| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词 | 第12-13页 |
| 引言 | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-29页 |
| 1.1 禽类矮小基因简介 | 第15-16页 |
| 1.1.1 性染色体上矮小基因 | 第15-16页 |
| 1.1.2 常染色体上矮小基因 | 第16页 |
| 1.2 匍匐性状与匍匐基因Cp的研究进展 | 第16-19页 |
| 1.2.1 匍匐性状的遗传规律 | 第16-17页 |
| 1.2.2 Cp基因的初步定位及研究进展 | 第17-19页 |
| 1.3 IHH信号调控通路与骨骼发育的关系 | 第19-24页 |
| 1.3.1 Hedgehog家族简介 | 第19-20页 |
| 1.3.2 IHH基因及其研究进展 | 第20-22页 |
| 1.3.3 IHH信号通路及其研究进展 | 第22-23页 |
| 1.3.4 IHH信号通路调控骨骼发育 | 第23-24页 |
| 1.4 全基因测序技术研究进展 | 第24-29页 |
| 1.4.1 全基因测序技术简介 | 第24-26页 |
| 1.4.2 全基因组测序技术在家禽中研究进展 | 第26-28页 |
| 1.4.3 全基因测序技术为Cp基因的定位奠定了坚实的基础 | 第28-29页 |
| 第二章 影响鸡匍匐性状关键基因的定位及其功能研究 | 第29-73页 |
| 2.1 引言 | 第29页 |
| 2.2 试验材料 | 第29-34页 |
| 2.2.1 试验鸡群简介 | 第29-30页 |
| 2.2.2 试验鸡群组建与样品采集 | 第30-31页 |
| 2.2.3 主要试验仪器 | 第31-32页 |
| 2.2.4 主要药品与试剂 | 第32-33页 |
| 2.2.5 实验药品和试剂配制 | 第33-34页 |
| 2.3 试验方法 | 第34-51页 |
| 2.3.1 胫长和体重的测量 | 第34页 |
| 2.3.2 血液及组织DNA提取 | 第34-36页 |
| 2.3.3 测序建库及全基因组重测序 | 第36-37页 |
| 2.3.4 总RNA提取与质量检测 | 第37-38页 |
| 2.3.5 cDNA合成与制备 | 第38-40页 |
| 2.3.6 标准曲线的建立 | 第40-44页 |
| 2.3.7 IHH基因表达分析 | 第44页 |
| 2.3.8 多重PCR引物设计与分型检测 | 第44-46页 |
| 2.3.9 DNA量的检测 | 第46-47页 |
| 2.3.10 Western blot检测 | 第47-49页 |
| 2.3.11 数据分析 | 第49-51页 |
| 2.4 结果与分析 | 第51-68页 |
| 2.4.1 匍匐体型鸡的特征描述 | 第51-53页 |
| 2.4.2 兴义矮脚鸡胫长与体重分布及其变化规律 | 第53-54页 |
| 2.4.3 兴义矮脚鸡携带Cp基因 | 第54-55页 |
| 2.4.4 全基因组重测序结果概述 | 第55-60页 |
| 2.4.5 IHH基因的缺失是导致鸡匍匐性状的原因突变 | 第60-62页 |
| 2.4.6 匍匐型个体的分型鉴定 | 第62-64页 |
| 2.4.7 不同表型个体DNA量的检测 | 第64-65页 |
| 2.4.8 IHH基因的缺失与匍匐型个体关联分析 | 第65页 |
| 2.4.9 不同表型个体IHH基因表达分析 | 第65-67页 |
| 2.4.10 Western blot分析 | 第67-68页 |
| 2.5 讨论 | 第68-73页 |
| 2.5.1 匍匐基因的定位 | 第68-70页 |
| 2.5.2 匍匐性状形成的分子遗传机理 | 第70页 |
| 2.5.3 IHH基因在鸡匍匐性状形成过程中的作用 | 第70-73页 |
| 第三章 匍匐体型鸡IHH信号通路基因的表达分析 | 第73-85页 |
| 3.1 引言 | 第73页 |
| 3.2 材料与方法 | 第73-77页 |
| 3.2.1 试验鸡群组建 | 第73页 |
| 3.2.2 样品采集 | 第73-74页 |
| 3.2.3 试剂及溶液配制 | 第74页 |
| 3.2.4 总RNA提取与检测 | 第74-75页 |
| 3.2.5 引物设计与合成 | 第75-76页 |
| 3.2.6 实时定量PCR | 第76页 |
| 3.2.7 统计分析 | 第76-77页 |
| 3.3 实验结果 | 第77-82页 |
| 3.3.1 总RNA质量检测 | 第77-78页 |
| 3.3.2 cDNA质量检测及早期胚胎基因型鉴定 | 第78-80页 |
| 3.3.3 IHH信号通路基因差异表达分析 | 第80-82页 |
| 3.4 讨论 | 第82-85页 |
| 第四章 结论 | 第85-86页 |
| 4.1 主要结论 | 第85页 |
| 4.2 创新点 | 第85-86页 |
| 参考文献 | 第86-95页 |
| 致谢 | 第95-97页 |
| 个人简介 | 第97-99页 |
| 附录 | 第99-105页 |
