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西兰花种子和幼苗转录组研究及芥子油苷代谢通路构建

摘要第8-9页
Abstract第9-10页
1 引言第11-29页
    1.1 高通量测序技术第12-19页
        1.1.1 高通量测序对基因组及基因表达研究的影响第12-13页
        1.1.2 高通量测序基本原理和不同测序平台比较第13-16页
        1.1.3 高通量测序在转录组分析中的应用第16-18页
        1.1.4 高通量测序实验设计准则第18页
        1.1.5 展望第18-19页
    1.2 芥子油苷研究进展第19-24页
        1.2.1 芥子油苷简介第19页
        1.2.2 芥子油苷对病原菌的抗性作用第19-22页
        1.2.3 芥子油苷抗病机制研究进展及存在的问题第22-23页
        1.2.4 芥子油苷抗癌作用第23-24页
    1.3 西兰花研究进展第24-27页
        1.3.1 西兰花简介第24-25页
        1.3.2 兰花中芥子油苷研究情况第25-27页
    1.4 目的意义和实验思路第27-29页
2 材料与方法第29-32页
    2.1 样本收集与总RNA提取第29页
    2.2 cDNA文库建立与测序第29-30页
    2.3 读段过滤与从头拼接(De novo assembly)第30页
    2.4 基因注释与分析第30-31页
    2.5 基因表达水平分析与聚类第31页
    2.6 筛选基因RT-PCR验证第31-32页
3 结果与分析第32-46页
    3.1 测序数据分析与从头拼接第32-33页
    3.2 Unigene注释与分类第33-36页
    3.3 基因表达模式分析第36-39页
    3.4 转录因子分析第39-41页
    3.5 芥子油苷代谢途经分析第41-44页
    3.6 候选基因的RT-PCR验证第44-46页
4 结论第46-47页
致谢第47-48页
参考文献第48-59页
附录第59-81页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第81页

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