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肺癌GWAS数据的meta分析及生物学通路富集分析研究

摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
第1章 绪论第9-15页
    1.1 课题的来源第9页
    1.2 课题研究的背景和意义第9-11页
    1.3 国内外研究现状第11-13页
        1.3.1 GWAS的研究第11页
        1.3.2 meta分析的研究第11-12页
        1.3.3 富集分析的研究第12-13页
    1.4 本文的研究思路第13页
    1.5 本文的主要研究内容第13-15页
第2章 实验材料与方法第15-23页
    2.1 实验材料第15-18页
        2.1.1 GRASP数据库第15页
        2.1.2 用于meta分析的数据的获得第15-17页
        2.1.3 用于pathway研究的数据的获得第17-18页
    2.2 实验方法第18-23页
        2.2.1 论文和相关研究的获得及其数据的提取第18-19页
        2.2.2 遗传模型的选择第19页
        2.2.3 异质性检验第19页
        2.2.4 meta分析和分组研究第19-20页
        2.2.5 发表偏倚性分析和敏感性分析第20页
        2.2.6 基于超几何分布的富集分析第20-21页
        2.2.7 富集分析结果的进一步研究第21-23页
第3章 基于meta分析的rs1051730 SNP位点与肺癌的相关性研究第23-37页
    3.1 引言第23页
    3.2 rs1051730 SNP位点总体上对肺癌的影响第23-24页
        3.2.1 论文和相关研究的获得及其数据的提取结果第23-24页
        3.2.2 异质性检验结果第24页
        3.2.3 meta分析结果第24页
    3.3 分组研究第24-30页
    3.4 发表偏倚性分析和敏感性分析第30-34页
    3.5 讨论第34-36页
    3.6 本章小结第36-37页
第4章 基于富集分析方法的与肺癌发病相关的通路机制的研究第37-49页
    4.1 引言第37页
    4.2 肺癌GWAS数据的富集分析结果第37-41页
        4.2.1 数据的收集和提取结果第37-38页
        4.2.2 GO数据库的使用第38-39页
        4.2.3 SNP位点富集分析软件的筛选结果第39-41页
        4.2.4 四种软件的分析结果第41页
    4.3 对所得GO术语的进一步分析第41-46页
    4.4 讨论第46-47页
    4.5 本章小结第47-49页
结论第49-51页
参考文献第51-57页
附录第57-68页
攻读硕士学位期间发表的论文第68-70页
致谢第70页

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