摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
1 绪论 | 第9-12页 |
1.1 课题的背景及意义 | 第9-10页 |
1.2 植物启动子识别算法的发展现状 | 第10-11页 |
1.2.1 植物启动子识别的难点 | 第10页 |
1.2.2 植物启动子识别的研究进展 | 第10-11页 |
1.3 本文的主要工作和组织结构 | 第11-12页 |
2 生物学理论基础 | 第12-23页 |
2.1 DNA | 第12-15页 |
2.1.1 核酸 | 第12-13页 |
2.1.2 DNA的结构 | 第13-15页 |
2.2 分子生物学中心法则 | 第15-17页 |
2.3 基因组结构 | 第17-19页 |
2.3.1 基因 | 第17-18页 |
2.3.2 真核生物基因组 | 第18-19页 |
2.4 真核基因表达调控 | 第19-20页 |
2.5 真核启动子 | 第20-23页 |
2.5.1 真核启动子的结构 | 第21页 |
2.5.2 真核启动子的功能 | 第21-23页 |
3 生物信息数据库 | 第23-29页 |
3.1 生物信息数据库 | 第24-26页 |
3.2 FASTA数据格式 | 第26-27页 |
3.3 植物启动子数据库 | 第27-29页 |
4 基于GC偏好和SVM的植物启动子识别算法 | 第29-39页 |
4.1 系统结构与工作原理 | 第29-30页 |
4.2 特征提取 | 第30-33页 |
4.2.1 GC偏好特征 | 第30-31页 |
4.2.2 结构特征 | 第31-33页 |
4.2.3 信号特征 | 第33页 |
4.3 SVM分类器设计 | 第33-36页 |
4.3.1 SVM工作原理 | 第33-35页 |
4.3.2 SVM分类器设计 | 第35-36页 |
4.4 实验结果及性能分析 | 第36-38页 |
4.4.1 评价指标 | 第36-37页 |
4.4.2 数据集的选取 | 第37-38页 |
4.4.3 实验结果及分析 | 第38页 |
4.5 本章小结 | 第38-39页 |
5 基于GC偏好和DNA双链特征的植物启动子识别算法 | 第39-44页 |
5.1 系统结构与工作原理 | 第39-40页 |
5.2 DNA双链特征 | 第40-42页 |
5.3 实验结果及性能分析 | 第42-43页 |
5.4 本章小结 | 第43-44页 |
6 结论 | 第44-46页 |
6.1 研究工作总结 | 第44页 |
6.2 未来工作展望 | 第44-46页 |
参考文献 | 第46-49页 |
攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第49-50页 |
致谢 | 第50页 |