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粘球菌通过mts基因簇调控社会性细胞行为以适应海水生境的分子机制

摘要第13-17页
ABSTRACT第17-19页
符号说明及缩写词第20-23页
第一章 文献综述第23-35页
    1.1 粘细菌和其社会性行为第23-28页
        1.1.1 粘细菌的S运动第24-27页
            1.1.1.1 细菌的四型菌毛第24-26页
            1.1.1.2 粘球菌的胞外多糖第26-27页
        1.1.2 粘细菌生物膜的形成第27-28页
        1.1.3 粘细菌子实体的形成第28页
    1.2 海洋耐盐粘球菌第28-30页
        1.2.1 HW-1的发现及对海水环境的适应第29页
        1.2.2 HW-1在海水条件下的S运动增强第29-30页
    1.3 mts基因簇的发现及作用第30-32页
        1.3.1 HW-1的S运动缺陷突变株HL-1的发现第30-31页
        1.3.2 mts基因簇的命名及DK1622中同源基因的确定第31页
        1.3.3 DK1622中插入失活突变株和单敲除突变株的构建及性质分析第31-32页
    1.4 本论文的开展思路及研究内容第32-35页
第二章 海水条件下HW-1社会性行为增强的表型分析第35-49页
    2.1 实验材料第35-40页
        2.1.1 菌株及质粒第35-36页
        2.1.2 主要培养基及试剂第36-38页
        2.1.3 仪器设备与耗材第38-40页
    2.2 实验方法第40-41页
        2.2.1 海水条件下各菌株的S运动分析第40页
        2.2.2 海水条件下各菌株的EPS产生能力分析第40-41页
            2.2.2.1 细胞外基质染料结合能力实验第40-41页
            2.2.2.2 胞外多糖含量检测-钙荧光白染色法第41页
        2.2.3 海水条件下各菌株的生物膜形成能力分析第41页
    2.3 实验结果和分析第41-46页
        2.3.1 海水条件下各菌株的S运动分析第41-43页
        2.3.2 海水条件下各菌株的EPS产生能力分析第43-46页
        2.3.3 海水条件下各菌株的生物膜形成能力分析第46页
    2.4 本章小结第46-49页
第三章 mts基因簇产物的生物信息学分析与相互作用验证第49-93页
    3.1 mts基因簇的生物信息学分析第49-52页
        3.1.1 相关基因的生物信息学分析预测软件第49-50页
        3.1.2 各基因结构域及信号肽预测第50-52页
    3.2 mts基因簇的共转录分析第52-72页
        3.2.1 mts基因簇的共转录分析第52-58页
            3.2.1.1 实验材料第52-53页
            3.2.1.2 实验方法第53-58页
            3.2.1.3 实验结果第58页
        3.2.2 启动子预测第58-60页
        3.2.3 qPCR分析mts基因簇各基因的表达量第60-72页
            3.2.3.1 实验材料第60-61页
            3.2.3.2 实验方法第61-63页
            3.2.3.3 实验结果第63-72页
    3.3 酵母双杂交检测Mts不同组分之间可能的相互作用第72-90页
        3.3.1 实验材料第73-78页
            1. 菌株和质粒第73-75页
            2. 主要培养基和试剂第75-77页
            3. 仪器设备和耗材第77-78页
        3.3.2 实验方法第78-83页
            3.3.2.1 质粒的构建第78-80页
            3.3.2.2 酵母共转化菌株的获得第80-81页
            3.3.2.3 相互作用的验证第81-83页
        3.3.3 实验结果第83-90页
            3.3.3.1 片段自激活检测选择合适的3AT浓度第83-84页
            3.3.3.2 共转化菌株在缺陷型平板上的生长情况第84-85页
            3.3.3.3 X-α-GAL半乳糖苷酶活性检测验证相互作用的蛋白第85-89页
            3.3.3.4 酵母转化子β-半乳糖苷酶活性分析第89-90页
    3.4 本章小结第90-93页
第四章 海水条件下mts上调S运动的机制第93-121页
    4.1 mts与epsA双敲及回补突变株的构建及性质分析第93-103页
        4.1.1 实验材料第93-96页
            1. 菌株与质粒第93-96页
            2. 主要培养基及试剂第96页
            3. 仪器设备与耗材第96页
        4.1.2 实验方法第96-101页
            4.1.2.1 mts与epsA双敲除突变株的构建第96-99页
            4.1.2.2 回补突变株的构建第99页
            4.1.2.3 双敲及回补突变株的性质验证第99-101页
        4.1.3 实验结果第101-103页
    4.2 Western blot检测surface pili的量第103-108页
        4.2.1 实验材料第103-105页
        4.2.2 实验方法第105-107页
            4.2.2.1 Surface pili的提取第105-106页
            4.2.2.2 Western blot第106-107页
        4.2.3 实验结果第107-108页
    4.3 甲基纤维素环境中菌株运动速率的分析第108-110页
        4.3.1 实验材料第108页
        4.3.2 实验方案第108-109页
        4.3.3 实验结果第109-110页
    4.4 MtsB的荧光标记第110-114页
        4.4.1 实验材料第110页
        4.4.2 实验方法第110-113页
        4.4.3 实验结果第113-114页
    4.5 酵母双杂交分析可能的相互作用第114-119页
        4.5.1 实验材料第114页
        4.5.2 实验方法第114-115页
        4.5.3 实验结果第115-119页
            4.5.3.1 共转化菌株在缺陷型平板上的生长情况第115-116页
            4.5.3.2 X-α-GAL半乳糖苷酶活性检测验证相互作用的蛋白第116-119页
            4.5.3.3 酵母转化子β-半乳糖苷酶活性分析第119页
    4.6 本章小结第119-121页
第五章 海水条件下mts上调EPS产生的机制分析第121-129页
    5.1 mts与difA双敲除及回补突变株的获得第121页
    5.2 mts与difA双敲除及回补突变株胞外EPS分析第121-124页
        5.2.1 实验材料第122-123页
            5.2.1.1 菌株及质粒第122页
            5.2.1.2 主要培养基和试剂第122页
            5.2.1.3 仪器设备和耗材第122-123页
        5.2.2 实验方法第123页
            5.2.2.1 各菌株的EPS产生能力分析第123页
            5.2.2.2 各菌株的S运动分析第123页
        5.2.3 实验结果第123-124页
    5.3 酵母双杂交分析蛋白相互作用第124-127页
        5.3.1 实验材料第124页
        5.3.2 实验方法第124-125页
        5.3.3 实验结果第125-127页
            5.3.3.1 共转化菌株在缺陷型平板上的生长情况第125页
            5.3.3.2 X-α-GAL半乳糖苷酶活性检测验证相互作用的蛋白第125-127页
            5.3.3.3 酵母转化子β-半乳糖苷酶活性分析第127页
    5.4 本章小结第127-129页
总结与展望第129-133页
附录第133-139页
    附录一 本文中用到的质粒图谱第133-137页
    附录二 本文涉及的常用实验步骤第137-139页
参考文献第139-145页
致谢第145-146页
附件第146页

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