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基于高通量测序的木麻黄转录组分析

摘要第1-9页
Abstract第9-12页
1 绪论第12-27页
   ·转录组的研究进展第12-21页
     ·转录组定义第12-13页
     ·测序技术的发展第13-16页
     ·转录组测序第16-21页
   ·木麻黄的研究现状第21-25页
     ·木麻黄防护林研究概况第21-22页
     ·木麻黄林生态系统及其可持续管理研究第22-23页
     ·木麻黄遗传改良研究第23-24页
     ·木麻黄分子生物学研究进展第24-25页
   ·研究背景、目的及意义第25-27页
     ·研究背景第25页
     ·研究目的及意义第25-27页
2 材料与方法第27-37页
   ·实验材料第27-28页
   ·研究方法第28-37页
     ·木麻黄总RNA提取第28页
     ·转录组测序第28-29页
     ·转录组数据的组装第29-30页
     ·转录组数据的分析第30-37页
3 结果与分析第37-52页
   ·RNA提取及质量检测第37页
   ·转录组测序产量统计第37-38页
   ·数据组装第38-41页
   ·ALL-Unigene的功能注释及COG分类第41-43页
   ·ALL-Unigene的GO分类第43-44页
   ·ALL-Unigene代谢通路分析第44-45页
   ·编码蛋白框(CDS)预测第45-46页
   ·差异表达基因分析及GO分析第46-50页
     ·差异表达基因GO分析第47-48页
     ·差异表达基因代谢通路分析第48-50页
   ·SSR分析第50-51页
   ·SNP分析第51-52页
4 结论与讨论第52-57页
   ·结论第52-53页
   ·讨论第53-55页
     ·总RNA提取第53页
     ·功能注释第53页
     ·差异表达基因与抗性相关的代谢通路分析第53-54页
     ·SSR和SNP分析第54-55页
   ·创新性第55页
   ·不足与展望第55-57页
     ·不足第55页
     ·展望第55-57页
参考文献第57-65页
致谢第65页

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