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HBK-SPF鸭MHC单倍型筛选及其TAP基因的生物信息学分析

摘要第1-7页
Abstract第7-14页
第一章 引言第14-24页
   ·研究的目的及意义第14页
   ·微卫星 DNA 概述第14-16页
     ·微卫星 DNA 的发现第14-15页
     ·微卫星 DNA 的结构及特点第15页
     ·微卫星 DNA 的分布及起源第15页
     ·微卫星标记在家禽中的应用第15-16页
   ·家禽主要组织相容性复合体概述第16-20页
     ·鸡(Gallus gallus)MHC 的结构第17页
     ·火鸡(Meleagrisg allopavo)MHC 的结构第17-18页
     ·鹌鹑(Coturnix japonica)MHC 的结构第18页
     ·鹅(Anser cygnoides)MHC 的结构第18-19页
     ·鸭(Anas platyrhynchos)MHC 的结构第19页
     ·鸡 MHC 单倍型与抗病性的关系第19-20页
   ·TAP 基因概述第20-22页
     ·人 TAP 基因及转运机制第20-21页
     ·鸡的 TAP 基因及与 MHC 的关系第21-22页
   ·HBK-SPF 鸭第22-24页
     ·种源第22页
     ·病原微生物净化第22-23页
     ·遗传学结构第23-24页
第二章 HBK-SPF 鸭的群体遗传结构分析第24-38页
   ·材料第24-26页
     ·实验动物第24页
     ·主要仪器设备第24页
     ·主要试剂第24-25页
     ·微卫星位点引物第25-26页
   ·实验方法第26-27页
     ·基因组 DNA 的提取第26页
     ·DNA 浓度和纯度的检测第26页
     ·PCR 反应体系第26-27页
     ·PCR 产物的序列测定第27页
     ·数据分析第27页
   ·结果第27-36页
     ·鸭微卫星位点的基因频率第27-30页
     ·Hardy-Weinberg 平衡检验第30-31页
     ·群体内遗传变异参数第31-32页
     ·群体间在世代间遗传变异分析第32-36页
   ·讨论第36-38页
     ·群体内的遗传变异第36页
     ·群体间的遗传变异第36页
     ·与传统饲养方式鸭的遗传多样性差异第36-38页
第三章 鸭 MHC I 区域多态性位点筛选及不同单倍型鸭分群第38-47页
   ·材料第38页
     ·实验动物第38页
     ·主要试剂第38页
   ·实验方法第38-41页
     ·基因组 DNA 的提取第38页
     ·多态性位点分析和引物设计第38-39页
     ·PCR 反应体系及反应条件第39-40页
     ·单链构象多态性(SSCP)检测第40页
     ·序列分析第40-41页
     ·A 位点多态性分析第41页
     ·单倍型鸭种群的建立第41页
   ·结果第41-46页
     ·重复结构的 PCR 扩增结果第41-42页
     ·SSCP 分析结果第42-43页
     ·推测多态性位点的分析结果第43-46页
   ·讨论第46-47页
第四章 不同单倍型鸭 TAP 基因结构及生物信息学分析第47-56页
   ·材料与方法第47-48页
     ·实验动物第47页
     ·主要试剂第47页
     ·引物设计第47页
     ·反应体系及反应条件第47-48页
     ·数据分析第48页
   ·结果第48-54页
     ·PCR 扩增结果第48-50页
     ·核苷酸同源性分析第50页
     ·氨基酸同源性分析第50-51页
     ·编码区结构预测第51-54页
   ·讨论第54-56页
第五章 MHC 单倍型鸭鸭疫里默氏杆菌和 I 型鸭肝炎病毒感染试验第56-62页
   ·材料与方法第56-59页
     ·实验动物第56页
     ·主要试剂第56页
     ·主要仪器第56页
     ·不同单倍型鸭对鸭疫里默氏杆菌的感染试验第56-57页
     ·不同单倍型鸭 I 型鸭肝炎病毒的感染试验第57-59页
   ·实验结果第59-61页
     ·鸭疫里默氏杆菌感染试验结果第59页
     ·I 型鸭肝炎感染试验结果第59-61页
   ·讨论第61-62页
第六章 全文结论第62-63页
参考文献第63-70页
致谢第70-71页
作者简介第71页

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