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细菌多糖和糖蛋白生物合成途径及相关酶类研究

中文摘要第1-16页
ABSTRACT第16-20页
符号说明第20-22页
第一章 绪论第22-50页
   ·糖基转移酶与寡糖的合成第23-31页
     ·分类和机理第24-26页
     ·糖核苷酸供体及其生物合成第26-29页
     ·寡糖的酶法合成第29-31页
   ·细菌细胞表面多糖第31-40页
     ·细菌多糖的分类第32-33页
     ·细菌多糖疫苗第33-35页
     ·细菌多糖的生物合成第35-38页
     ·大肠杆菌O86第38-40页
   ·糖蛋白的合成-N糖基化第40-45页
     ·真核生物蛋白质N-糖基化途径与OST第41-42页
     ·细菌蛋白质N-糖基化途径与PglB第42-45页
   ·生物芯片与糖阵列第45-47页
   ·论文内容大纲第47-50页
第二章 大肠杆菌双功能UDP-GlcNAc/Glc 4-位差向异构酶研究第50-64页
   ·材料与方法第50-54页
     ·材料与菌种第50页
     ·基因克隆及表达载体的构建第50-51页
     ·目的蛋白的表达与纯化第51-52页
     ·分子筛层析确定Gne蛋白多聚体状态第52-53页
     ·圆二色谱分析Gne及其突变体S306Y的二级结构变化第53页
     ·Gne蛋白酶活和理化特性测定第53页
     ·Gne蛋白和突变体动力学研究第53-54页
   ·结果与分析第54-62页
     ·Gne序列分析第54-55页
     ·蛋白表达与纯化第55-56页
     ·Gne活性和理化性质第56-57页
     ·Gne是双功能酶第57-59页
     ·氨基酸S306决定Gne底物特异性第59-62页
   ·讨论与总结第62-64页
第三章 高通量糖基转移酶活性鉴定第64-84页
   ·材料与方法第66-74页
     ·材料第66页
     ·菌种、DNA、质粒与培养条件第66-67页
     ·糖基转移酶的克隆与质粒制备第67-69页
     ·糖基转移酶体外表达与检测第69-70页
     ·糖受体阵列制备第70-73页
     ·高通量酶活鉴定第73-74页
     ·体内蛋白表达与纯化第74页
     ·寡糖合成与结构鉴定第74页
   ·结果与分析第74-82页
     ·糖基转移酶的选择与克隆第74-75页
     ·体外表达糖基转移酶第75-78页
     ·高通量鉴定糖基转移酶活性第78-80页
     ·体内表达糖基转移酶第80页
     ·寡糖合成与结构鉴定第80-82页
   ·讨论与总结第82-84页
第四章 O-多糖体外生物合成-Wzy与Wzz功能探讨第84-104页
   ·材料与方法第85-92页
     ·材料与菌种第85页
     ·糖基转移酶的表达纯化第85-86页
     ·LPS电泳分析第86-87页
     ·构建E. coli O86:B7 (?)wecA (?)waaL第87-88页
     ·Wzy序列优化、克隆表达与纯化第88-90页
     ·两种Wzz的表达纯化第90页
     ·GalNAc-PP-Lipid底物化学合成第90页
     ·酶法合成RU-PP-Lipid底物第90-91页
     ·体外Wzy聚合反应以及有Wzz参与的聚合反应第91-92页
   ·结果与分析第92-101页
     ·GalNAc-PP-Lipids化学合成与RU-PP-Lipids酶法合成第92-94页
     ·Wzy体内为多糖聚合酶第94-95页
     ·Wzy克隆、表达与纯化第95-97页
     ·Wzy体外聚合O-PS重复单位第97-99页
     ·Wzz控制O-PS聚合长度第99页
     ·Wzy对底物脂链部分的具有松弛的特异性第99-101页
   ·讨论与总结第101-104页
第五章 细菌寡糖基转移酶PglB的理化性质研究第104-118页
   ·材料与方法第104-109页
     ·材料与菌种第104-105页
     ·PglB表达载体构建第105页
     ·PglB过量表达与纯化第105-106页
     ·蛋白圆二色谱分析第106页
     ·GalNAc-PP-Und和GalNAc-PP-pentaprenyl的化学制备第106页
     ·PglB活性测定第106-107页
     ·拓扑学结构测定方法第107-109页
   ·结果与分析第109-115页
     ·PglB过量表达与纯化第109-110页
     ·重组PglB折叠正确第110-111页
     ·重组PglB具有转糖基活性第111-113页
     ·PglB拓扑学结构与STT3相似第113-115页
   ·讨论与总结第115-118页
全文总结第118-120页
附录与附图第120-152页
 Ⅰ. LIC克隆糖基转移酶所用的引物与模板第121-124页
 Ⅱ. 高通量酶活鉴定所得MALDI-TOF/MS结果第124-126页
 Ⅲ. 四种种蛋白纯化图第126-127页
 Ⅳ. 四种寡糖的NMR图谱第127-139页
 Ⅴ. 六种GalNAc-PP-Lipids结构和NMR、MS鉴定第139-142页
 Ⅵ. 2-AB标记的E. coli O86RU-PP-Und合成中间体的MALDI-MS图第142-144页
 Ⅶ. 所有E.coli O86RU-PP-Lipids的ESI-MS图第144-146页
 Ⅷ. Wzy蛋白的nano-LC/MS/MS分析第146-149页
 Ⅸ. PglB蛋白的nano-LC/MS/MS分析第149-152页
参考文献第152-166页
致谢第166-168页
攻读学位期间发表的学术论文第168-172页
外文论文第172-174页
发表论文第174-195页
学位论文评阅及答辩情况表第195页

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