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基于结构域的基因功能预测算法开发及应用

中文摘要第5-6页
英文摘要第6页
第一章 引言第7-13页
    1.1 背景第7-9页
    1.2 基因功能预测——问题定义第9-10页
    1.3 相关研究进展第10-11页
    1.4 本项研究的工作简述第11-13页
第二章 方法设计第13-18页
    2.1 数据准备第13页
    2.2 结构域与GO词条关联性计算第13页
    2.3 一致序列与功能特异性位点第13-15页
    2.4 待测序列打分第15页
    2.5 用作比较的其他方法第15-17页
    2.6 整合方法第17-18页
第三章 方法评估第18-29页
    3.1 数据集第18页
    3.2 评估方法第18页
    3.3 方法优化第18-21页
    3.4 序列冗余性的影响第21-22页
    3.5 与已发表方法的对比第22-25页
    3.6 对整合方法的评估第25-27页
    3.7 几种方法运行时间的比较第27-29页
第四章 方法应用第29-37页
    4.1 数据准备第29页
    4.2 结核分枝杆菌全基因组功能预测及结果评估第29-30页
    4.3 全基因组功能预测结果的筛选第30-31页
    4.4 功能相关性与蛋白质相互作用的关联分析第31-34页
    4.5 差异表达基因的功能富集分析第34-37页
第五章 讨论第37-42页
    5.1 方法设计的合理性与创新点第37-38页
    5.2 不足之处与可能的改进途径第38-40页
    5.3 整合算法的优势第40页
    5.4 功能预测的应用价值第40-42页
第六章 结论第42-43页
第七章 参考文献第43-48页
致谢第48-49页

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