摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
第1章 绪论 | 第9-15页 |
1.1 课题的来源 | 第9页 |
1.2 课题研究的背景和意义 | 第9-11页 |
1.3 国内外研究现状 | 第11-13页 |
1.3.1 GWAS的研究 | 第11页 |
1.3.2 meta分析的研究 | 第11-12页 |
1.3.3 富集分析的研究 | 第12-13页 |
1.4 本文的研究思路 | 第13页 |
1.5 本文的主要研究内容 | 第13-15页 |
第2章 实验材料与方法 | 第15-23页 |
2.1 实验材料 | 第15-18页 |
2.1.1 GRASP数据库 | 第15页 |
2.1.2 用于meta分析的数据的获得 | 第15-17页 |
2.1.3 用于pathway研究的数据的获得 | 第17-18页 |
2.2 实验方法 | 第18-23页 |
2.2.1 论文和相关研究的获得及其数据的提取 | 第18-19页 |
2.2.2 遗传模型的选择 | 第19页 |
2.2.3 异质性检验 | 第19页 |
2.2.4 meta分析和分组研究 | 第19-20页 |
2.2.5 发表偏倚性分析和敏感性分析 | 第20页 |
2.2.6 基于超几何分布的富集分析 | 第20-21页 |
2.2.7 富集分析结果的进一步研究 | 第21-23页 |
第3章 基于meta分析的rs1051730 SNP位点与肺癌的相关性研究 | 第23-37页 |
3.1 引言 | 第23页 |
3.2 rs1051730 SNP位点总体上对肺癌的影响 | 第23-24页 |
3.2.1 论文和相关研究的获得及其数据的提取结果 | 第23-24页 |
3.2.2 异质性检验结果 | 第24页 |
3.2.3 meta分析结果 | 第24页 |
3.3 分组研究 | 第24-30页 |
3.4 发表偏倚性分析和敏感性分析 | 第30-34页 |
3.5 讨论 | 第34-36页 |
3.6 本章小结 | 第36-37页 |
第4章 基于富集分析方法的与肺癌发病相关的通路机制的研究 | 第37-49页 |
4.1 引言 | 第37页 |
4.2 肺癌GWAS数据的富集分析结果 | 第37-41页 |
4.2.1 数据的收集和提取结果 | 第37-38页 |
4.2.2 GO数据库的使用 | 第38-39页 |
4.2.3 SNP位点富集分析软件的筛选结果 | 第39-41页 |
4.2.4 四种软件的分析结果 | 第41页 |
4.3 对所得GO术语的进一步分析 | 第41-46页 |
4.4 讨论 | 第46-47页 |
4.5 本章小结 | 第47-49页 |
结论 | 第49-51页 |
参考文献 | 第51-57页 |
附录 | 第57-68页 |
攻读硕士学位期间发表的论文 | 第68-70页 |
致谢 | 第70页 |