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构巢曲霉细胞产隔起始网SIN途径调节子的功能和分子特征研究

摘要第3-6页
Abstract第6-8页
第一章 绪论第17-36页
    1 胞质分裂的研究进展第17-32页
        1.1 概述第17-19页
        1.2 真核生物的胞质分裂第19-26页
            1.2.1 胞质分裂位点的选择第19-23页
                1.2.1.1 芽殖酵母S.cerevisiae出芽位点的选择第20-21页
                1.2.1.2 裂殖酵母S.pombe分裂位点的选择第21-22页
                1.2.1.3 丝状真菌隔膜形成位点的选择第22-23页
            1.2.2 胞质分裂过程中的蛋白复合体的有序激活第23-26页
                1.2.2.1 Septin环第23-25页
                1.2.2.2 Acto-Myosin环第25-26页
            1.2.3 肌动蛋白环的收缩第26页
        1.3 胞质分裂与有丝分裂的关系第26-30页
            1.3.1 有丝分裂退出网络MEN第27-28页
            1.3.2 隔膜形成初始化网络SIN第28-30页
        1.4 胞质分裂的主要研究方向第30-31页
        1.5 构巢曲霉的简介第31-32页
    2 胞质分裂的调控第32-34页
        2.1 SIN途径的调节因子第33-34页
            2.1.1 蛋白磷酸酶第33页
            2.1.2 蛋白激酶第33-34页
            2.1.3 泛素化作用第34页
            2.1.4 其他的调节因子第34页
    3 研究内容与技术路线第34-36页
        3.1 研究内容第34-35页
        3.2 技术路线第35-36页
第二章 构巢曲霉细胞产隔起始网SI的反向调节子Prs家族的功能研究第36-93页
    第一节 构巢曲霉Prs生物信息学分析第37-46页
        1 材料与方法第37页
            1.1 三个PRPP合成酶蛋白的生物信息学分析第37页
        2 实验结果第37-44页
        3 讨论第44-46页
    第二节 AnprsA,AnprsB和AnprsC的鉴定第46-61页
        1 材料与方法第46-56页
            1.1 菌株,培养条件,仪器,培养基第46-48页
            1.2 敲除菌株构建引物第48-49页
            1.3 构巢曲霉的DNA提取的方法第49-50页
                1.3.1 试剂第49-50页
                1.3.2 DNA提取的步骤第50页
            1.4 敲除菌株载体的构建第50-54页
                1.4.1 扩增各个片段并进行融合PCR第50-52页
                1.4.2 将融合片段装载至pEasy-blunt Zero Cloning载体第52-54页
                    1.4.2.1 大肠杆菌E.coli的转化反应第52-53页
                    1.4.2.2 菌落PCR的方法鉴定阳性克隆第53-54页
            1.5 构巢曲霉的转化实验第54-56页
                1.5.1 构巢曲霉转化过程的溶液第54-55页
                1.5.2 构巢曲霉转化步骤第55-56页
            1.6 构巢曲霉的液体菌丝的显微镜观察方法第56页
        2 实验结果第56-60页
            2.1 敲除菌株的验证第56-58页
            2.2 敲除菌株的表型第58-60页
        3 讨论第60-61页
    第三节 AnPrsA,AnPrsB和AnPrsC的定位和表达第61-72页
        1 材料与方法第61-66页
            1.1 菌株,培养条件,培养基第61页
            1.2 条件菌株构建第61-62页
                1.2.1 试剂第61页
                1.2.2 引物第61-62页
                1.2.3 条件菌株载体的构建第62页
            1.3 构巢曲霉的转化实验第62-63页
            1.4 显微镜观察构巢曲霉中荧光标记蛋白的定位方法第63页
                1.4.1 仪器第63页
                1.4.2 实验步骤第63页
            1.5 Western blotting实验第63-65页
                1.5.1 试剂第63-64页
                1.5.2 Western blotting的具体步骤第64-65页
            1.6 构巢曲霉的液体菌丝的形态观察实验第65-66页
        2 实验结果第66-71页
            2.1 条件菌株的验证第66-68页
            2.2 条件菌株的表型及Western blotting验证结果第68-70页
            2.3 条件菌株进一步证明AnprsB和AnprsC是营养缺陷型基因第70-71页
        3 讨论第71-72页
    第四节 除了AnprsA,AnprsB和AnprsC是菌丝延伸所必需的基因第72-75页
        1 材料与方法第72-73页
            1.1 菌株,培养条件,培养基第72页
            1.2 转换培养基的方法第72-73页
            1.3 菌丝干重的称量方法第73页
        2 实验结果第73-74页
        3 讨论第74-75页
    第五节 AnprsA,AnprsB和AnprsC的mRNA水平和对Prs总酶活的贡献第75-87页
        1 材料与方法第75-84页
            1.1 菌株,培养条件,培养基第75页
            1.2 引物第75-76页
            1.3 RT-PCR (real-time fluorescence quantitative PCR)检测不同生长时期的三个基因的RNA方法第76-78页
                1.3.1 构巢曲霉RNA的提取第76页
                1.3.2 构巢曲霉RNA的消化及验证第76-78页
                1.3.3 RT-PCR的实验方法第78页
            1.4 Northern blotting实验第78-83页
                1.4.1 试剂第79-81页
                1.4.2 同位素标记的探针第81-82页
                1.4.3 Northern blotting的具体步骤第82-83页
            1.5 Prs酶活测定的方法第83-84页
                1.5.1 试剂第83-84页
                1.5.2 实验方法第84页
        2 实验结果第84-86页
            2.1 Northern blotting和RT-PCR的结果第84-85页
            2.2 Prs酶活的结果第85-86页
        3 讨论第86-87页
    第六节 Prs家族成员之间的关系的探究第87-93页
        1 材料与方法第87-88页
            1.1 菌株,培养条件,培养基第87页
            1.2 互补菌株的构建第87-88页
                1.2.1 引物第87-88页
                1.2.2 互补载体的构建第88页
                    1.2.2.1 扩增各个片段并进行融合PCR第88页
                    1.2.2.2 将融合片段装载至pEasy-blunt Zero Cloning载体第88页
            1.3 构巢曲霉的转化实验第88页
            1.4 RT-PCR检测三个基因在回补菌株中的mRNA第88页
            1.5 Prs酶活的测定第88页
        2 实验结果第88-91页
            2.1 回补菌株的验证第88-89页
            2.2 回补菌株的菌落表型第89-91页
            2.3 RT-PCR的结果第91页
            2.4 Prs酶活的结果第91页
        3 讨论第91-93页
第三章 构巢曲霉细胞产隔起始网SIN途径的调节子PP2A-ParA和PP2A-PabA的功能研究第93-125页
    第一节 构巢曲霉PP2A-ParA和PP2A-PabA的鉴定第93-103页
        1 材料方法第93-97页
            1.1 菌株,培养条件,培养基第93-94页
            1.2 敲除载体构建的引物第94-95页
            1.3 敲除菌株的构建第95-96页
                1.3.1 敲除载体的构建第95-96页
                    1.3.1.1 扩增各个片段并进行融合PCR第95-96页
                    1.3.1.2 融合片段装载至pEasy-blunt Zero Cloning载体第96页
            1.4 构巢曲霉的转化实验第96页
            1.5 体视镜观察构巢曲霉的无性产孢以及有性生殖的方法第96页
                1.5.1 构巢曲霉的无性产孢的观察第96页
                1.5.2 构巢曲霉的有性生殖形成闭囊壳的方法第96页
            1.6 插片法观察构巢曲霉的产孢结构第96页
            1.7 构巢曲霉的液体菌丝的形态观察实验第96-97页
        2 实验结果第97-101页
            2.1 构巢曲霉的△parA和△pabA菌株的验证第97-98页
            2.2 构巢曲霉的ParA和PabA参与无性产孢、有性生殖及产隔过程第98-101页
                2.2.1 parA和pabA缺失影响构巢曲霉的菌丝生长和无性产孢第98-99页
                2.2.2 parA和pabA缺失导致形成异常的产孢结构第99页
                2.2.3 parA和pabA缺失导致构巢曲霉不能进行有性生殖过程第99-100页
                2.2.4 parA和pabA缺失导致构巢曲霉隔膜间距异常第100-101页
        3 讨论第101-103页
    第二节 构巢曲霉PP2A-ParA和PP2A-PabA的细胞学定位和对隔膜形成的功能以及对酶活的贡献第103-121页
        1 材料方法第103-112页
            1.1 菌株,培养条件,培养基第103页
            1.2 条件菌株的构建第103-104页
                1.2.1 条件菌株构建的引物第103页
                1.2.2 条件菌株载体的构建第103-104页
            1.3 过表达菌株的构建第104-105页
                1.3.1 过表达菌株构建的引物第104页
                1.3.2 过表达载体的构建第104-105页
            1.4 Western blotting方法验证条件菌株第105-106页
            1.5 显微镜观察GFP-ParA和GFP-PabA的定位第106页
            1.6 RT-PCR检测过表达菌株的实验方法第106页
                1.6.1 RT引物第106页
                1.6.2 实验方法第106页
            1.7 双敲菌株△parA△pabA的构建第106-107页
            1.8 构巢曲霉的液体菌丝的形态观察实验第107页
            1.9 PP2A酶活的测定的方法第107-112页
                1.9.1 试剂第107-109页
                1.9.2 测定PP2A酶活的实验方法第109-112页
        2 实验结果第112-120页
            2.1 条件菌株的验证第112页
            2.2 条件菌株的菌落表型第112-113页
            2.3 Western blotting验证条件菌株第113-114页
            2.4 GFP-ParA和GFP-PabA的细胞学定位第114-116页
            2.5 双敲菌株及过表达菌株的菌落表型第116-117页
            2.6 双敲菌株及过表达菌株的液体培养下的产隔表型第117-119页
            2.7 RT-PCR的实验结果第119页
            2.8 PP2A酶活测定的实验结果第119-120页
        3 讨论第120-121页
    第三节 构巢曲霉ParA和PabA与SIN途径成员SepH、SepA关系的探究第121-125页
        1 材料方法第121-122页
            1.1 菌株,培养条件,培养基第121页
            1.2 构巢曲霉的菌株杂交实验第121页
            1.3 构巢曲霉的液体菌丝的形态观察实验第121-122页
        2 实验结果第122-123页
            2.1 杂交菌株的菌落表型及产隔表型第122-123页
        3 讨论第123-125页
第四章 构巢曲霉细胞产隔起始网SIN途径新的调节子的筛选与功能研究第125-159页
    第一节 转录组分析与注释OE::parA菌株中表达量变化的相关基因第125-128页
        1 材料与方法第125-126页
            1.1 菌株,培养条件,培养基第125-126页
            1.2 RNA-seq实验方法第126页
        2 实验结果第126-127页
        3 讨论第127-128页
    第二节 parA反向调节子的筛选与初步鉴定第128-142页
        1 材料与方法第128-134页
            1.1 菌株,培养条件与培养基第128页
            1.2 RT检测RNA-seq结果的方法第128-129页
                1.2.1 RT引物第128-129页
                1.2.2 RT-PCR的实验方法第129页
            1.3 五个候选基因的敲除及高表达菌株的构建第129-134页
                1.3.1 试剂第129页
                1.3.2 敲除以及高表达载体构建的引物第129-131页
                1.3.3 敲除载体的构建第131-132页
                    1.3.3.1 扩增各个片段并进行融合PCR第131-132页
                    1.3.3.2 将融合片段装载至pEasy-blunt Zero Cloning载体第132页
                1.3.4 高表达载体的构建第132-134页
            1.4 构巢曲霉的转化实验第134页
            1.5 构巢曲霉的液体菌丝产生隔膜的观察方法第134页
        2 实验结果第134-141页
            2.1 RT结果第134-135页
            2.2 构巢曲霉转化子的筛选以及相应菌落的鉴定第135-139页
                2.2.1 敲除菌株的验证第135-137页
                2.2.2 敲除菌株的菌落表型第137-138页
                2.2.3 高表达菌株的验证第138页
                2.2.4 高表达菌株的菌落表型第138-139页
            2.3 OE::parA背景下的敲除菌株和高表达菌株的液体培养下的产隔表型第139-141页
        3 讨论第141-142页
    第三节 细胞隔膜起始网SIN途径中parA与mztA关系的探究第142-159页
        1 材料与方法第142-147页
            1.1 菌株,培养条件,培养基第142-143页
            1.2 高表达回补菌株构建第143-144页
                1.2.1 试剂第143页
                1.2.2 引物第143页
                1.2.3 基因回补载体的构建第143-144页
                    1.2.3.1 扩增各个片段并进行融合PCR第143-144页
                    1.2.3.2 将融合片段装载至pEasy-blunt Zero Cloning载体第144页
            1.3 条件菌株的构建第144-145页
                1.3.1 试剂第144页
                1.3.2 引物第144-145页
                1.3.3 酒精启动子控制基因表达的载体的构建第145页
            1.4 构巢曲霉的转化实验第145页
            1.5 Northern blotting实验第145-146页
                1.5.1 引物第145页
                1.5.2 实验方法第145-146页
            1.6 构巢曲霉的液体菌丝产生隔膜的观察方法第146页
            1.7 构巢曲霉的杂交实验第146页
            1.8 插片法观察产孢结构第146-147页
            1.9 构巢曲霉液体菌丝观察荧光标记蛋白的定位的方法第147页
        2 实验结果第147-157页
            2.1 基因回补菌株的验证第147-148页
            2.2 基因回补菌株的表型第148-149页
            2.3 mztA缺失造成产隔推迟并导致隔膜间距变宽第149-151页
            2.4 parA和mztA不同时间点的mRNA表达量第151页
            2.5 双敲除菌株△parA△mztA的验证第151-152页
            2.6 双敲除菌株△parA△mztA恢复正常产隔以及产孢结构上未出现隔膜第152-154页
            2.7 双敲除菌株△parA△mztA影响菌丝生长第154页
            2.8 条件菌株的验证第154-155页
            2.9 过表达parA会导致MobA无法正常定位于SPB位置第155-157页
        3 讨论第157-159页
第五章 全文总结第159-162页
参考文献第162-178页
在读期间发表的学术论文第178-179页
致谢第179-180页

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