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蛋白质—配体柔性对接相关计算问题研究

摘要第4-5页
Abstract第5页
第一章 绪论第9-13页
    1.1 研究背景第9-10页
    1.2 研究内容第10-11页
    1.3 研究的意义第11-12页
    1.4 本文组织结构第12-13页
第二章 相关技术概述第13-23页
    2.1 蛋白质结构第13-16页
        2.1.1 氨基酸的结构第13页
        2.1.2 蛋白质一级结构第13-14页
        2.1.3 蛋白质二级结构第14页
        2.1.4 蛋白质三级结构第14-15页
        2.1.5 蛋白质四级结构第15-16页
    2.2 分子对接第16-17页
    2.3 分子动力学模拟第17-20页
        2.3.1 历史背景第17页
        2.3.2 统计力学第17-19页
        2.3.3 经典力学第19-20页
    2.4 分子构象搜索算法第20-21页
    2.5 打分函数第21-22页
        2.5.1 基于分子力场的打分函数第21-22页
        2.5.2 经验势能打分函数第22页
        2.5.3 基于知识的打分函数第22页
    2.6 本章小结第22-23页
第三章 基于 pose 共享的蛋白质-配体构象并行搜索算法第23-31页
    3.1 材料与方法第25-27页
    3.2 实验结果第27-29页
    3.3 分析与讨论第29-30页
    3.4 本章小结第30-31页
第四章 基于 pose 信息共享的搜索算法在集合对接中的应用第31-40页
    4.1 材料与方法第32-35页
    4.2 实验结果第35-38页
    4.3 分析与讨论第38-39页
    4.4 本章小结第39-40页
第五章 总结与展望第40-42页
    5.1 工作总结第40页
    5.2 研究展望第40-42页
参考文献第42-47页
攻读学位期间公开发表的论文与参与的科研项目第47-48页
致谢第48-49页

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