| 目录 | 第1-7页 |
| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-20页 |
| 1. 棉花突变体的研究 | 第12-15页 |
| ·形态突变 | 第12-14页 |
| ·纤维品质及棉酚突变 | 第14-15页 |
| ·育性、成熟期及抗性突变 | 第15页 |
| 2. 叶发育机制研究 | 第15-18页 |
| ·叶片发育的调控机理 | 第15-16页 |
| ·植物激素对叶片发育的影响 | 第16-17页 |
| ·小分子 RNA 在植物叶片发育中的调控作用 | 第17-18页 |
| 3. 本研究的意义 | 第18-20页 |
| 第二部分 实验论文 | 第20-81页 |
| 第一章 棉花叶皱小突变体形态及生理分析 | 第20-36页 |
| 1. 实验材料与试剂 | 第20-21页 |
| ·实验材料 | 第20页 |
| ·主要试剂 | 第20页 |
| ·溶液配制方法 | 第20-21页 |
| ·主要实验仪器 | 第21页 |
| 2. 实验方法 | 第21-24页 |
| ·叶皱小突变体表型观察 | 第21-22页 |
| ·叶皱小突变体生理数据测定 | 第22-23页 |
| ·叶皱小突变体胚珠及茎尖石蜡切片 | 第23-24页 |
| 3. 结果分析 | 第24-34页 |
| ·叶皱小突变体形态 | 第24-27页 |
| ·叶皱小突变体遗传规律分析及不同时期胚珠石蜡切片观察 | 第27-31页 |
| ·叶皱小突变体生理指标测定 | 第31-33页 |
| ·叶皱小突变体茎顶端分生组织生长特点 | 第33-34页 |
| 4. 讨论 | 第34-36页 |
| 第二章 棉花叶皱小突变体差异基因筛选及功能验证 | 第36-63页 |
| 1. 实验材料与试剂 | 第36-39页 |
| ·实验材料与培养条件 | 第36页 |
| ·菌种及质粒 | 第36页 |
| ·主要试剂、酶及载体 | 第36-37页 |
| ·主要溶液及培养基配制 | 第37-38页 |
| ·主要仪器设备 | 第38页 |
| ·引物 | 第38页 |
| ·生物信息学分析软件及网站 | 第38-39页 |
| 2. 实验方法 | 第39-48页 |
| ·棉花茎尖中总 RNA 的提取、基因组 DNA 去除及反转录 | 第39-40页 |
| ·转录组及数字表达谱样品准备 | 第40-42页 |
| ·测序结果实时定量 PCR 验证 | 第42-43页 |
| ·目的基因克隆 | 第43-44页 |
| ·DNA 片段回收及载体连接 | 第44-45页 |
| ·感受态的制备及转化 | 第45-47页 |
| ·VIGS 病毒沉默及表型鉴定 | 第47-48页 |
| 3. 结果分析 | 第48-61页 |
| ·转录组数据结果分析 | 第48-53页 |
| ·数字表达谱数据分析 | 第53-57页 |
| ·测序结果定量 PCR 验证 | 第57-58页 |
| ·VIGS 沉默与 IAA 相关的基因 | 第58-61页 |
| 4. 讨论 | 第61-63页 |
| 第三章 利用生物学信息方法挖掘陆地棉茎尖转录组数据 | 第63-81页 |
| 1. 实验材料与试剂 | 第63-65页 |
| ·植物材料 | 第63页 |
| ·酶、试剂及引物 | 第63-64页 |
| ·主要溶液配制方法 | 第64页 |
| ·数据分析网站及软件 | 第64-65页 |
| 2. 实验方法 | 第65-69页 |
| ·DNA 的提取、PCR 扩增及电泳检测 | 第65-66页 |
| ·SSR 位点挖掘及引物设计 | 第66-67页 |
| ·预测编码蛋白框 | 第67页 |
| ·多态性引物的筛选、数据分析及染色体定位 | 第67页 |
| ·基于陆地棉茎尖转录组序列预测 miRNA 及靶基因 | 第67-69页 |
| 3. 结果分析 | 第69-77页 |
| ·基于陆地棉茎尖转录组序列 genic-SSR 标记的开发 | 第69-71页 |
| ·新标记的筛选及应用 | 第71-74页 |
| ·基于陆地棉茎尖转录组序列预测 miRNA 的结果 | 第74-76页 |
| ·靶基因预测及功能分析 | 第76-77页 |
| 4. 讨论 | 第77-81页 |
| ·基于陆地棉茎尖转录组序列开发 genic-SSR 标记及应用 | 第77-79页 |
| ·预测陆地棉茎尖转录组中的 miRNA 及靶基因 | 第79-81页 |
| 附录 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-87页 |
| 攻读硕士期间发表文章及专利 | 第87-88页 |
| 致谢 | 第88页 |
