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哈密瓜响应青霉菌侵染的转录组和蛋白组研究及相关抗性酶变化分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略符号对照表第7-12页
第一章 绪论第12-21页
    1.1 引言第12页
    1.2 采后哈密瓜病害及其防治研究第12-13页
        1.2.1 采后哈密瓜病害及主要致病菌第12页
        1.2.2 采后哈密瓜病害防治技术第12-13页
    1.3 植物与病原菌相互作用机制研究进展第13-15页
        1.3.1 植物自身免疫系统与病原菌侵染第13-14页
        1.3.2 植物激素信号转导与病原菌侵染第14页
        1.3.3 植物病程相关蛋白与病原菌侵染第14-15页
    1.4 转录组学和蛋白组学在植物与病原菌互作研究中的应用第15-16页
        1.4.1 转录组学在植物与病原菌互作研究中的应用第15页
        1.4.2 蛋白质组学在植物与病原菌互作研究中的应用第15-16页
    1.5 甜瓜转录组文库构建及相关基因分析第16-18页
    1.6 甜瓜响应逆境胁迫的研究进展第18-19页
    1.7 立论依据和研究意义第19页
    1.8 主要研究内容第19-20页
    1.9 技术路线第20-21页
第二章 青霉菌侵染前后哈密瓜转录组文库的构建及分析第21-41页
    2.1 前言第21页
    2.2 材料与设备第21-22页
        2.2.1 材料处理第21-22页
        2.2.2 实验仪器与试剂第22页
    2.3 实验方法及步骤第22-23页
        2.3.1 Total RNA的提取第22页
        2.3.2 转录组测序流程第22-23页
        2.3.3 转录组生物信息学分析第23页
    2.4 结果与讨论第23-40页
        2.4.1 RNA提取及检测分析第23-24页
        2.4.2 产量统计第24页
        2.4.3 组装的Contigs和Unigenes长度分布统计第24-26页
        2.4.4 哈密瓜果实转录组的Unigenes注释第26-27页
        2.4.5 哈密瓜果实转录组的Unigenes COG功能分类第27-29页
        2.4.6 哈密瓜果实转录组的Unigenes GO功能分类第29-30页
        2.4.7 哈密瓜果实转录组Unigenes代谢通路分析第30-38页
        2.4.8 蛋白编码区预测(CDS)第38-40页
    2.5 本章小结第40-41页
第三章 青霉菌侵染前后哈密瓜差异表达基因分析第41-82页
    3.1 前言第41页
    3.2 材料与设备第41页
        3.2.1 材料处理第41页
        3.2.2 实验仪器与试剂第41页
    3.3 实验方法及步骤第41-44页
        3.3.1 RNA的提取及测序流程第41-42页
        3.3.2 生物信息学分析第42-43页
        3.3.3 荧光定量PCR验证基因表达水平第43-44页
    3.4 结果与讨论第44-80页
        3.4.1 测序评估第44-47页
        3.4.2 基因覆盖度统计第47-48页
        3.4.3 荧光定量PCR验证基因表达水平第48-49页
        3.4.4 差异表达基因分析第49-65页
        3.4.5 差异表达基因聚类分析第65-66页
        3.4.6 差异表达基因的GO功能注释第66-69页
        3.4.7 差异表达基因的Pathway分析第69-71页
        3.4.8 抗性相关代谢途径及基因分析第71-80页
    3.5 本章小结第80-82页
第四章 采后哈密瓜响应青霉菌侵染的差异蛋白组学研究第82-115页
    4.1 前言第82页
    4.2 材料与方法第82-83页
        4.2.1 材料处理第82页
        4.2.2 实验仪器与试剂第82-83页
    4.3 实验方法及步骤第83-85页
        4.3.1 蛋白质提取第83页
        4.3.2 定量蛋白质组学实验基本流程第83页
        4.3.3 蛋白质组生物信息学分析第83-85页
    4.4 结果与讨论第85-114页
        4.4.1 蛋白质检测第85页
        4.4.2 蛋白质鉴定质量评估第85-88页
        4.4.3 蛋白质GO功能注释第88-89页
        4.4.4 蛋白质COG功能分类第89-90页
        4.4.5 蛋白质Pathway代谢通路注释第90-91页
        4.4.6 差异蛋白质定量信息统计第91-100页
        4.4.7 差异蛋白GO富集分析第100页
        4.4.8 差异蛋白的Pathway富集分析第100-105页
        4.4.9 差异蛋白和差异表达基因的关联性分析第105-114页
    4.5 本章小结第114-115页
第五章 青霉菌侵染前后及保鲜剂处理对哈密瓜相关抗性酶的影响研究第115-128页
    5.1 前言第115页
    5.2 材料与设备第115-116页
        5.2.1 实验材料第115页
        5.2.2 主要试剂第115-116页
        5.2.3 实验仪器与设备第116页
    5.3 试验方法第116-118页
        5.3.1 生物保鲜剂的制备第116页
        5.3.2 样品处理与收集第116页
        5.3.3 SOD活性测定第116页
        5.3.4 POD活性测定第116-117页
        5.3.5 CAT活性测定第117页
        5.3.6 β-1,3-葡聚糖酶活性测定第117页
        5.3.7 几丁质酶(CHT)活性测定第117页
        5.3.8 超微结构观测样品处理及制片方法第117页
        5.3.9 数据处理第117-118页
    5.4 结果与讨论第118-127页
        5.4.1 青霉菌侵染后哈密瓜果实SOD活性的变化第118页
        5.4.2 青霉菌侵染后哈密瓜果实POD活性的变化第118-119页
        5.4.3 青霉菌侵染后哈密瓜果实CAT活性的变化第119-120页
        5.4.4 青霉菌侵染后哈密瓜果实 β-1,3 葡聚糖酶活性的变化第120页
        5.4.5 青霉菌侵染后哈密瓜果实CHT活性的变化第120-121页
        5.4.6 保鲜剂处理对贮藏期间哈密瓜SOD活性的影响第121页
        5.4.7 保鲜剂处理对贮藏期间哈密瓜POD活性影响研究第121-122页
        5.4.8 保鲜剂处理对贮藏期间哈密瓜CAT活性影响第122-123页
        5.4.9 保鲜剂处理对贮藏期间哈密瓜果实 β-1, 3 葡聚糖酶活性影响第123-124页
        5.4.10 保鲜剂处理对贮藏期间哈密瓜CHT活性影响第124页
        5.4.11 青霉菌侵染前后哈密瓜果实超微结构的变化第124-127页
    5.5 本章小结第127-128页
主要结论与展望第128-130页
论文创新点第130-131页
致谢第131-132页
参考文献第132-149页
附录I:攻读博士学位期间发表论文情况第149-150页
附录II第150-173页

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