摘要 | 第7-10页 |
Abstract | 第10-12页 |
符号说明及缩写词 | 第13-15页 |
第一章 文献综述 | 第15-35页 |
1.1. 粘细菌及其经典的多细胞群体行为的概述 | 第15-19页 |
1.1.1. 粘球菌的双运动系统 | 第15-16页 |
1.1.2. 多细胞子实体的发生及抗逆性粘孢子的分化过程 | 第16-19页 |
1.1.3. 群体捕食行为 | 第19页 |
1.2. 双组分信号传导系统 | 第19-28页 |
1.2.1. 双组份信号传导系统在原核生物中的研究进展 | 第20-22页 |
1.2.2. 原核生物中双组份信号传导系统的研究方法 | 第22-28页 |
1.3. 比较全局转录组分析 | 第28-29页 |
1.4. 粘球菌中双组份信号传导系统的研究进展 | 第29-32页 |
1.5. 实验室前期研究进展和本论文实验开展思路 | 第32-35页 |
第二章 MXAN1093蛋白的磷酸化位点验证 | 第35-53页 |
2.1. 实验材料 | 第37-40页 |
2.1.1. 菌株与质粒 | 第37-38页 |
2.1.2. 培养基 | 第38-40页 |
2.2. 实验方法 | 第40-47页 |
2.2.1. MXAN1093蛋白的磷酸化位点体内验证 | 第40-44页 |
2.2.2. MXAN1093蛋白的磷酸化位点体外验证 | 第44-47页 |
2.3. 实验结果及分析 | 第47-53页 |
2.3.1. MXAN1093蛋白的磷酸化位点体内验证结果 | 第47-50页 |
2.3.2. MXAN1093蛋白的磷酸化位点体外验证结果 | 第50-53页 |
第三章 比较转录组分析MXAN1093蛋白调控的靶基因 | 第53-83页 |
3.1. 实验材料 | 第54-56页 |
3.1.1. 菌株与质粒 | 第54-55页 |
3.1.2. 培养基 | 第55页 |
3.1.3. 溶液试剂与仪器 | 第55-56页 |
3.2. 实验方法 | 第56-64页 |
3.2.1. MXAN1093的DNA结合结构域对DK1622发育的影响 | 第56页 |
3.2.2. 不同发育时间点的DK1622和ΔMXAN1093菌株的收集 | 第56页 |
3.2.3. 不同发育时期的粘球菌RNA提取方法的选择优化 | 第56-60页 |
3.2.4. 比较转录组分析DK1622和ΔMXAN1093差异表达基因 | 第60页 |
3.2.5. 比较转录组分析得到的差异表达基因的筛选 | 第60-61页 |
3.2.6. qRT-PCR验证差异表达基因的RNA-seq数据 | 第61-63页 |
3.2.7. 差异表达基因/基因簇敲除菌株的构建 | 第63-64页 |
3.2.8. 环境胁迫条件下,差异表达基因/基因簇的敲除菌株的子实体发育分析 | 第64页 |
3.3. 实验结果及分析 | 第64-83页 |
3.3.1. MXAN1093 DNA结合结构域敲除菌株的发育分析 | 第64-66页 |
3.3.2. 不同发育时期的粘球菌RNA的提取 | 第66-68页 |
3.3.3. 比较转录组分析得到的差异表达基因的筛选结果 | 第68-69页 |
3.3.4. qRT-PCR验证差异表达基因的RNA-seq数据 | 第69-73页 |
3.3.5. 差异表达基因/基因簇的敲除载体构建结果 | 第73-74页 |
3.3.6. 环境胁迫条件下,差异表达基因/基因簇的敲除菌株的子实体发育分析结果 | 第74-83页 |
第四章 细菌双杂交技术筛选MXAN1093的互作激酶 | 第83-100页 |
4.1. 实验材料 | 第85-86页 |
4.1.1. 菌株和质粒 | 第85页 |
4.1.2. 培养基 | 第85-86页 |
4.1.3. 试剂及仪器耗材 | 第86页 |
4.2. 实验方法 | 第86-92页 |
4.2.1. 生物信息学分析软件 | 第86-87页 |
4.2.2. 引物信息 | 第87页 |
4.2.3. 含有诱饵蛋白的诱饵菌株的构建 | 第87-88页 |
4.2.4. 基因组文库的构建及筛选 | 第88-90页 |
4.2.5. 全长激酶质粒库和激酶HPK结构域质粒库的构建 | 第90-91页 |
4.2.6. 细菌双杂交系统验证MXAN1093和激酶之间的相互作用 | 第91-92页 |
4.3. 实验结果及分析 | 第92-100页 |
4.3.1. 生物信息学分析结果 | 第92-93页 |
4.3.2 含有诱饵蛋白的诱饵菌株的构建 | 第93-97页 |
4.3.3. 基因组文库的构建及筛选 | 第97-99页 |
4.3.4. 全长激酶质粒库和激酶HPK结构域质粒的构建结果 | 第99-100页 |
第五章 总结与展望 | 第100-102页 |
附录 | 第102-120页 |
参考文献 | 第120-135页 |
致谢 | 第135-136页 |
附件 | 第136页 |