| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-29页 |
| ·研究背景 | 第11-12页 |
| ·蛋白酪氨酸激酶抑制剂的作用及其机制 | 第12-14页 |
| ·蛋白酪氨酸激酶抑制剂的分类及结构 | 第14-24页 |
| ·Type Ⅰ抑制剂 | 第17-20页 |
| ·Type Ⅱ抑制剂 | 第20-23页 |
| ·新型的酪氨酸激酶抑制剂 | 第23-24页 |
| ·变构激酶抑制剂 | 第23页 |
| ·共价抑制剂 | 第23-24页 |
| ·新激酶抑制剂的发现方法及展望 | 第24-25页 |
| ·计算机辅助药物分子设计 | 第25-28页 |
| ·药物发现的途径与过程 | 第25-26页 |
| ·计算机辅助药物设计的策略及方法 | 第26-28页 |
| ·基于配体的药物设计方法 | 第26-27页 |
| ·基于受体的药物设计方法 | 第27页 |
| ·与组合化学相结合的药物设计方法 | 第27-28页 |
| ·本课题研究的意义与内容 | 第28-29页 |
| 第二章 2-吲哚酮类VEGFR-2蛋白酪氨酸激酶抑制剂的定量构效关系研究 | 第29-40页 |
| ·三维定量构效关系研究方法简介 | 第29-30页 |
| ·实验部分 | 第30-35页 |
| ·实验材料 | 第30-33页 |
| ·活性构象确定及分子叠合 | 第33-34页 |
| ·CoMFA模型的建立 | 第34页 |
| ·CoMSIA模型的建立 | 第34-35页 |
| ·结果与讨论 | 第35-39页 |
| ·CoMFA、CoMSIA模型的统计学参数 | 第35-36页 |
| ·QSAR模型验证 | 第36-37页 |
| ·三维等值线图 | 第37-39页 |
| ·结论 | 第39-40页 |
| 第三章、分子对接研究 | 第40-59页 |
| ·分子对接简介 | 第40页 |
| ·分子对接的基本方法 | 第40-43页 |
| ·刚性的分子对接方法 | 第40-42页 |
| ·柔性的分子对接方法 | 第42-43页 |
| ·打分函数 | 第43-44页 |
| ·基于分子力场的方法 | 第43页 |
| ·基于经验的回归参数的方法 | 第43页 |
| ·基于知识的打分函数 | 第43-44页 |
| ·几种分子对接方法简介 | 第44-45页 |
| ·对接软件DOCK简介 | 第44-45页 |
| ·对接软件AUTODOCK简介 | 第45页 |
| ·对接软件FiexX简介 | 第45页 |
| ·对接软件Affinity简介 | 第45页 |
| ·分子对接平台及苯并咪唑衍生物的对接研究 | 第45-46页 |
| ·设备、系统和软件 | 第45页 |
| ·软件平台 | 第45-46页 |
| ·DOCK6.1软件的安装 | 第46页 |
| ·苯并咪唑衍生物的分子设计 | 第46-47页 |
| ·苯并咪唑衍生物的对接研究的准备 | 第47-48页 |
| ·血管内皮生长因子受体-2 PDB文件的准备 | 第47页 |
| ·受体文件的准备 | 第47-48页 |
| ·配体文件的准备 | 第48页 |
| ·设计的配体的准备 | 第48页 |
| ·苯并咪唑衍生物与VEGFR-2对接研究 | 第48-55页 |
| ·生成靶蛋白分子的分子表面文件 | 第48-49页 |
| ·Sphgen程序生成负模 | 第49页 |
| ·选择一簇负模进行对接计算 | 第49页 |
| ·格点计算 | 第49-50页 |
| ·在活性位点生成一个盒子 | 第49-50页 |
| ·生成栅格 | 第50页 |
| ·半柔性对接 | 第50-55页 |
| ·对接结果 | 第50-55页 |
| ·对接数据分析 | 第55页 |
| ·DOCK后处理及分析 | 第55-58页 |
| ·用Chimera软件查看对接后结果 | 第55-58页 |
| ·使用Chimera软件步骤 | 第55-56页 |
| ·对较优分子对接结果进行分析 | 第56-58页 |
| ·本章小结 | 第58-59页 |
| 第四章 2-吲哚酮衍生物的合成 | 第59-69页 |
| ·2-吲哚酮-苯并咪唑衍生物的合成分析 | 第59页 |
| ·合成路线的选择 | 第59-60页 |
| ·路线一：分别合成2-吲哚酮和苯并咪畔醛,然后进行羟醛缩合 | 第59-60页 |
| ·路线二：合成2-吲哚酮-3-乙酸后和邻苯二胺反应 | 第60页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第60-61页 |
| ·实验部分 | 第61-65页 |
| ·异亚硝基乙酰间甲苯胺的合成 | 第61-63页 |
| ·异亚硝基乙酰间甲苯胺的合成反应机理 | 第61-62页 |
| ·异亚硝基乙酰间甲苯胺的合成过程 | 第62-63页 |
| ·4-甲基靛红的合成 | 第63-64页 |
| ·4-甲基靛红合成的机理 | 第63页 |
| ·4-甲基靛红的合成过程 | 第63-64页 |
| ·成环方向的确定 | 第64页 |
| ·4-甲基-2-吲哚酮的合成 | 第64-65页 |
| ·4-甲基-2-吲哚酮合成的机理 | 第64页 |
| ·4-甲基-2-吲哚酮的合成过程 | 第64-65页 |
| ·两种吲哚酮衍生物的合成 | 第65-66页 |
| ·2-甲基吲哚-3-乙酸的合成 | 第65页 |
| ·3-(2-苯肼)吲哚-2-酮的合成 | 第65-66页 |
| ·2-吲哚酮-3-乙酸的合成 | 第66页 |
| ·实验结果及讨论 | 第66-69页 |
| ·异亚硝基乙酰间甲苯胺的合成 | 第66-67页 |
| ·反应时间和反应温度对实验的影响 | 第67页 |
| ·4-甲基靛红的合成 | 第67-68页 |
| ·反应过程中原料与浓硫酸的最佳配料比 | 第67页 |
| ·反应条件的的探索 | 第67-68页 |
| ·4-甲基-2-吲哚酮的合成 | 第68-69页 |
| 第五章 苯并咪唑-2-甲醛及其衍生物的合成 | 第69-78页 |
| ·目标产物合成分析 | 第69-70页 |
| ·所用主要仪器和试剂 | 第70-71页 |
| ·苯并咪唑-2-甲醛的合成 | 第71-73页 |
| ·邻苯二胺和乙二醛在KI/I2/K2CO3/H2O体系中反应的合成路线 | 第71页 |
| ·实验原理 | 第71页 |
| ·实验部分 | 第71页 |
| ·邻苯二胺和乙醇酸得到2-羟甲基苯并咪唑然后氧化的合成路线 | 第71-72页 |
| ·2-羟甲基苯并咪唑的合成 | 第71-72页 |
| ·苯并咪唑-2-甲醛的合成 | 第72页 |
| ·邻苯二胺和水合氯醛NA_2SO_4体系中反应的合成路线 | 第72-73页 |
| ·邻苯二胺和2,2-二乙氧基乙酸乙酯反应的合成路线 | 第73页 |
| ·2,2-二乙氧基乙酸乙酯的制备 | 第73页 |
| ·苯并咪唑-2-二乙氧基甲基的合成 | 第73页 |
| ·6-甲基-1H-苯并咪唑-2-甲醛衍生物的合成 | 第73-76页 |
| ·合成路线 | 第74页 |
| ·主要仪器及试剂 | 第74-75页 |
| ·实验部分 | 第75-76页 |
| ·对甲基乙酰苯胺的合成 | 第75页 |
| ·4-甲基-2硝基乙酰苯胺的合成 | 第75页 |
| ·4-甲基-2硝基苯胺的合成 | 第75页 |
| ·4-甲基邻苯二胺的合成 | 第75-76页 |
| ·6-甲基-1H-苯并咪唑-2-甲醇的合成 | 第76页 |
| ·6-甲基-1H-苯并咪唑-2-甲醛的合成 | 第76页 |
| ·邻苯二胺和二氯乙酸在多聚磷酸催化下反应的合成路线 | 第76-77页 |
| ·结果与讨论 | 第77-78页 |
| ·邻苯二胺和乙二醛在KI/I2/K2CO3/H2O体系中的反应 | 第77页 |
| ·邻苯二胺和乙醇酸得到2-羟甲基苯并咪唑然后氧化的合成路线 | 第77-78页 |
| 全文结论与展望 | 第78-80页 |
| 参考文献 | 第80-84页 |
| 附录 | 第84-89页 |
| 致谢 | 第89-90页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第90-91页 |
