| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5页 |
| 引言 | 第8-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-15页 |
| 1.1 比较基因组学研究背景介绍 | 第9-10页 |
| 1.1.1 生物信息学 | 第9页 |
| 1.1.2 比较基因组学发展 | 第9-10页 |
| 1.2 全基因组加倍 | 第10-13页 |
| 1.3 基因置换研究现状 | 第13页 |
| 1.4 课题研究内容及目标 | 第13-15页 |
| 第2章 花生与多倍化关联的同源基因组结构分析 | 第15-25页 |
| 2.1 基因组数据材料 | 第15-16页 |
| 2.2 花生基因组内同源结构分析 | 第16-19页 |
| 2.3 基因组间同源结构的比较分析 | 第19-24页 |
| 2.4 本章小结 | 第24-25页 |
| 第3章 花生与多倍化关联的层级同源基因列表构建 | 第25-34页 |
| 3.1 多基因组层级同源基因列表构建方法 | 第25-26页 |
| 3.1.1 共线性分析 | 第25页 |
| 3.1.2 同源分组推断基因组同源 | 第25-26页 |
| 3.2 推断基因组内、间同源染色体片段 | 第26-29页 |
| 3.2.1 基因组内重复染色体片段 | 第26-27页 |
| 3.2.2 基因组间直系同源基因分析 | 第27-29页 |
| 3.3 多基因组同源共线性列表 | 第29-31页 |
| 3.4 重复基因的保留与丢失 | 第31-32页 |
| 3.4.1 基因丢失模型构建 | 第31页 |
| 3.4.2 基因丢失与染色体碎片化规律 | 第31-32页 |
| 3.5 本章小结 | 第32-34页 |
| 第4章 花生基因组基因置换比较分析及对基因组的影响 | 第34-41页 |
| 4.1 构建基因置换推断方法 | 第34-36页 |
| 4.2 花生A、B重复基因中基因置换研究 | 第36-40页 |
| 4.2.1 基因置换与物理位置、GC含量关系 | 第36-38页 |
| 4.2.2 基因置换与基因功能关系 | 第38-40页 |
| 4.3 本章小结 | 第40-41页 |
| 结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-46页 |
| 附录A 主要程序 | 第46-50页 |
| 附录B 基因置换集合 | 第50-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 导师简介 | 第55-56页 |
| 作者简介 | 第56-57页 |
| 学位论文数据集 | 第57页 |