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基于MapReduce的全基因组关联分析技术研究与实现

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第1章 绪论第12-18页
    1.1 研究背景与意义第12-16页
    1.2 本文的组织结构第16-18页
第2章 相关工作第18-30页
    2.1 特征选择简介第18-22页
        2.1.1 特征选择定义第18-19页
        2.1.2 特征子集产生过程第19-20页
        2.1.3 特征子集评价函数第20-22页
    2.2 传统特征选择方法第22-25页
        2.2.1 Filter方法第22-23页
        2.2.2 Wrapper方法第23-24页
        2.2.3 Embedded方法第24-25页
    2.3 交互特征选择第25-27页
        2.3.1 两位点交互特征选择第25-26页
        2.3.2 多位点交互特征选择第26-27页
    2.4 Hadoop平台介绍第27-29页
        2.4.1 HDFS分布式文件系统第27-28页
        2.4.2 MapReduce分布式计算模型第28-29页
    2.5 本章小结第29-30页
第3章 基本概念和问题定义第30-42页
    3.1 基本概念第30-39页
        3.1.1 极大公共子序列第30-32页
        3.1.2 最小独立支配集第32页
        3.1.3 相关特征第32-35页
        3.1.4 交互特征第35-39页
    3.2 问题定义第39-40页
    3.3 本章小结第40-42页
第4章 基于MapReduce的全基因组关联分析算法第42-58页
    4.1 整体框架第42-44页
    4.2 关联区域划分第44-45页
        4.2.1 极大公共子序列第44-45页
        4.2.2 区域划分算法第45页
    4.3 关联区域选择第45-47页
        4.3.1 区域多样性第45-46页
        4.3.2 区域多样性选择算法第46-47页
    4.4 关联区域约简第47-49页
        4.4.1 一致性贡献率第47-48页
        4.4.2 关联区域约简算法第48-49页
    4.5 高阶非冗余交互发现第49-56页
        4.5.1 多位点互信息第49-53页
        4.5.2 削减策略第53-54页
        4.5.3 高阶非冗余交互发现算法第54-56页
    4.6 本章小结第56-58页
第5章 实验结果与性能分析第58-66页
    5.1 实验环境与数据集第58-59页
    5.2 算法效率分析第59-62页
        5.2.1 单机效率分析第59-61页
        5.2.2 集群效率分析第61-62页
    5.3 算法有效性分析第62-64页
        5.3.1 生物意义第62-63页
        5.3.2 分类准确率第63-64页
    5.4 本章小结第64-66页
第6章 工作总结与展望第66-68页
    6.1 工作总结第66页
    6.2 工作展望第66-68页
参考文献第68-74页
致谢第74-76页
攻读硕士期间发表的论文及参与的项目第76页

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