| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-17页 |
| 1.1 瓜类细菌性果斑病研究概况 | 第9-10页 |
| 1.1.1 病原菌生物学特性 | 第9页 |
| 1.1.2 果斑病为害症状 | 第9-10页 |
| 1.2 转录组学技术研究进展 | 第10-14页 |
| 1.2.1 转录组学的主要技术方法 | 第10-12页 |
| 1.2.2 转录组学技术在植物中的应用 | 第12-14页 |
| 1.3 实时荧光定量PCR技术 | 第14-16页 |
| 1.3.1 qRT-PCR的标记方法 | 第15页 |
| 1.3.2 qRT-PCR内参基因的选择 | 第15页 |
| 1.3.3 qRT-PCR技术的应用 | 第15-16页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第16-17页 |
| 第二章 西瓜、甜瓜应答西瓜噬酸菌侵染的转录组分析 | 第17-74页 |
| 2.1 试验材料 | 第17页 |
| 2.1.1 仪器设备 | 第17页 |
| 2.1.2 试剂 | 第17页 |
| 2.1.3 西瓜、甜瓜材料和西瓜噬酸菌菌株 | 第17页 |
| 2.2 试验方法 | 第17-22页 |
| 2.2.1 试验材料接种和取样 | 第17-18页 |
| 2.2.2 不同菌株对西瓜/甜瓜致病力测定 | 第18页 |
| 2.2.3 植物总RNA提取 | 第18页 |
| 2.2.4 文库构建和转录组测序 | 第18-19页 |
| 2.2.5 转录组生物信息学分析 | 第19-20页 |
| 2.2.6 实时荧光定量PCR（q RT-PCR）验证 | 第20-22页 |
| 2.3 结果与分析 | 第22-74页 |
| 2.3.0 不同菌株对西瓜/甜瓜致病力测定 | 第22-23页 |
| 2.3.1 RNA质量检测 | 第23-24页 |
| 2.3.2 测序质量评估 | 第24-28页 |
| 2.3.3 实时荧光定量PCR验证基因表达水平 | 第28-30页 |
| 2.3.4 差异表达基因分析 | 第30-53页 |
| 2.3.5 差异表达基因的GO功能注释 | 第53-70页 |
| 2.3.6 差异表达基因的代谢通路分析 | 第70-74页 |
| 第三章 讨论 | 第74-80页 |
| 3.1 显著差异表达基因筛选 | 第74页 |
| 3.2 抗性代谢相关途径及基因分析 | 第74-80页 |
| 3.2.1 植物-病原菌互作途径及相关基因 | 第74-77页 |
| 3.2.2 苯丙烷生物合成途径及相关基因 | 第77-79页 |
| 3.2.3 光合天线蛋白相关基因 | 第79-80页 |
| 第四章 结论 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-90页 |
| 作者简介 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91页 |