| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略词表及英汉对照 | 第10-11页 |
| 第一部分 文献综述 | 第11-24页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-24页 |
| 1 水稻氮素利用研究进展 | 第12-15页 |
| 1.1 水稻氮素利用效率的主要评价指标 | 第12-13页 |
| 1.2 水稻氮素高效利用的生理生化反应 | 第13-14页 |
| 1.3 水稻氮素利用率及相关性状的QTL定位及基因发掘 | 第14-15页 |
| 2 遗传作图研究 | 第15-22页 |
| 2.1 植物DNA分子标记技术 | 第15-17页 |
| 2.2 植物遗传作图研究 | 第17-22页 |
| 3 RNA-seq技术 | 第22-23页 |
| 3.1 RNA-seq工作原理 | 第22页 |
| 3.2 RNA-seq技术优势 | 第22-23页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
| 第二部分 研究报告 | 第24-58页 |
| 第二章 材料与方法 | 第26-32页 |
| 1 实验材料 | 第26-29页 |
| 1.1 试验材料来源 | 第26页 |
| 1.2 材料表型数据的收集 | 第26-27页 |
| 1.3 SSR标记基因型鉴定 | 第27-29页 |
| 2 数据分析方法及相关软件 | 第29-32页 |
| 2.1 表型数据分析 | 第29页 |
| 2.2 遗传多样性分析 | 第29页 |
| 2.3 群体结构分析 | 第29-30页 |
| 2.4 亲缘关系系数分析 | 第30页 |
| 2.5 关联分析 | 第30-31页 |
| 2.6 优异等位变异的发掘 | 第31页 |
| 2.7 候选基因预测 | 第31-32页 |
| 第三章 结果与分析 | 第32-52页 |
| 1 水稻地方品种表型数据统计分析 | 第32-34页 |
| 2 157对SSR分子标记的遗传多样性分析 | 第34-40页 |
| 3 基于SSR标记的群体结构分析 | 第40-41页 |
| 4 模型最适度分析 | 第41-42页 |
| 5 氮素利用效率性状的关联分析 | 第42-45页 |
| 6 氮素利用效率的优异等位变异 | 第45-47页 |
| 7 候选位点SNP加密 | 第47-49页 |
| 8 候选基因分析 | 第49-52页 |
| 第四章 全文小结与讨论 | 第52-58页 |
| 4.1 全文讨论与创新之处 | 第52-55页 |
| 4.1.1 本研究检测到的SSR位点与前人报道结果的比较 | 第52页 |
| 4.1.2 优异等位变异的应用 | 第52-53页 |
| 4.1.3 水稻氮素利用效率相关候选基因的预测 | 第53-55页 |
| 4.1.4 本研究创新之处 | 第55页 |
| 4.2 全文小结 | 第55-58页 |
| 4.2.1 184份水稻地方品种组成的自然群体划分为7个亚群 | 第55页 |
| 4.2.2 利用两种不同模型检测到47个控制氮素利用效率的QTL | 第55-56页 |
| 4.2.3 优异等位变异的发掘与典型载体品种的确定 | 第56页 |
| 4.2.4 对显著关联位点RM5748进行SNP加密 | 第56页 |
| 4.2.5 候选基因的预测 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-66页 |
| 附录 | 第66-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
