| 致谢 | 第4-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-22页 |
| 1.1 玉米赤霉烯酮的定义 | 第11-15页 |
| 1.1.1 玉米赤霉烯酮的概述 | 第11页 |
| 1.1.2 玉米赤霉烯酮的结构及理化性质 | 第11页 |
| 1.1.3 玉米赤霉烯酮的危害 | 第11-12页 |
| 1.1.4 玉米赤霉烯酮的污染现状和限量标准 | 第12-13页 |
| 1.1.5 玉米赤霉烯酮的脱毒方法 | 第13-14页 |
| 1.1.6 玉米赤霉烯酮的检测方法 | 第14页 |
| 1.1.7 细菌降解玉米赤霉烯酮在分子生物学方面的研究 | 第14-15页 |
| 1.2 解淀粉芽孢杆菌的研究现状及其发酵条件的优化 | 第15-19页 |
| 1.2.1 解淀粉芽孢杆菌的概念 | 第15页 |
| 1.2.2 解淀粉芽孢杆菌的应用 | 第15-17页 |
| 1.2.3 培养基和培养条件的优化 | 第17-18页 |
| 1.2.4 发酵工艺优化方法 | 第18-19页 |
| 1.3 高通量测序的研究进展 | 第19-22页 |
| 1.3.1 高通量测序技术的发展 | 第19-20页 |
| 1.3.2 转录组测序简介 | 第20-21页 |
| 1.3.3 转录组在细菌研究中的应用 | 第21-22页 |
| 2 解淀粉芽孢杆菌H6发酵条件的优化 | 第22-36页 |
| 2.1 引言 | 第22页 |
| 2.2 材料与方法 | 第22-24页 |
| 2.2.1 菌株来源 | 第22页 |
| 2.2.2 试验试剂 | 第22页 |
| 2.2.3 实验仪器与设备 | 第22-23页 |
| 2.2.4 培养基 | 第23-24页 |
| 2.3 方法 | 第24-27页 |
| 2.3.1 菌株的鉴定 | 第24-25页 |
| 2.3.2 菌株发酵条件的优化 | 第25-27页 |
| 2.4 结果 | 第27-33页 |
| 2.4.1 细菌的16SrRNA基因鉴定 | 第27页 |
| 2.4.2 发酵培养基组成成分的优化 | 第27-33页 |
| 2.5 讨论与小结 | 第33-36页 |
| 2.5.1 讨论 | 第33-34页 |
| 2.5.2 小结 | 第34-36页 |
| 3 玉米赤霉烯酮降解菌H6的转录组测序分析 | 第36-54页 |
| 3.1 引言 | 第36页 |
| 3.2 材料 | 第36页 |
| 3.2.1 材料 | 第36页 |
| 3.2.2 试剂 | 第36页 |
| 3.2.3 仪器设备 | 第36页 |
| 3.2.4 培养基 | 第36页 |
| 3.3 方法 | 第36-43页 |
| 3.3.1 样品的处理 | 第36-37页 |
| 3.3.2 上机测序 | 第37-38页 |
| 3.3.3 生物信息学分析 | 第38页 |
| 3.3.4 原始数据质量评估 | 第38-39页 |
| 3.3.5 测序reads比对与拼接 | 第39页 |
| 3.3.6 基因表达水平的分析 | 第39页 |
| 3.3.7 差异表达基因的分析 | 第39页 |
| 3.3.8 差异基因的的GO和KEGG富集分析 | 第39-40页 |
| 3.3.9 差异基因的qRT-PCR验证 | 第40-43页 |
| 3.4 结果与分析 | 第43-50页 |
| 3.4.1 RNA样品质量检测结果 | 第43-44页 |
| 3.4.2 转录组测序原始数据数据分析 | 第44-45页 |
| 3.4.3 基因组比对分析 | 第45-46页 |
| 3.4.4 差异表达基因分析 | 第46页 |
| 3.4.5 差异基因GO富集分析 | 第46-47页 |
| 3.4.6 差异基因KEGG富集分析 | 第47-49页 |
| 3.4.7 qRT-PCR验证测序结果 | 第49-50页 |
| 3.5 讨论 | 第50-53页 |
| 3.5.1 细菌转录组数据质量评估 | 第51页 |
| 3.5.2 差异基因分析 | 第51页 |
| 3.5.3 GO和KEGG富集分析 | 第51-53页 |
| 3.6 小结 | 第53-54页 |
| 4 全文总结 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-64页 |
| ABSTRACT | 第64-66页 |