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铬耐受/还原菌的多样性调研

致谢第6-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-10页
1 引言第13-27页
    1.1 铬污染与微生物修复第14-16页
        1.1.1 铬污染现状第14页
        1.1.2 铬污染的危害第14-15页
        1.1.3 铬污染的微生物修复技术第15-16页
    1.2 细菌铬耐受、还原机制第16-22页
        1.2.1 铬外排机理第17-19页
        1.2.2 铬还原机理第19-21页
        1.2.3 DNA损伤修复第21页
        1.2.4 铬耐受菌和铬耐受还原菌第21-22页
    1.3 微生物群落多样性研究方法第22-25页
        1.3.1 传统培养法第22-23页
        1.3.2 Biolog微平板法第23页
        1.3.3 磷脂脂肪酸方法第23-24页
        1.3.4 现代分子生物学方法第24-25页
    1.4 论文选题及技术路线第25-27页
        1.4.1 论文选题第25页
        1.4.2 技术路线第25-27页
2 铬耐受菌的多样性调研第27-44页
    2.1 实验材料及仪器第27页
    2.2 实验方法第27-29页
        2.2.1 长链chrA基因的搜索第27页
        2.2.2 长链chrA基因序列OTU聚类第27页
        2.2.3 长链ChrA系统发育树的构建第27-28页
        2.2.4 培养法筛选六价铬耐受菌第28页
        2.2.5 六价铬耐受菌的鉴定第28页
        2.2.6 六价铬耐受菌对Cr(Ⅵ)的耐受能力的测定第28-29页
    2.3 结果与讨论第29-42页
        2.3.1 在JGI Genome database中铬耐受菌的搜索结果及多样性分析..第29-33页
        2.3.2 长链ChrA蛋白序列的系统发育分析第33-34页
        2.3.3 六价铬耐受菌的筛选及多样性分析第34-35页
        2.3.4 文献中已筛选到的铬耐受菌株的多样性分析第35-40页
        2.3.5 新菌种Epilithonimonas xixisoli sp.nov.的铬耐受能力测定第40-41页
        2.3.6 基因挖掘法、培养法和文献调研所得结果的综合分析第41-42页
    2.4 小结第42-44页
3 铬还原菌的多样性调研第44-47页
    3.1 实验材料及仪器第44页
    3.2 实验方法第44页
        3.2.1 Cr(Ⅵ)reductase基因的搜索第44页
        3.2.2 系统发育树的构建第44页
    3.3 结果与讨论第44-46页
        3.3.1 在JGI Genome database中铬还原菌的搜索结果及多样性分析第44-45页
        3.3.2 Cr(Ⅵ)reductase蛋白序列的系统发育分析第45-46页
    3.4 小结第46-47页
4 铬耐受还原菌的多样性调研第47-59页
    4.1 实验材料及仪器第47页
    4.2 实验方法第47-48页
        4.2.1 长链chrA及Cr(Ⅵ)reductase基因的搜索第47页
        4.2.2 系统发育树的构建第47-48页
        4.2.3 六价铬耐受还原菌的筛选及还原能力测定第48页
    4.3 结果与讨论第48-57页
        4.3.1 在JGI Genome database中铬耐受还原菌的搜索结果及多样性分析第48-49页
        4.3.2 长链ChrA蛋白、Cr(Ⅵ)reductase蛋白和16S rRNA基因序列的系统发育分析第49-51页
        4.3.3 六价铬耐受还原菌的筛选第51-52页
        4.3.4 六价铬耐受还原菌Arthrobacter sp.GL06还原能力的测定第52-53页
        4.3.5 文献中已筛选到的铬耐受还原菌株的多样性分析第53-56页
        4.3.6 基因挖掘法、培养法和文献调研所得结果的综合分析第56-57页
    4.4 小结第57-59页
5 研究结论与展望第59-61页
    5.1 研究结论第59-60页
    5.2 展望第60-61页
参考文献第61-72页
作者简历第72页

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