| 中文摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 缩略语/符号说明 | 第12-13页 |
| 一、前言 | 第13-20页 |
| 1.1 研究背景 | 第13-17页 |
| 1.1.1 PD | 第13-14页 |
| 1.1.2 AD及PD和AD共患病研究现状 | 第14-15页 |
| 1.1.3 生物学通路分析 | 第15-16页 |
| 1.1.4 蛋白质网络分析 | 第16-17页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第17页 |
| 1.3 研究内容及方法 | 第17-18页 |
| 1.4 论文创新点 | 第18页 |
| 1.5 论文结构安排 | 第18-20页 |
| 二、原理与方法 | 第20-26页 |
| 2.1 数据 | 第20-21页 |
| 2.1.1 遗传相关基因集 | 第20页 |
| 2.1.2 其他基因集 | 第20-21页 |
| 2.1.3 蛋白质网络数据 | 第21页 |
| 2.2 Gene Ontology（GO）富集分析 | 第21-22页 |
| 2.3 生物学通路分析 | 第22页 |
| 2.4 通络串话分析 | 第22-23页 |
| 2.5 PPIN拓扑分析 | 第23页 |
| 2.6 推断PD特异蛋白网络 | 第23-24页 |
| 2.7 基于生物学功能和PPIN的PD和AD的比较 | 第24-26页 |
| 2.7.1 基于GO分析的比较 | 第24-25页 |
| 2.7.2 基于生物学通路的比较 | 第25页 |
| 2.7.3 基于PPIN拓扑特性的比较 | 第25-26页 |
| 三、结果与分析 | 第26-45页 |
| 3.1 核心数据集 | 第26-27页 |
| 3.2 GO富集分析 | 第27-28页 |
| 3.3 通路富集分析 | 第28-31页 |
| 3.4 通路串话分析 | 第31-32页 |
| 3.5 PPIN分析 | 第32页 |
| 3.6 PD特异蛋白网络的构建 | 第32-34页 |
| 3.7 基于生物功能和PPIN的PD和AD的比较 | 第34-45页 |
| 3.7.1 基于GO分析的比较 | 第35页 |
| 3.7.2 基于生化通路的比较 | 第35-41页 |
| 3.7.3 基于PPIN拓扑特征的比较 | 第41-44页 |
| 3.7.4 小结 | 第44-45页 |
| 四、结论与讨论 | 第45-52页 |
| 4.1 结论 | 第45-46页 |
| 4.2 讨论 | 第46-52页 |
| 4.2.1 PDgset和Alzgset | 第46-47页 |
| 4.2.2 功能富集分析 | 第47-49页 |
| 4.2.3 PPIN分析 | 第49页 |
| 4.2.4 PD和AD的比较研究 | 第49-51页 |
| 4.2.5 本研究不足之处 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-64页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第64-65页 |
| 附录 1 PDgset | 第65-67页 |
| 附录 2 Alzgset | 第67-70页 |
| 附录 3 PDgset显著富集GO BP条目 | 第70-81页 |
| 附录 4 Alzgset显著富集GO BP条目 | 第81-101页 |
| 综述 与帕金森病相关的生物学通路研究现状及展望 | 第101-117页 |
| 综述参考文献 | 第110-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
| 个人简历 | 第118页 |