摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
缩略符号对照表 | 第7-12页 |
第一章 绪论 | 第12-21页 |
1.1 引言 | 第12页 |
1.2 采后哈密瓜病害及其防治研究 | 第12-13页 |
1.2.1 采后哈密瓜病害及主要致病菌 | 第12页 |
1.2.2 采后哈密瓜病害防治技术 | 第12-13页 |
1.3 植物与病原菌相互作用机制研究进展 | 第13-15页 |
1.3.1 植物自身免疫系统与病原菌侵染 | 第13-14页 |
1.3.2 植物激素信号转导与病原菌侵染 | 第14页 |
1.3.3 植物病程相关蛋白与病原菌侵染 | 第14-15页 |
1.4 转录组学和蛋白组学在植物与病原菌互作研究中的应用 | 第15-16页 |
1.4.1 转录组学在植物与病原菌互作研究中的应用 | 第15页 |
1.4.2 蛋白质组学在植物与病原菌互作研究中的应用 | 第15-16页 |
1.5 甜瓜转录组文库构建及相关基因分析 | 第16-18页 |
1.6 甜瓜响应逆境胁迫的研究进展 | 第18-19页 |
1.7 立论依据和研究意义 | 第19页 |
1.8 主要研究内容 | 第19-20页 |
1.9 技术路线 | 第20-21页 |
第二章 青霉菌侵染前后哈密瓜转录组文库的构建及分析 | 第21-41页 |
2.1 前言 | 第21页 |
2.2 材料与设备 | 第21-22页 |
2.2.1 材料处理 | 第21-22页 |
2.2.2 实验仪器与试剂 | 第22页 |
2.3 实验方法及步骤 | 第22-23页 |
2.3.1 Total RNA的提取 | 第22页 |
2.3.2 转录组测序流程 | 第22-23页 |
2.3.3 转录组生物信息学分析 | 第23页 |
2.4 结果与讨论 | 第23-40页 |
2.4.1 RNA提取及检测分析 | 第23-24页 |
2.4.2 产量统计 | 第24页 |
2.4.3 组装的Contigs和Unigenes长度分布统计 | 第24-26页 |
2.4.4 哈密瓜果实转录组的Unigenes注释 | 第26-27页 |
2.4.5 哈密瓜果实转录组的Unigenes COG功能分类 | 第27-29页 |
2.4.6 哈密瓜果实转录组的Unigenes GO功能分类 | 第29-30页 |
2.4.7 哈密瓜果实转录组Unigenes代谢通路分析 | 第30-38页 |
2.4.8 蛋白编码区预测(CDS) | 第38-40页 |
2.5 本章小结 | 第40-41页 |
第三章 青霉菌侵染前后哈密瓜差异表达基因分析 | 第41-82页 |
3.1 前言 | 第41页 |
3.2 材料与设备 | 第41页 |
3.2.1 材料处理 | 第41页 |
3.2.2 实验仪器与试剂 | 第41页 |
3.3 实验方法及步骤 | 第41-44页 |
3.3.1 RNA的提取及测序流程 | 第41-42页 |
3.3.2 生物信息学分析 | 第42-43页 |
3.3.3 荧光定量PCR验证基因表达水平 | 第43-44页 |
3.4 结果与讨论 | 第44-80页 |
3.4.1 测序评估 | 第44-47页 |
3.4.2 基因覆盖度统计 | 第47-48页 |
3.4.3 荧光定量PCR验证基因表达水平 | 第48-49页 |
3.4.4 差异表达基因分析 | 第49-65页 |
3.4.5 差异表达基因聚类分析 | 第65-66页 |
3.4.6 差异表达基因的GO功能注释 | 第66-69页 |
3.4.7 差异表达基因的Pathway分析 | 第69-71页 |
3.4.8 抗性相关代谢途径及基因分析 | 第71-80页 |
3.5 本章小结 | 第80-82页 |
第四章 采后哈密瓜响应青霉菌侵染的差异蛋白组学研究 | 第82-115页 |
4.1 前言 | 第82页 |
4.2 材料与方法 | 第82-83页 |
4.2.1 材料处理 | 第82页 |
4.2.2 实验仪器与试剂 | 第82-83页 |
4.3 实验方法及步骤 | 第83-85页 |
4.3.1 蛋白质提取 | 第83页 |
4.3.2 定量蛋白质组学实验基本流程 | 第83页 |
4.3.3 蛋白质组生物信息学分析 | 第83-85页 |
4.4 结果与讨论 | 第85-114页 |
4.4.1 蛋白质检测 | 第85页 |
4.4.2 蛋白质鉴定质量评估 | 第85-88页 |
4.4.3 蛋白质GO功能注释 | 第88-89页 |
4.4.4 蛋白质COG功能分类 | 第89-90页 |
4.4.5 蛋白质Pathway代谢通路注释 | 第90-91页 |
4.4.6 差异蛋白质定量信息统计 | 第91-100页 |
4.4.7 差异蛋白GO富集分析 | 第100页 |
4.4.8 差异蛋白的Pathway富集分析 | 第100-105页 |
4.4.9 差异蛋白和差异表达基因的关联性分析 | 第105-114页 |
4.5 本章小结 | 第114-115页 |
第五章 青霉菌侵染前后及保鲜剂处理对哈密瓜相关抗性酶的影响研究 | 第115-128页 |
5.1 前言 | 第115页 |
5.2 材料与设备 | 第115-116页 |
5.2.1 实验材料 | 第115页 |
5.2.2 主要试剂 | 第115-116页 |
5.2.3 实验仪器与设备 | 第116页 |
5.3 试验方法 | 第116-118页 |
5.3.1 生物保鲜剂的制备 | 第116页 |
5.3.2 样品处理与收集 | 第116页 |
5.3.3 SOD活性测定 | 第116页 |
5.3.4 POD活性测定 | 第116-117页 |
5.3.5 CAT活性测定 | 第117页 |
5.3.6 β-1,3-葡聚糖酶活性测定 | 第117页 |
5.3.7 几丁质酶(CHT)活性测定 | 第117页 |
5.3.8 超微结构观测样品处理及制片方法 | 第117页 |
5.3.9 数据处理 | 第117-118页 |
5.4 结果与讨论 | 第118-127页 |
5.4.1 青霉菌侵染后哈密瓜果实SOD活性的变化 | 第118页 |
5.4.2 青霉菌侵染后哈密瓜果实POD活性的变化 | 第118-119页 |
5.4.3 青霉菌侵染后哈密瓜果实CAT活性的变化 | 第119-120页 |
5.4.4 青霉菌侵染后哈密瓜果实 β-1,3 葡聚糖酶活性的变化 | 第120页 |
5.4.5 青霉菌侵染后哈密瓜果实CHT活性的变化 | 第120-121页 |
5.4.6 保鲜剂处理对贮藏期间哈密瓜SOD活性的影响 | 第121页 |
5.4.7 保鲜剂处理对贮藏期间哈密瓜POD活性影响研究 | 第121-122页 |
5.4.8 保鲜剂处理对贮藏期间哈密瓜CAT活性影响 | 第122-123页 |
5.4.9 保鲜剂处理对贮藏期间哈密瓜果实 β-1, 3 葡聚糖酶活性影响 | 第123-124页 |
5.4.10 保鲜剂处理对贮藏期间哈密瓜CHT活性影响 | 第124页 |
5.4.11 青霉菌侵染前后哈密瓜果实超微结构的变化 | 第124-127页 |
5.5 本章小结 | 第127-128页 |
主要结论与展望 | 第128-130页 |
论文创新点 | 第130-131页 |
致谢 | 第131-132页 |
参考文献 | 第132-149页 |
附录I:攻读博士学位期间发表论文情况 | 第149-150页 |
附录II | 第150-173页 |