| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 1 绪论 | 第11-18页 |
| ·研究背景 | 第11-12页 |
| ·研究意义 | 第12页 |
| ·研究进展 | 第12-18页 |
| ·植物体细胞变异 | 第12页 |
| ·影响体细胞无性系变异的因素 | 第12-14页 |
| ·体细胞无性系变异的鉴定 | 第14-15页 |
| ·转录组概述及其在突变体研究中的应用 | 第15页 |
| ·竹类体细胞无性系再生植株突变体的研究进展 | 第15-16页 |
| ·体细胞突变体突变机制的研究进展 | 第16-17页 |
| ·参与细胞壁形成的基因及调节因子概述 | 第17-18页 |
| ·研究内容 | 第18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-30页 |
| ·材料 | 第18-19页 |
| ·试剂 | 第19-20页 |
| ·仪器设备 | 第20页 |
| ·方法 | 第20-30页 |
| ·发笋量调查、生物量测定和表型统计 | 第20页 |
| ·纤维素、木质素和灰分含量的测定 | 第20-22页 |
| ·纤维形态的测定 | 第22-24页 |
| ·组织形态解剖 | 第24-26页 |
| ·光合速率、气孔导度的测定 | 第26-27页 |
| ·叶绿素含量和可溶性糖含量的测定 | 第27页 |
| ·Total RNA样品的提取及检测 | 第27-28页 |
| ·转录组测序（样品分析及数据的获得） | 第28-30页 |
| ·数据分析 | 第30页 |
| 3 No.29特性 | 第30-34页 |
| ·生物量、纤维含量、木质素含量及纤维形态 | 第30-31页 |
| ·组织形态解剖 | 第31-33页 |
| ·光合指标、叶绿素及可溶性多糖含量 | 第33页 |
| ·结论与讨论 | 第33-34页 |
| 4 转录组分析 | 第34-50页 |
| ·RNA质量检测 | 第34-36页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测结果 | 第34-35页 |
| ·Nanodrop检测结果 | 第35页 |
| ·Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer检测结果 | 第35-36页 |
| ·测序质量评估 | 第36-37页 |
| ·数据组装 | 第37-39页 |
| ·Contigs统计 | 第37-38页 |
| ·Transcripts统计 | 第38-39页 |
| ·Unigene统计 | 第39页 |
| ·ALL-UNIGENE功能注释及COG分类 | 第39-41页 |
| ·ALL-UNIGENE GO分类 | 第41-42页 |
| ·ALL-UNIGENE开放阅读框（ORF）的预测 | 第42-43页 |
| ·ALL-UNIGENE代谢通路分析 | 第43-45页 |
| ·差异表达基因分析 | 第45-48页 |
| ·差异表达基因GO分析 | 第45页 |
| ·差异表达基因代谢通路分析 | 第45-48页 |
| ·SSR分析 | 第48页 |
| ·结论与讨论 | 第48-50页 |
| 5 梁山慈竹生长关键途径的相关基因分析 | 第50-67页 |
| ·纤维素合成途径相关基因分析 | 第50-52页 |
| ·CesA在No.29和CK中的表达分析 | 第50-52页 |
| ·SUS在No.29和CK中的表达分析 | 第52页 |
| ·木质素合成途径相关基因的分析 | 第52-59页 |
| ·PAL在No.29和CK中的表达分析 | 第53-55页 |
| ·4CL在No.29和CK中的表达分析 | 第55-56页 |
| ·CAD在No.29和CK中的表达分析 | 第56-57页 |
| ·LAC在No.29和CK中的表达分析 | 第57-58页 |
| ·prx在No.29和CK中的表达分析 | 第58-59页 |
| ·转录因子分析 | 第59-64页 |
| ·MYB转录因子表达分析 | 第59-60页 |
| ·NAC转录因子表达分析 | 第60-61页 |
| ·WRKY转录因子表达分析 | 第61-63页 |
| ·bZIP转录因子分析 | 第63-64页 |
| ·差异表达基因分析 | 第64-65页 |
| ·结论与讨论 | 第65-67页 |
| 6 体细胞突变体No.29的KEGG富集分析 | 第67-88页 |
| ·信号转导通路调控 | 第67-72页 |
| ·级联反应途径的调控 | 第72-73页 |
| ·氨基酸代谢的影响 | 第73-76页 |
| ·油脂类代谢 | 第76-78页 |
| ·嘧啶和嘌呤代谢 | 第78-80页 |
| ·糖代谢 | 第80-85页 |
| ·纤维素的合成 | 第85页 |
| ·木质素的合成 | 第85-86页 |
| ·结论与讨论 | 第86-88页 |
| 结论 | 第88-90页 |
| 致谢 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-99页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文及研究成果 | 第99页 |