摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第一章 绪论 | 第9-13页 |
1.1 研究背景 | 第9-10页 |
1.2 研究内容 | 第10-11页 |
1.3 研究的意义 | 第11-12页 |
1.4 本文组织结构 | 第12-13页 |
第二章 相关技术概述 | 第13-23页 |
2.1 蛋白质结构 | 第13-16页 |
2.1.1 氨基酸的结构 | 第13页 |
2.1.2 蛋白质一级结构 | 第13-14页 |
2.1.3 蛋白质二级结构 | 第14页 |
2.1.4 蛋白质三级结构 | 第14-15页 |
2.1.5 蛋白质四级结构 | 第15-16页 |
2.2 分子对接 | 第16-17页 |
2.3 分子动力学模拟 | 第17-20页 |
2.3.1 历史背景 | 第17页 |
2.3.2 统计力学 | 第17-19页 |
2.3.3 经典力学 | 第19-20页 |
2.4 分子构象搜索算法 | 第20-21页 |
2.5 打分函数 | 第21-22页 |
2.5.1 基于分子力场的打分函数 | 第21-22页 |
2.5.2 经验势能打分函数 | 第22页 |
2.5.3 基于知识的打分函数 | 第22页 |
2.6 本章小结 | 第22-23页 |
第三章 基于 pose 共享的蛋白质-配体构象并行搜索算法 | 第23-31页 |
3.1 材料与方法 | 第25-27页 |
3.2 实验结果 | 第27-29页 |
3.3 分析与讨论 | 第29-30页 |
3.4 本章小结 | 第30-31页 |
第四章 基于 pose 信息共享的搜索算法在集合对接中的应用 | 第31-40页 |
4.1 材料与方法 | 第32-35页 |
4.2 实验结果 | 第35-38页 |
4.3 分析与讨论 | 第38-39页 |
4.4 本章小结 | 第39-40页 |
第五章 总结与展望 | 第40-42页 |
5.1 工作总结 | 第40页 |
5.2 研究展望 | 第40-42页 |
参考文献 | 第42-47页 |
攻读学位期间公开发表的论文与参与的科研项目 | 第47-48页 |
致谢 | 第48-49页 |