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生物信息学在家蚕中用应用及Ras相关CTP结合蛋白C(BmRGPC的表达研究)

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
缩略语第10-15页
第一章 家蚕的研究现状及实验技术路线第15-22页
 1 前言第15-19页
   ·基因组学研究进展第16-17页
   ·蛋白质质谱测序研究进展第17-18页
   ·生物信息学研究进展及其在家蚕中的应用第18-19页
 2 实验目的和意义第19页
 3 实验方案设计第19-20页
   ·家蚕全基因组数据获得第19-20页
   ·家蚕蛹期质谱肽段的获得第20页
   ·家蚕本地蛋白质序列的获得第20页
   ·Ras-related GTP Binding protein C(BmRGPC)的表达分析第20页
 4 实验技术路线(见图1.1)第20-22页
第二章 数据库A 和B 的构建及结果分析第22-31页
 1 基于家蚕cDNA 文库的蛋白质数据库构建及其本地化第22-29页
   ·cDNA 文库的构建第22-23页
     ·家蚕蛹组织的总RNA 提取第22页
     ·家蚕蛹组织的cDNA 序列的获得第22-23页
     ·家蚕蛹组织的cDNA 文库的处理第23页
   ·基于家蚕cDNA 文库的蛋白质数据库A 的构建与本地化第23-24页
   ·蛋白质数据库A 的生物信息学分析第24-29页
     ·数据库A 中的蛋白质序列注释结果第24-29页
     ·数据库A 中信号肽和跨膜结构的分析结果第29页
 2 数据库B 的构建及其本地化第29页
 3 讨论第29-31页
第三章 家蚕蛹期蛋白质的质谱学分析及数据库C 的构建第31-34页
 1 材料与试剂第31页
   ·材料第31页
   ·试剂第31页
     ·主要试剂的配制第31页
 2 方法第31-32页
   ·家蚕蛹的分离第31-32页
     ·家蚕蛹期蛋白质的预处理第31页
     ·蚕蛹蛋白质的纯化和分离第31-32页
     ·蛋白样品的制备第32页
   ·家蚕蛹的质谱学测定第32页
   ·质谱测定数据库C 的构建第32页
 3 结果与讨论第32-34页
第四章 数据库A,B,C 的联配第34-37页
 1 背景介绍第34页
 2 结果统计第34-35页
 3 匹配上的蛋白质的功能分析第35-36页
 4 讨论第36-37页
第五章 ras-related GTP-binding Protein C(Bm RGPC)的分析第37-51页
 1 背景介绍第37-38页
 2 研究目的和意义第38页
 3 BmRGPC 的序列分析第38-48页
   ·生物信息学工具第39页
   ·Bm RGPC 基因的序列分析结果第39-48页
     ·疏水性分析第40-41页
     ·二级结构的预测第41-42页
     ·BmRGPC 蛋白的高级结构预测第42页
     ·BmRGPC 蛋白定位的预测第42-43页
     ·信号肽分析第43页
     ·功能位点分析第43-45页
     ·BmRGPC 氨基酸残基序列同源性分析第45-47页
     ·BmRGPC 进化树的构建第47-48页
 4 讨论第48-51页
第六章 Bm RGPC 的原核表达研究第51-61页
 1 材料与试剂第51-52页
   ·材料第51页
   ·试剂第51页
   ·主要试剂的配制第51-52页
     ·SDS-PAGE 用试剂第51页
     ·Bradford 检测用试剂第51-52页
 2 方法第52-59页
   ·Bm RGPC 基因的克隆第52-57页
     ·PCR 扩增完整的ORF 序列第52-53页
     ·PCR 产物与表达载体pET-28a 的双酶切第53页
     ·酶切产物的纯化第53页
     ·连接反应第53-54页
     ·E.coli TG1、BL21(DE3)感受态细胞的制备第54页
     ·连接产物的转化第54页
     ·重组克隆的筛选与鉴定第54-57页
   ·Bm RGPC 基因序列的测定第57-58页
     ·测序PCR 反应体系第57页
     ·测序PCR 反应条件第57页
     ·测序流程的详细步骤如下第57-58页
   ·重组质粒的转化及鉴定第58页
   ·重组质粒在大肠杆菌中的表达第58页
   ·SDS-PAGE 电泳分析第58-59页
 3 实验结果第59-60页
   ·PCR 扩增完整的ORF 序列第59页
   ·重组质粒pET-28a-BmRGPC 的鉴定第59-60页
   ·pET-28a-BmRGPC 的诱导表达及纯化第60页
 4 讨论第60-61页
结论第61-62页
参考文献第62-69页
致谢第69页

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