基于高通量测序的木麻黄转录组分析
摘要 | 第1-9页 |
Abstract | 第9-12页 |
1 绪论 | 第12-27页 |
·转录组的研究进展 | 第12-21页 |
·转录组定义 | 第12-13页 |
·测序技术的发展 | 第13-16页 |
·转录组测序 | 第16-21页 |
·木麻黄的研究现状 | 第21-25页 |
·木麻黄防护林研究概况 | 第21-22页 |
·木麻黄林生态系统及其可持续管理研究 | 第22-23页 |
·木麻黄遗传改良研究 | 第23-24页 |
·木麻黄分子生物学研究进展 | 第24-25页 |
·研究背景、目的及意义 | 第25-27页 |
·研究背景 | 第25页 |
·研究目的及意义 | 第25-27页 |
2 材料与方法 | 第27-37页 |
·实验材料 | 第27-28页 |
·研究方法 | 第28-37页 |
·木麻黄总RNA提取 | 第28页 |
·转录组测序 | 第28-29页 |
·转录组数据的组装 | 第29-30页 |
·转录组数据的分析 | 第30-37页 |
3 结果与分析 | 第37-52页 |
·RNA提取及质量检测 | 第37页 |
·转录组测序产量统计 | 第37-38页 |
·数据组装 | 第38-41页 |
·ALL-Unigene的功能注释及COG分类 | 第41-43页 |
·ALL-Unigene的GO分类 | 第43-44页 |
·ALL-Unigene代谢通路分析 | 第44-45页 |
·编码蛋白框(CDS)预测 | 第45-46页 |
·差异表达基因分析及GO分析 | 第46-50页 |
·差异表达基因GO分析 | 第47-48页 |
·差异表达基因代谢通路分析 | 第48-50页 |
·SSR分析 | 第50-51页 |
·SNP分析 | 第51-52页 |
4 结论与讨论 | 第52-57页 |
·结论 | 第52-53页 |
·讨论 | 第53-55页 |
·总RNA提取 | 第53页 |
·功能注释 | 第53页 |
·差异表达基因与抗性相关的代谢通路分析 | 第53-54页 |
·SSR和SNP分析 | 第54-55页 |
·创新性 | 第55页 |
·不足与展望 | 第55-57页 |
·不足 | 第55页 |
·展望 | 第55-57页 |
参考文献 | 第57-65页 |
致谢 | 第65页 |