缙云黄芩（Scutellaria tsinyunensis C.Y.Wu et S.Chow）及近缘种基于ITS和cpDNA序列的遗传多样性研究
| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-20页 |
| ·遗传多样性 | 第11-14页 |
| ·遗传多样性的概述 | 第11页 |
| ·遗传结构 | 第11-13页 |
| ·遗传多样性的研究方法 | 第13-14页 |
| ·系统发育分析 | 第14-16页 |
| ·内转录间隔区（ITS）结构及特点 | 第15-16页 |
| ·叶绿体基因组结构及特点 | 第16页 |
| ·缙云黄芩研究进展 | 第16-18页 |
| ·缙云黄芩的生物学和生态学特征 | 第16-17页 |
| ·缙云黄芩的濒危状况 | 第17页 |
| ·缙云黄芩研究进展 | 第17-18页 |
| ·引言 | 第18-20页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第20-30页 |
| ·实验材料 | 第20-23页 |
| ·实验材料采集 | 第20-22页 |
| ·主要实验试剂与耗材 | 第22-23页 |
| ·基因组提取、ITS、cpDNA序列扩增与测序 | 第23-28页 |
| ·基因组DNA提取与检测 | 第23-25页 |
| ·DNA模板的检测 | 第25页 |
| ·PCR扩增引物筛选 | 第25-26页 |
| ·ITS-PCR反应扩增体系的建立 | 第26页 |
| ·cpDNA-PCR反应扩增体系的建立 | 第26-27页 |
| ·PCR反应的扩增和测序 | 第27页 |
| ·纯化回收目的片段 | 第27-28页 |
| ·实验数据分析 | 第28-30页 |
| ·ITS和cp DNA序列测序结果处理 | 第28页 |
| ·单倍型分布图及网络图分析 | 第28页 |
| ·遗传多样性分析 | 第28-29页 |
| ·中性检验 | 第29页 |
| ·遗传结构分析 | 第29页 |
| ·黄芩属物种间ITS序列数据处理分析 | 第29-30页 |
| 第3章 结果与分析 | 第30-51页 |
| ·基因组DNA电泳图谱与PCR产物电泳图谱 | 第30-31页 |
| ·缙云黄芩居群间ITS序列分析 | 第31-40页 |
| ·单倍型变异位点 | 第31-32页 |
| ·单倍型分布与网络图 | 第32-33页 |
| ·遗传多样性分析 | 第33-34页 |
| ·中性检验与瓶颈效应检验 | 第34页 |
| ·遗传结构分析 | 第34-35页 |
| ·基因流分析 | 第35-36页 |
| ·遗传分化系数分析 | 第36页 |
| ·聚类分析 | 第36-37页 |
| ·讨论 | 第37-40页 |
| ·缙云黄芩与近缘种间ITS、cp DNA序列分析 | 第40-51页 |
| ·ITS序列长度和G+C含量统计 | 第40-41页 |
| ·nrRNA二级结构能与选择压力分析 | 第41-42页 |
| ·ITS序列发育树分析 | 第42-43页 |
| ·遗传距离分析 | 第43-45页 |
| ·cpDNA单倍型分布 | 第45页 |
| ·cpDNA变异位点 | 第45-47页 |
| ·遗传多样性和单倍型分析 | 第47-48页 |
| ·Tajima’s D检验 | 第48页 |
| ·单倍型网络图 | 第48-49页 |
| ·讨论 | 第49-51页 |
| 第4章 结论与展望 | 第51-54页 |
| ·结论 | 第51-52页 |
| ·本论文创新之处 | 第52-53页 |
| ·展望 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-62页 |
| 附录 | 第62-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 在校期间发表的论文 | 第72页 |
