基于Z曲线理论的细菌基因组碱基偏差分析
| 中文摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-15页 |
| 1.1 生物信息学与基因组信息学 | 第8-10页 |
| 1.2 细菌的基因组结构及复制机制概述 | 第10-13页 |
| 1.2.1 DNA结构 | 第10-11页 |
| 1.2.2 DNA复制机制 | 第11-13页 |
| 1.3 碱基组成及分布的研究概述 | 第13页 |
| 1.4 本论文内容简介 | 第13-15页 |
| 第2章 碱基组成偏差的几种分析方法 | 第15-24页 |
| 2.1 碱基组成偏差的发现 | 第15-17页 |
| 2.2 方法一：GC不对称法 | 第17-18页 |
| 2.3 方法二：CGC偏移曲线法 | 第18页 |
| 2.4 方法三：Z曲线方法 | 第18-24页 |
| 2.4.1 Z曲线方法的提出 | 第19页 |
| 2.4.2 Z曲线方法的几何表示 | 第19-20页 |
| 2.4.3 Z曲线的性质 | 第20-21页 |
| 2.4.4 Z曲线方法的应用 | 第21-24页 |
| 第3章 数据来源及分析方法 | 第24-34页 |
| 3.1 数据来源 | 第24-29页 |
| 3.1.1 细菌基因组数据 | 第24-25页 |
| 3.1.2 前导链和后随链的确定 | 第25-26页 |
| 3.1.3 DNA聚合酶 | 第26-29页 |
| 3.2 Z曲线理论分析方法 | 第29-32页 |
| 3.3 ZCC指数定义 | 第32-34页 |
| 第4章 细菌碱基偏差性质与物种分类的相关性研究 | 第34-41页 |
| 4.1 ZCC指数计算结果 | 第34-35页 |
| 4.2 碱基偏差相关性的图像表示 | 第35-36页 |
| 4.3 结果分析 | 第36-41页 |
| 4.3.1 碱基偏差的物种分类 | 第36-37页 |
| 4.3.2 DNA聚合酶的相关性 | 第37-39页 |
| 4.3.3 其他相关属性 | 第39-41页 |
| 第5章 细菌碱基偏差的原因分析 | 第41-44页 |
| 5.1 碱基组成偏差研究概述 | 第41-42页 |
| 5.1.1 突变机制 | 第41-42页 |
| 5.1.2 选择机制 | 第42页 |
| 5.2 DNA聚合酶作用分析 | 第42-43页 |
| 5.3 系统发生学研究分析 | 第43-44页 |
| 第6章 总结和展望 | 第44-46页 |
| 6.1 总结 | 第44-45页 |
| 6.2 展望 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-53页 |
| 附录 | 第53-59页 |
| 发表论文和科研情况说明 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
