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甘蔗果糖激酶基因家族基因组演化及功能研究

中文摘要第2-3页
Abstract第3-4页
中文文摘第5-12页
绪论第12-20页
    1 甘蔗的遗传背景第12-15页
        1.1 甘蔗的遗传多样性及分子细胞遗传学第12-14页
        1.2 甘蔗与高粱基因组结构的保守性和共线性第14-15页
    2 植物糖代谢及果糖激酶概述第15-18页
        2.1 植物的糖代谢第15-17页
        2.2 植物果糖激酶研究进展第17-18页
    3 本研究的目的和意义第18-20页
第一章 甘蔗果糖激酶基因家族的鉴定和演化分析第20-36页
    1 前言第20页
    2 实验材料和方法第20-22页
        2.1 实验材料第20页
        2.2 实验仪器第20-21页
        2.3 实验试剂第21页
        2.4 实验方法第21-22页
            2.4.1 甘蔗BAC文库的测序第21页
            2.4.2 甘蔗果糖激酶基因家族及其单倍型基因结构注释第21-22页
            2.4.3 基因家族系统进化树的构建和结构比较第22页
    3 实验结果与分析第22-34页
        3.1 甘蔗果糖激酶基因家族的鉴定及比较分析第22-24页
        3.2 甘蔗果糖激酶基因家族单倍型分析第24-30页
            3.2.1 甘蔗果糖激酶基因家族结构域和基因单倍型分析第24-28页
            3.2.2 甘蔗果糖激酶基因家族各单倍型基因结构注释第28页
            3.2.3 甘蔗果糖激酶基因家族基因选择压力分析第28-30页
        3.3 植物果糖激酶基因家族系统分析和结构注释第30-34页
            3.3.1 植物果糖激酶基因家族系统分析第30-31页
            3.3.2 植物果糖激酶基因家族结构注释及分析第31-34页
    4 讨论第34-36页
第二章 甘蔗果糖激酶基因家族的表达量分析第36-62页
    1 前言第36页
    2 实验材料和方法第36-41页
        2.1 植物材料第36-37页
            2.1.1 成熟前期和成熟期甘蔗材料第36-37页
            2.1.2 激素处理的甘蔗材料第37页
        2.2 试剂和仪器第37-38页
            2.2.1 试剂第37-38页
            2.2.2 仪器第38页
        2.3 实验方法第38-41页
            2.3.1 甘蔗组织总RNA的提取第38-39页
                2.3.1.1 总RNA的初提第38-39页
                2.3.1.2 RNA样品的消化第39页
                2.3.1.3 RNA重新抽提第39页
                2.3.1.4 RNA样品检测第39页
            2.3.2 甘蔗RNA-seq文库构建第39-40页
            2.3.3 甘蔗RNA-seq分析第40页
            2.3.4 甘蔗果糖激酶基因家族qRT-PCR分析第40-41页
    3 结果及分析第41-58页
        3.1 苗期、成熟前期和成熟期甘蔗果糖激酶基因家族共表达分析 30第41-45页
        3.2 甘蔗果糖激酶基因家族响应激素胁迫的共表达分析第45-58页
            3.2.1 甘蔗果糖激酶基因家族响应PEG激素胁迫的共表达分析第45页
            3.2.2 甘蔗果糖激酶基因家族响应ABA激素胁迫的共表达分析第45-46页
            3.2.3 甘蔗果糖激酶基因家族响应IAA激素胁迫的共表达分析第46-48页
            3.2.4 甘蔗果糖激酶基因家族响应GA激素胁迫的共表达分析第48-49页
            3.2.5 甘蔗果糖激酶基因家族响应GA激素胁迫的共表达分析第49-50页
            3.2.6 甘蔗果糖激酶基因家族响应Et激素胁迫的共表达分析第50-58页
        3.3 RNA-Seq数据qRT-PCR验证第58页
    4 讨论第58-62页
第三章 拟南芥果糖激酶纯合突变体鉴定第62-72页
    1 前言第62页
    2 实验材料和方法第62-66页
        2.1 植物材料第62-63页
        2.2 试剂和仪器第63页
            2.2.1 试剂第63页
            2.2.2 仪器第63页
        2.3 实验方法第63-66页
            2.3.1 甘蔗果糖激酶同源基因的拟南芥T-DNA突变体的搜查第63-64页
            2.3.2 拟南芥T-DNA插入突变体纯合体鉴定策略第64页
            2.3.3 引物设计与合成第64-65页
            2.3.4 拟南芥突变体的基因组提取第65页
            2.3.5 拟南芥突变纯合体苗期根长和茎长的比较第65-66页
            2.3.6 拟南芥纯合突变体两两杂交,筛选纯合双突变体第66页
    3 结果与分析第66-71页
        3.1 拟南芥ScFRK基因家族的T-DNA突变体第66页
        3.2 拟南芥ScFRK基因家族纯合突变体的筛选第66-68页
            3.2.1 拟南芥ScFRK基因家族纯合突变体的引物设计第66-67页
            3.2.2 拟南芥ScFRK纯合突变体的筛选第67-68页
        3.3 拟南芥突变纯合体苗期根长和茎长的比较第68-70页
        3.4 拟南芥纯合双突变体表现观察第70-71页
    4 讨论第71-72页
第四章 甘蔗果糖激酶家族基因的功能分析第72-90页
    1 前言第72页
    2 实验材料与方法第72-77页
        2.1 植物材料第72页
        2.2 试剂和仪器第72-73页
            2.2.1 试剂第72-73页
            2.2.2 仪器第73页
        2.3 实验方法第73-77页
            2.3.1 甘蔗ScFRK基因家族的cDNA克隆和启动子引物设计第73-74页
            2.3.2 Gateway技术第74-75页
            2.3.3 质粒提取第75页
            2.3.4 转化根癌农杆菌第75页
            2.3.5 农杆菌蘸花转化拟南芥法第75页
            2.3.6 用农杆菌蘸花转化拟南芥阳性苗的筛选第75-76页
            2.3.7 拟南芥研究材料的表型分析第76页
            2.3.8 甘蔗果糖激酶基因亚细胞定位第76-77页
    3 结果与分析第77-88页
        3.1 甘蔗果糖激酶基因的克隆第77-78页
        3.2 甘蔗果糖激酶基因载体的构建第78-79页
            3.2.1 过表达载体的构建第78页
            3.2.2 正常表达载体的构建第78-79页
        3.3 甘蔗果糖激酶基因的亚细胞定位第79-81页
        3.4 甘蔗果糖激酶基因遗传转化及功能分析第81-88页
            3.4.1 甘蔗果糖激酶基因遗传转化拟南芥第81-82页
            3.4.2 遗传转化拟南芥纯合突变体及野生型根茎长度的比较第82-88页
    4 讨论第88-90页
第五章 结论第90-92页
参考文献第92-102页
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果第102-104页
致谢第104-106页
个人简历第106-110页

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