| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 本研究常用缩写词 | 第8-13页 |
| 1 前言 | 第13-20页 |
| 1.1 沙门菌概述 | 第13-14页 |
| 1.1.1 沙门菌特性 | 第13页 |
| 1.1.2 沙门菌的宿主范围及污染情况 | 第13页 |
| 1.1.3 沙门菌流行与危害 | 第13-14页 |
| 1.2 沙门菌的耐药性现状概述 | 第14-15页 |
| 1.3 沙门菌毒力因子概述 | 第15页 |
| 1.4 质粒不相容群分型概述 | 第15-16页 |
| 1.5 脉冲场凝胶电泳技术概述 | 第16-17页 |
| 1.6 研究目的及意义 | 第17-19页 |
| 1.7 技术路线 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-39页 |
| 2.1 材料 | 第20-30页 |
| 2.1.1 样品采集与菌种来源 | 第20-23页 |
| 2.1.1.1 采样采集 | 第20-21页 |
| 2.1.1.2 上海市德比沙门菌菌株 | 第21-23页 |
| 2.1.2 标准菌株 | 第23-24页 |
| 2.1.3 培养基 | 第24页 |
| 2.1.4 主要试剂 | 第24页 |
| 2.1.5 实验耗材 | 第24-25页 |
| 2.1.6 试剂的配制 | 第25-26页 |
| 2.1.7 主要仪器 | 第26页 |
| 2.1.8 药敏纸片 | 第26-27页 |
| 2.1.9 引物 | 第27-30页 |
| 2.1.9.1 沙门菌鉴定引物 | 第27-28页 |
| 2.1.9.2 毒力基因引物 | 第28-29页 |
| 2.1.9.3 质粒不相容群引物 | 第29-30页 |
| 2.2 方法 | 第30-39页 |
| 2.2.1 沙门菌分离鉴定 | 第30-33页 |
| 2.2.1.1 样品的采集及预增菌处理 | 第30-31页 |
| 2.2.1.2 沙门菌的分离 | 第31-32页 |
| 2.2.1.3 沙门菌分离株的生化试验 | 第32页 |
| 2.2.1.4 沙门菌分离株的血清型鉴定 | 第32-33页 |
| 2.2.1.5 沙门菌的保存 | 第33页 |
| 2.2.2 德比沙门菌的药敏实验 | 第33页 |
| 2.2.3 德比沙门菌毒力基因及质粒不相容群的PCR检测 | 第33-35页 |
| 2.2.3.1 DNA模板的制备 | 第33-34页 |
| 2.2.3.2 毒力基因的PCR检测 | 第34页 |
| 2.2.3.3 质粒不相容群的PCR检测 | 第34-35页 |
| 2.2.4 PFGE分子分型 | 第35-37页 |
| 2.2.4.1 细菌培养 | 第35页 |
| 2.2.4.2 凝胶块的制备 | 第35-36页 |
| 2.2.4.3 细菌的裂解 | 第36页 |
| 2.2.4.4 洗胶块 | 第36页 |
| 2.2.4.5 限制性酶切 | 第36页 |
| 2.2.4.6 加样 | 第36-37页 |
| 2.2.4.7 脉冲场电泳 | 第37页 |
| 2.2.4.8 图像的获取 | 第37页 |
| 2.2.4.9 图像的数据分析 | 第37页 |
| 2.2.5 统计学数据分析 | 第37-39页 |
| 3 实验结果及分析 | 第39-94页 |
| 3.1 细菌分离鉴定结果 | 第39-40页 |
| 3.2 德比沙门菌药敏试验结果及分析 | 第40-58页 |
| 3.2.1 德比沙门菌菌株耐药情况 | 第40-52页 |
| 3.2.2 德比沙门菌菌株耐药结果分析 | 第52-53页 |
| 3.2.3 德比沙门菌多重耐药统计及分析 | 第53-58页 |
| 3.2.4 德比沙门菌耐药情况小结 | 第58页 |
| 3.3 德比沙门菌毒力基因检测结果 | 第58-71页 |
| 3.3.1 毒力基因携带情况 | 第58-68页 |
| 3.3.2 毒力基因检测结果分析 | 第68-69页 |
| 3.3.3 毒力基因模式统计 | 第69-70页 |
| 3.3.4 毒力基因检测情况小结 | 第70-71页 |
| 3.4 德比沙门菌质粒不相容群检测结果 | 第71-86页 |
| 3.4.1 质粒不相容群检测结果 | 第71-82页 |
| 3.4.2 德比沙门菌质粒不相容群携带情况统计分析 | 第82页 |
| 3.4.3 质粒不相容群携带模式统计 | 第82-85页 |
| 3.4.4 质粒不相容群携带模式分析 | 第85-86页 |
| 3.4.5 质粒不相容群检测小结 | 第86页 |
| 3.5 德比沙门菌的PFGE分型结果及分析 | 第86-90页 |
| 3.5.1 PFGE分型结果图谱 | 第86-90页 |
| 3.5.2 PFGE分子分型结果分析 | 第90页 |
| 3.5.3 PFGE分子分型小结 | 第90页 |
| 3.6 德比沙门菌的分子流行病学相关性研究 | 第90-94页 |
| 3.6.1 整理PFGE分子分型、毒力基因及质粒不相容群图谱结果 | 第90-92页 |
| 3.6.2 毒力基因相关性分析 | 第92-93页 |
| 3.6.3 质粒不相容群相关性分析 | 第93页 |
| 3.6.4 德比沙门菌的分子流行病学相关性研究小结 | 第93-94页 |
| 4 讨论 | 第94-103页 |
| 4.1 德比沙门菌耐药结果讨论 | 第94-95页 |
| 4.2 德比沙门菌毒力基因检测及毒力基因模式分型结果讨论 | 第95-97页 |
| 4.3 德比沙门菌质粒不相容群检测及携带模式分型结果讨论 | 第97-98页 |
| 4.4 德比沙门菌PFGE分子分型结果讨论 | 第98-99页 |
| 4.5 PFGE分子分型及本研究中的毒力基因分型、质粒不相容群分型方法关系探究讨 | 第99-103页 |
| 4.5.1 PFGE分子分型方法、毒力基因分型及质粒不相容群分型方法图谱对比 | 第99页 |
| 4.5.2 德比沙门菌PFGE分型与毒力基因分型关系探究 | 第99-100页 |
| 4.5.3 PFGE分子分型和质粒不相容群分型关系探究 | 第100-102页 |
| 4.5.4 PFGE分子分型方法与本研究中毒力基因分型及质粒不相容群分型方法的关系探究小结 | 第102-103页 |
| 5 结论 | 第103-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 参考文献 | 第106-111页 |
| 附录 | 第111-112页 |
