| 中文摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩写名词表 | 第10-11页 |
| 第一章 调控水稻光敏不育基因pms3 的RNA二级结构测定 | 第11-33页 |
| 1 文献综述 | 第11-21页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第11页 |
| 1.2 水稻雄性不育研究进展 | 第11-14页 |
| 1.2.1 水稻细胞质雄性不育 | 第12页 |
| 1.2.2 水稻光（温）敏雄性不育的研究进展 | 第12-14页 |
| 1.3 Non-coding RNA的研究进展 | 第14-17页 |
| 1.3.1 Long non-coding RNA | 第14-15页 |
| 1.3.2 miRNAs, siRNAs和phasiRNAs | 第15-16页 |
| 1.3.3 RNA二级结构的功能 | 第16-17页 |
| 1.4 RNA二级结构研究进展 | 第17-21页 |
| 1.4.1 RNA二级结构的化学方法分析 | 第18-20页 |
| 1.4.2 RNA二级结构预测的研究进展 | 第20-21页 |
| 1.5 研究的目的和意义 | 第21页 |
| 2 材料和方法 | 第21-25页 |
| 2.1 载体构建 | 第21-22页 |
| 2.2 SHAPE法单碱基分辨率分析RNA二级结构 | 第22-25页 |
| 2.2.1 RNA的体外转录 | 第22-23页 |
| 2.2.2 SHAPE法 | 第23-25页 |
| 3 结果与分析 | 第25-31页 |
| 3.1 RNA二级结构的软件预测对比 | 第25-28页 |
| 3.2 SHAPE方法的最优条件 | 第28-29页 |
| 3.3 二级结构的软件预测以及与实验结合 | 第29-31页 |
| 4 讨论 | 第31-33页 |
| 4.1 磷屏扫描图的分析 | 第31-32页 |
| 4.2 Transcript-1 的RNA二级结构 | 第32-33页 |
| 第二章 RPA3107 蛋白的晶体结构研究 | 第33-66页 |
| 1 文献综述 | 第33-46页 |
| 1.1 双组分信号转导系统概述 | 第33-34页 |
| 1.2 组氨酸蛋白激酶 | 第34-37页 |
| 1.2.1 蛋白结构域组成 | 第34-35页 |
| 1.2.2 中心激酶结构域的结构和功能 | 第35-37页 |
| 1.2.3 传递信号机制 | 第37页 |
| 1.2.4 磷酸基团传递的特异性 | 第37页 |
| 1.3 信号反应调节因子 | 第37-40页 |
| 1.3.1 RR结构域结构及接收子活性 | 第37-39页 |
| 1.3.2 接收子结构域的结构功能 | 第39页 |
| 1.3.3 信号反应调节因子研究进展 | 第39-40页 |
| 1.4 结构生物学 | 第40-46页 |
| 1.4.1 概述 | 第40-41页 |
| 1.4.2 蛋白质晶体 | 第41-42页 |
| 1.4.3 数据收集 | 第42-43页 |
| 1.4.4 相位问题及解析方法 | 第43-45页 |
| 1.4.5 结构修正 | 第45-46页 |
| 1.5 本研究的目的与意义 | 第46页 |
| 2 材料与方法 | 第46-48页 |
| 2.1 蛋白质的表达和纯化 | 第46-47页 |
| 2.1.1 母体蛋白的表达纯化 | 第46页 |
| 2.1.2 硒代蛋白的表达纯化 | 第46-47页 |
| 2.2 RPA3017 和SeMet-RPA3017 蛋白结晶条件筛选与晶体优化 | 第47页 |
| 2.2.1 初试结晶条件的筛选 | 第47页 |
| 2.2.2 结晶条件的优化 | 第47页 |
| 2.3 晶体X光衍射数据收集，结构模型的构建和优化 | 第47-48页 |
| 2.3.1 晶体衍射数据收集处理 | 第47页 |
| 2.3.2 结构的解析 | 第47-48页 |
| 3 结果与分析 | 第48-64页 |
| 3.1 RPA3017 蛋白的表达纯化 | 第48-49页 |
| 3.2 晶体生长及优化 | 第49-51页 |
| 3.2.1 结晶条件初筛结果 | 第49页 |
| 3.2.2 晶体的优化 | 第49-51页 |
| 3.3 衍射数据收集及数据处理 | 第51-52页 |
| 3.4 结构解析 | 第52-55页 |
| 3.4.1 RPA3017 晶体结构解析 | 第52-53页 |
| 3.4.2 最终模型的质量评估 | 第53-55页 |
| 3.5 RPA3017 蛋白结构分析 | 第55-64页 |
| 3.5.1 RPA3017 总体结构概述及活性位点处结构 | 第55-56页 |
| 3.5.2 RPA3017 二聚体结构 | 第56-58页 |
| 3.5.3 比较RPA3017 的结构与家族中其他反应调节因子的结构差异 | 第58-59页 |
| 3.5.4 RPA3017 与RpBphP2 之间磷酸基团传递反应 | 第59-61页 |
| 3.5.5 RPA3017 和RpBphP2 的组氨酸激酶结构域之间的互作界面 | 第61-62页 |
| 3.5.6 RPA3017 特异识别序列 | 第62-64页 |
| 4 讨论 | 第64-66页 |
| 4.1 RPA3017 在植物中的同源蛋白 | 第64-65页 |
| 4.2 晶体结晶条件的优化 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-72页 |
| 附录I 溶液配制 | 第72-74页 |
| 附录II 试验方法 | 第74-79页 |
| 致谢 | 第79页 |
