-14页
        1.2.5 黑斑侧褶蛙皮肤抗菌肽研究概况第14-16页
        1.2.6 DNA复制过程中的异常现象第16-17页
    1.3 内含子的生物功能第17-18页
        1.3.1 内含子的起源与种类第17页
        1.3.2 内含子的生物功能第17-18页
    1.4 本研究的目的与意义第18-19页
2 材料与方法第19-27页
    2.1 样品的采集第19页
    2.2 样品的分类处理第19-21页
    2.3 实验用仪器设备与相关试剂第21-22页
        2.3.1 实验所用仪器第21页
        2.3.2 实验所用试剂第21-22页
    2.4 实验方法第22-27页
        2.4.1 基因组总DNA的提取第22-23页
        2.4.2 线粒体D-loop区的获取第23页
        2.4.3 内含子的获得第23-26页
        2.4.4 测序结果分析第26-27页
3 结果与分析第27-50页
    3.1 总DNA的提取第27页
    3.2 线粒体D-loop区序列分析第27-34页
        3.2.1 线粒体D-loop区扩增结果第27页
        3.2.2 种群系统发育关系第27-31页
        3.2.3 种群遗传多样性第31-32页
        3.2.4 种群结构和历史动态分析第32-33页
        3.2.5 种群间遗传分化和基因交流第33-34页
    3.3 黑斑侧褶蛙Temporin基因分析第34-44页
        3.3.1 Temporin基因PCR扩增结果第34-35页
        3.3.2 Temporin基因的结构第35页
        3.3.3 成熟肽区域理化性质及二级结构预测第35-36页
        3.3.4 内含子碱基组成及结构特点第36页
        3.3.5 内含子的系统发育分析第36-40页
        3.3.6 内含子遗传分化与基因流第40页
        3.3.7 内含子中性检验第40-41页
        3.3.8 内含子各种调控元件结构预测第41-42页
        3.3.9 内含子中作用元件变异情况分析第42-44页
    3.4 Temporin基因内含子复制过程的跳跃现象第44-50页
        3.4.1 分段内含子PCR结果第44-45页
        3.4.2 内含子扩增双带现象验证第45-46页
        3.4.3 内含子Jumping扩增分析第46-50页
4 讨论第50-55页
    4.1 Temporin基因内含子的进化模式第50-53页
        4.1.1 内含子的遗传多样性第50页
        4.1.2 内含子的系统进化第50-51页
        4.1.3 内含子的选择压力第51-52页
        4.1.4 内含子作用元件的选择压力第52-53页
    4.2 嫩江(NJ)种群的独特性第53页
    4.3 DNA体外复制过程中的Jumping现象第53-55页
结论第55-56页
参考文献第56-63页
附录第63-64页
攻读学位期间发表的学术论文第64-65页
致谢第65-67页

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