首页--生物科学论文--昆虫学论文--昆虫分类学论文

侧跗叶蜂属分子系统研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
第一章 绪论部分第12-29页
 1 侧跗叶蜂属研究概况第13-14页
 2 DNA序列生物学信息分析的方法第14-19页
   ·DNA序列分析法概述第15-16页
   ·DNA分子标记在昆虫系统学中的应用第16-19页
     ·线粒体COI基因第16-18页
     ·核糖体ITS2基因第18-19页
 3 分子系统发育树重建方法第19-25页
   ·最大简约法(MP法)第19-21页
   ·最大似然法(ML法)第21-22页
   ·贝叶斯推论法(BI法)第22-23页
   ·距离矩阵法(distance-matrix method)第23-25页
 4 数据系统发生信号强弱的评价及其评估方法第25-26页
   ·数据系统发生信号强弱的评价第25页
   ·数据系统发生信号评估方法第25-26页
 5 系统发生分析的可靠性与置信度检验第26-28页
 6 研究的目的及意义第28-29页
第二章 实验材料与研究方法第29-40页
 1 实验样本第29页
 2 实验器材和试剂第29-30页
   ·实验仪器及耗材第29页
   ·实验试剂及配置第29-30页
     ·实验试剂第29-30页
     ·主要试剂配制第30页
 3 实验方法第30-33页
   ·基因组DNA的提取第30-32页
   ·目的基因及其引物的确定第32页
   ·PCR扩增及其产物检测第32-33页
 4 实验数据处理和分析第33-40页
   ·基因序列校正和拼接第33页
   ·基因序列的比对及模糊比对序列的处理第33页
   ·核苷酸序列组成分析第33-34页
   ·序列数据系统发育信号检验第34-36页
     ·g1统计值检验第34页
     ·碱基饱和替换分析第34-35页
     ·ILD检验第35-36页
   ·重建系统发育树第36-40页
     ·ML法建树第36-37页
     ·MP法建树第37-38页
     ·距离法建树第38页
     ·BI法建树第38-40页
第三章 结果分析与讨论第40-78页
 1 Siobla属的结果分析与讨论第40-66页
   ·Siobla属基因组DNA提取、PCR扩增及测序结果第40-43页
   ·COI基因序列数据分析第43-56页
     ·COI基因核苷酸组成分析第43-44页
     ·COI基因密码子及氨基酸使用频率分析第44-45页
     ·COI基因碱基组成异质性分析第45页
     ·COI基因碱基替换分析第45-46页
     ·各数据组未校正的P距离第46页
     ·COI基因数据组系统发育信号检验第46-48页
     ·基于COI基因数据组的Siobla属系统发育分析第48-55页
     ·基于COI基因数据的Siobla属分析结果与讨论第55-56页
   ·ITS2 rDNA序列数据分析第56-61页
     ·ITS2 rDNA基因核苷酸组成分析第57页
     ·ITS2 rDNA碱基替换分析第57-58页
     ·ITS2 rDNA碱基替换饱和分析第58页
     ·基于ITS2 rDNA的Siobla属系统发育分析第58-61页
     ·基于ITS2 rDNA序列数据对Siobla属系统发育关系的分析结果与讨论第61页
   ·COI&ITS2 rDNA序列联合数据集分析第61-65页
     ·COI&ITS2 rDNA联合数据集核苷酸组成分析第61-62页
     ·COI&ITS2 rDNA数据集碱基替换分析第62页
     ·COI&ITS2 rDNA数据集碱基替换饱和分析第62-63页
     ·COI&ITS2 rDNA数据集可联合性分析第63页
     ·Siobla属基于COI&ITS2 rDNA联合数据集的系统发育分析第63-65页
     ·Siobla属基于COI&ITS2 rDNA联合数据集系统发育分析结果与讨论第65页
   ·基于COI及ITS rDNA的Siobla属系统发育分析结果与讨论第65-66页
     ·对Siobla属系统发育关系的分析结果与讨论第65-66页
     ·不同数据集建树的比较第66页
     ·不同建树方法的比较第66页
 2 Siobla venusta group系统发育关系分析第66-78页
   ·S.venusta group内的系统发育关系分析第68-76页
     ·COI基因核苷酸组成分析第68-69页
     ·COI基因氨基酸组成与使用频率与分析第69-70页
     ·COI基因碱基组成异质性分析第70页
     ·COI基因碱基替换分析第70-71页
     ·数据组未校正的P距离第71-72页
     ·COI基因数据组系统发育信号检验第72-73页
     ·Siobla venusta G.系统发育关系重建第73-76页
   ·S.venusta G.的系统发育关系分析结果与讨论第76-78页
     ·S. venusta G.分析结果与讨论第76-77页
     ·S. venusta complex分析结果与讨论第77-78页
第四章 结论第78-82页
 1 数据分析总结第78-79页
   ·Siobla属的系统发育分析结论第78页
   ·S.venusta group的系统发育分析结论第78-79页
 2 创新及不足之处第79页
 3 展望第79-82页
参考文献第82-92页
附录1 侧跗叶蜂属种团划分表(Niu&Wei,2010)第92-97页
附录2 Siobla属COI基因序列的替换型式异质性差异指数检验表第97-99页
附录3 Siobla属昆虫COI基因数据组P距离及其标准差表第99-101页
附录4 Siobla venusta group COI基因序列的替换型式异质性差异指数检验表第101-102页
附录5 攻读硕士期间已发表论文第102-104页
致谢第104页

论文共104页,点击 下载论文
上一篇:赤皮青冈居群遗传多样性与遗传结构分析
下一篇:麦氏安瘿蜂体内侵染Wolbachia的WO噬菌体的检测及其orf7基因序列分析