LL-37抗菌肽段与膜相互作用的分子动力学模拟研究
| 中文摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第9-14页 |
| 1.1 抗菌肽及其抗菌机制 | 第9-10页 |
| 1.2 抗菌肽LL-37的结构与功能 | 第10页 |
| 1.3 抗菌肽LL-37与膜的相互作用 | 第10-12页 |
| 1.4 本文研究内容 | 第12-14页 |
| 第二章 分子动力学模拟 | 第14-18页 |
| 2.1 分子动力学模拟简介 | 第14-15页 |
| 2.2 经验力场和GROMACS | 第15-17页 |
| 2.3 分子动力学模拟应用于抗菌肽研究 | 第17-18页 |
| 第三章 研究对象和方法 | 第18-21页 |
| 3.1 模拟对象的选择 | 第18-19页 |
| 3.2 膜平衡模拟 | 第19-20页 |
| 3.3 肽-膜体系的模拟 | 第20-21页 |
| 第四章 研究结果及分析 | 第21-35页 |
| 4.1 模拟的收敛性 | 第21-22页 |
| 4.2 肽段FK-13的结构特征 | 第22-25页 |
| 4.2.1 肽段FK-13总体形态的变化 | 第22-23页 |
| 4.2.2 FK-13二级结构（螺旋）形成情况 | 第23页 |
| 4.2.3 FK-13的典型结构 | 第23-25页 |
| 4.3 肽段FK-13与膜的相互作用 | 第25-29页 |
| 4.3.1 肽段与膜的质心之间的距离 | 第25-26页 |
| 4.3.2 氢键的形成情况 | 第26-27页 |
| 4.3.3 系统的典型结构 | 第27-29页 |
| 4.4 膜的特征 | 第29-35页 |
| 4.4.1 肽段在膜上的密度分布 | 第29-31页 |
| 4.4.2 脂质的序参数 | 第31-33页 |
| 4.4.3 膜厚度的变化 | 第33-35页 |
| 第五章 总结与展望 | 第35-38页 |
| 参考文献 | 第38-43页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第43-44页 |
| 致谢 | 第44页 |
