基于结构域的基因功能预测算法开发及应用
中文摘要 | 第5-6页 |
英文摘要 | 第6页 |
第一章 引言 | 第7-13页 |
1.1 背景 | 第7-9页 |
1.2 基因功能预测——问题定义 | 第9-10页 |
1.3 相关研究进展 | 第10-11页 |
1.4 本项研究的工作简述 | 第11-13页 |
第二章 方法设计 | 第13-18页 |
2.1 数据准备 | 第13页 |
2.2 结构域与GO词条关联性计算 | 第13页 |
2.3 一致序列与功能特异性位点 | 第13-15页 |
2.4 待测序列打分 | 第15页 |
2.5 用作比较的其他方法 | 第15-17页 |
2.6 整合方法 | 第17-18页 |
第三章 方法评估 | 第18-29页 |
3.1 数据集 | 第18页 |
3.2 评估方法 | 第18页 |
3.3 方法优化 | 第18-21页 |
3.4 序列冗余性的影响 | 第21-22页 |
3.5 与已发表方法的对比 | 第22-25页 |
3.6 对整合方法的评估 | 第25-27页 |
3.7 几种方法运行时间的比较 | 第27-29页 |
第四章 方法应用 | 第29-37页 |
4.1 数据准备 | 第29页 |
4.2 结核分枝杆菌全基因组功能预测及结果评估 | 第29-30页 |
4.3 全基因组功能预测结果的筛选 | 第30-31页 |
4.4 功能相关性与蛋白质相互作用的关联分析 | 第31-34页 |
4.5 差异表达基因的功能富集分析 | 第34-37页 |
第五章 讨论 | 第37-42页 |
5.1 方法设计的合理性与创新点 | 第37-38页 |
5.2 不足之处与可能的改进途径 | 第38-40页 |
5.3 整合算法的优势 | 第40页 |
5.4 功能预测的应用价值 | 第40-42页 |
第六章 结论 | 第42-43页 |
第七章 参考文献 | 第43-48页 |
致谢 | 第48-49页 |